More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1228 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1228  ABC transporter related  100 
 
 
257 aa  522  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000178729 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1155  ABC transporter related  93.33 
 
 
256 aa  463  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0959835  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0105  ABC transporter related protein  73.73 
 
 
286 aa  370  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750026  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3016  ABC transporter related  73.31 
 
 
260 aa  368  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1975  ABC transporter related protein  67.32 
 
 
279 aa  360  1e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3206  ABC transporter related protein  72.46 
 
 
290 aa  360  1e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404801  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2206  ABC transporter related  71.07 
 
 
271 aa  358  6e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1185  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  69.58 
 
 
280 aa  355  3.9999999999999996e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0567598  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3155  ABC transporter related protein  68.15 
 
 
289 aa  352  4e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2891  ABC transporter related protein  65.77 
 
 
284 aa  350  1e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0988  ABC transporter-like  52.16 
 
 
247 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0162069  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4895  ABC transporter related protein  54.94 
 
 
243 aa  259  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1274  ABC transporter related  53.1 
 
 
237 aa  252  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0660  ABC transporter related protein  52.32 
 
 
245 aa  253  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4170  ABC transporter related  51.5 
 
 
245 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2163  ABC transporter related  51.04 
 
 
276 aa  252  4.0000000000000004e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1520  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  50.83 
 
 
277 aa  252  5.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0884  ABC transporter-like protein protein  54.31 
 
 
242 aa  250  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3969  ABC transporter related protein  52.16 
 
 
249 aa  248  5e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1421  ABC transporter related  51.07 
 
 
235 aa  246  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0815  ATPase  50.21 
 
 
243 aa  244  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0745  ABC transporter related  53.19 
 
 
245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0716  ABC transporter related  53.19 
 
 
245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0924  ABC transporter related  50.41 
 
 
241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.359133  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3930  ABC transporter related  51.15 
 
 
236 aa  238  5.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2925  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  49.38 
 
 
236 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1570  ABC transporter related  49.38 
 
 
236 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755782  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3135  ABC transporter related  48.71 
 
 
242 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1145  ABC transporter related  44.4 
 
 
249 aa  218  6e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.457841  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0600  ABC transporter related  47.21 
 
 
234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  47.66 
 
 
237 aa  210  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  45.58 
 
 
233 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  45.57 
 
 
241 aa  208  8e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.58 
 
 
233 aa  207  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  44.3 
 
 
233 aa  207  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  45.37 
 
 
235 aa  205  6e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1737  ABC transporter related protein  49.79 
 
 
234 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.78 
 
 
251 aa  202  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.760616  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4467  ABC transporter related  46.58 
 
 
242 aa  202  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  43.83 
 
 
238 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  46.05 
 
 
235 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0093  ABC transporter related  45.22 
 
 
252 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.899173  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  43.4 
 
 
238 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  43.4 
 
 
238 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2963  ABC transporter related  45.65 
 
 
251 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0092  ABC transporter related  45.65 
 
 
251 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.4 
 
 
238 aa  201  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0027  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.33 
 
 
254 aa  201  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  41.41 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  43.4 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  43.4 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3089  ABC transporter related protein  49.36 
 
 
234 aa  201  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1244  ABC transporter-like  45.13 
 
 
233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0109  ABC transporter related  45.22 
 
 
251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  45.15 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0092  ABC transporter related  46.22 
 
 
251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.65269  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  43.4 
 
 
238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  43.03 
 
 
247 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1520  ABC transporter related  43.25 
 
 
270 aa  199  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3361  ABC transporter related  43.93 
 
 
247 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280372  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.93 
 
 
238 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.93 
 
 
238 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.93 
 
 
238 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3906  ABC transporter related  44.89 
 
 
250 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.93 
 
 
238 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.93 
 
 
238 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2095  ABC transporter related  47.88 
 
 
276 aa  199  3e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.156364  normal  0.0133806 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0083  ABC transporter related  45.33 
 
 
252 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  43.93 
 
 
238 aa  199  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  43.64 
 
 
239 aa  199  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.93 
 
 
238 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1444  ABC transporter related  44.68 
 
 
237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1980  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  43.72 
 
 
240 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.681741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  42.62 
 
 
247 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  45.12 
 
 
234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  42.62 
 
 
247 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  44.87 
 
 
237 aa  199  5e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1566  ABC transporter related  45.3 
 
 
234 aa  199  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  42.74 
 
 
234 aa  199  5e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4099  ABC transporter related  44.44 
 
 
251 aa  198  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.51 
 
 
238 aa  198  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  44.21 
 
 
233 aa  198  6e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01742  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  43.1 
 
 
247 aa  198  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.823741  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.7 
 
 
234 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  42.86 
 
 
239 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4524  ABC transporter related  42.68 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180068  normal  0.792034 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  43.51 
 
 
238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  45.21 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4656  ABC transporter related  42.68 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114918 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1819  ABC transporter related  45.05 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  43.83 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  44.02 
 
 
237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  44.73 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  46.61 
 
 
242 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  45.3 
 
 
238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  42.67 
 
 
235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  44.87 
 
 
238 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  44.87 
 
 
238 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  46.61 
 
 
242 aa  196  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>