More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4467 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4467  ABC transporter related  100 
 
 		 242 aa  477  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1826  ABC transporter related  63.03 
 
 		 239 aa  310  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.514017  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6245  ABC transporter related  60.5 
 
 		 239 aa  288  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.284693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6414  ABC transporter related  60.5 
 
 		 239 aa  288  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0209306  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6647  ABC transporter related  60.5 
 
 		 239 aa  288  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3388  ABC transporter related  59.24 
 
 		 239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1185  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  49.34 
 
 		 280 aa  215  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0567598  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0660  ABC transporter related protein  46.89 
 
 		 245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4895  ABC transporter related protein  46.35 
 
 		 243 aa  206  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3155  ABC transporter related protein  46.09 
 
 		 289 aa  205  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1155  ABC transporter related  46.58 
 
 		 256 aa  205  5e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0959835  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3206  ABC transporter related protein  46.58 
 
 		 290 aa  204  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404801  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1228  ABC transporter related  46.58 
 
 		 257 aa  202  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000178729 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2206  ABC transporter related  50.22 
 
 		 271 aa  202  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0988  ABC transporter-like  42.31 
 
 		 247 aa  201  9e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0162069  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1274  ABC transporter related  44.4 
 
 		 237 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2163  ABC transporter related  44.83 
 
 		 276 aa  199  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1975  ABC transporter related protein  49.78 
 
 		 279 aa  199  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3969  ABC transporter related protein  44.73 
 
 		 249 aa  199  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  47.53 
 
 		 242 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0924  ABC transporter related  44.4 
 
 		 241 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.359133  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1145  ABC transporter related  45.19 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.457841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2891  ABC transporter related protein  45.8 
 
 		 284 aa  195  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.05 
 
 		 235 aa  195  5.000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2212  ABC transporter, ATPase subunit  43.64 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.618749 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2925  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.97 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  43.5 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1570  ABC transporter related  43.97 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755782  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3930  ABC transporter related  44.35 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3016  ABC transporter related  47.21 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3326  ABC transporter related  42.98 
 
 		 244 aa  192  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0105  ABC transporter related protein  47.58 
 
 		 286 aa  191  9e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750026  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  43.95 
 
 		 239 aa  191  9e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  44.25 
 
 		 240 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2614  ABC transporter related  44.02 
 
 		 247 aa  190  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796579  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  43.35 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  43.24 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4170  ABC transporter related  42.55 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  42.92 
 
 		 247 aa  189  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  43.81 
 
 		 259 aa  188  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3069  ABC transporter related  43.35 
 
 		 247 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.986829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3903  ABC transporter related  42.98 
 
 		 257 aa  188  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.784547  normal  0.979503 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  42.79 
 
 		 233 aa  188  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1743  ABC transporter related  41.23 
 
 		 258 aa  188  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0545  ABC transporter related  44.49 
 
 		 234 aa  188  8e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.699298  hitchhiker  0.000807716 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  39.65 
 
 		 237 aa  188  8e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  42.92 
 
 		 247 aa  187  9e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  44.95 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3325  ABC transporter related  42.98 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3512  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.98 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  42.92 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4333  ABC transporter related  41.49 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.175987  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5433  ABC transporter related  40.79 
 
 		 258 aa  186  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  43.22 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1976  ABC transporter related  43.64 
 
 		 286 aa  186  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.34 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  42.34 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  42.34 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2013  ABC transporter related  41.7 
 
 		 235 aa  186  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 		 233 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  43.16 
 
 		 233 aa  186  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  42.34 
 
 		 233 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  43.95 
 
 		 235 aa  186  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  42.31 
 
 		 249 aa  186  4e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  42.34 
 
 		 233 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.85 
 
 		 234 aa  185  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  43.38 
 
 		 264 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1776  ABC transporter related  41.84 
 
 		 244 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  39.08 
 
 		 236 aa  185  6e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  40.68 
 
 		 235 aa  185  7e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0329  ABC transporter related  40.6 
 
 		 230 aa  184  8e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.287188  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2252  ABC transporter related  42.98 
 
 		 265 aa  184  9e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.54606 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0815  ATPase  43.33 
 
 		 243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1520  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  42.24 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.71 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1722  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  43.22 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0884  ABC transporter-like protein protein  41.35 
 
 		 242 aa  183  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  41.89 
 
 		 233 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  44.8 
 
 		 247 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  44.8 
 
 		 247 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  41.45 
 
 		 238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  41.15 
 
 		 239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0889  ABC transporter related  42.55 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  44.55 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2394  ABC transporter related  42.11 
 
 		 241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805678  normal  0.040758 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  44.96 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1115  ABC transporter related  42.17 
 
 		 248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000583905  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3933  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40 
 
 		 233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1774  ABC transporter related  47.08 
 
 		 243 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000270769 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0565  ABC transporter related  42.04 
 
 		 238 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1617  ABC transporter related  41.77 
 
 		 234 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  42.79 
 
 		 233 aa  182  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  44.8 
 
 		 247 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  42.04 
 
 		 239 aa  182  6e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0261  ABC transporter related protein  40 
 
 		 237 aa  181  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  40.27 
 
 		 233 aa  181  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3735  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40 
 
 		 237 aa  181  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>