More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3388 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3388  ABC transporter related  100 
 
 		 239 aa  474  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6245  ABC transporter related  96.23 
 
 		 239 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.284693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6414  ABC transporter related  96.23 
 
 		 239 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0209306  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6647  ABC transporter related  96.23 
 
 		 239 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1826  ABC transporter related  62.34 
 
 		 239 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.514017  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4467  ABC transporter related  59.24 
 
 		 242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0660  ABC transporter related protein  49.16 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1185  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  47.23 
 
 		 280 aa  206  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0567598  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3155  ABC transporter related protein  48.94 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4895  ABC transporter related protein  48.31 
 
 		 243 aa  203  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3969  ABC transporter related protein  45.34 
 
 		 249 aa  196  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0815  ATPase  46.38 
 
 		 243 aa  196  4.0000000000000005e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3206  ABC transporter related protein  45.53 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404801  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0988  ABC transporter-like  44.77 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0162069  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1975  ABC transporter related protein  47.83 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2163  ABC transporter related  45.3 
 
 		 276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1228  ABC transporter related  45.61 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000178729 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1274  ABC transporter related  45.11 
 
 		 237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3016  ABC transporter related  48.05 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.53 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1145  ABC transporter related  44.74 
 
 		 249 aa  186  3e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.457841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1155  ABC transporter related  43.93 
 
 		 256 aa  186  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0959835  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4056  ABC transporter related  44.08 
 
 		 240 aa  185  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  43.83 
 
 		 233 aa  185  6e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1520  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  44.44 
 
 		 277 aa  185  7e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  45.96 
 
 		 233 aa  185  7e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0105  ABC transporter related protein  46.81 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750026  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4170  ABC transporter related  42.13 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1421  ABC transporter related  44.92 
 
 		 235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  42.02 
 
 		 234 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1737  ABC transporter related protein  48.1 
 
 		 234 aa  182  6e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1498  ABC transporter related  44.07 
 
 		 235 aa  181  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3751  ABC transporter related  42.8 
 
 		 234 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2925  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.77 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1570  ABC transporter related  44.77 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755782  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0924  ABC transporter related  45.99 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.359133  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2891  ABC transporter related protein  45.26 
 
 		 284 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  41.87 
 
 		 240 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.23 
 
 		 233 aa  178  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2888  high-affinity branched-chain amino acid transport protein (ABC transporter ATP-binding protein)  45.34 
 
 		 234 aa  178  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal  0.0641084 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2206  ABC transporter related  46.75 
 
 		 271 aa  178  8e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.37 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1980  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  43.64 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.681741 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  41.46 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1976  ABC transporter related  42.62 
 
 		 286 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  41.35 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  40.76 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4102  ABC transporter related  43.67 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1852  ABC transporter related  42.55 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231349  normal  0.204249 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  41.2 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  43.46 
 
 		 243 aa  176  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0490  ABC transporter related  45.19 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0438645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1134  ABC transporter related  44.21 
 
 		 243 aa  176  4e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.767247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2095  ABC transporter related  48.07 
 
 		 276 aa  176  4e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.156364  normal  0.0133806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  41.49 
 
 		 237 aa  176  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1102  ABC transporter related  45.34 
 
 		 235 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.0079799  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  41.25 
 
 		 247 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3089  ABC transporter related protein  48.54 
 
 		 234 aa  175  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  39.42 
 
 		 238 aa  175  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3930  ABC transporter related  44.49 
 
 		 236 aa  175  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 237 aa  175  5e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  41.77 
 
 		 234 aa  175  6e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0614  ABC transporter related  43.24 
 
 		 231 aa  175  6e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1617  ABC transporter related  43.64 
 
 		 234 aa  175  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  39.38 
 
 		 236 aa  175  7e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1544  ABC transporter related  49.58 
 
 		 238 aa  175  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 		 247 aa  174  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0884  ABC transporter-like protein protein  43.51 
 
 		 242 aa  174  8e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3709  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.73 
 
 		 244 aa  174  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  41.49 
 
 		 247 aa  174  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  41.95 
 
 		 240 aa  174  9e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0314  ABC transporter related  42.02 
 
 		 234 aa  174  9e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  40.83 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0191  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.42 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.148253  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3616  ABC transporter related  42.8 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.537996 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4057  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.42 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1654  ABC transporter related  42.55 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.611887 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0912  ABC transporter related  40.73 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  42.42 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  43.52 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3555  ABC transporter related  42.98 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.651056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  38.15 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0999  ABC transporter related  45.26 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1851  ABC transporter related  43.22 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0531443  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  41.1 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2963  ABC transporter related  42.11 
 
 		 251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  39.57 
 
 		 249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0092  ABC transporter related  42.11 
 
 		 251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0545  ABC transporter related  41.25 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.699298  hitchhiker  0.000807716 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2130  ABC transporter related  44.49 
 
 		 235 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.188417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  39.84 
 
 		 240 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3690  ABC transporter-related protein  42.13 
 
 		 249 aa  172  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.38 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0338  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.19 
 
 		 235 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3361  ABC transporter related  42.28 
 
 		 247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280372  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  40.25 
 
 		 260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  43.12 
 
 		 258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  42.67 
 
 		 235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  42.67 
 
 		 234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1600  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.98 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>