More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0314 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0314  ABC transporter related  100 
 
 		 234 aa  471  1e-132  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1807  ABC transporter related  83.19 
 
 		 233 aa  393  1e-108  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.820748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1501  ABC transporter related  64.66 
 
 		 233 aa  310  7.999999999999999e-84  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.196054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0823  ABC transporter related  63.79 
 
 		 235 aa  299  2e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0503  ABC transporter related  47.28 
 
 		 242 aa  208  4e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.372423 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1774  ABC transporter related  46.86 
 
 		 243 aa  208  5e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000270769 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0599  ABC transporter related  47.81 
 
 		 238 aa  208  6e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1702  ABC transporter related  46.86 
 
 		 267 aa  204  9e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.411618 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1586  ABC transporter related  46.03 
 
 		 242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1274  ABC transporter related  39.04 
 
 		 237 aa  183  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  43.59 
 
 		 233 aa  180  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  40.52 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2163  ABC transporter related  38.77 
 
 		 276 aa  179  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  41.38 
 
 		 233 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3089  ABC transporter related protein  42.24 
 
 		 234 aa  177  9e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1520  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  38.77 
 
 		 277 aa  176  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.95 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  38.46 
 
 		 234 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  40.09 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.52 
 
 		 233 aa  175  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1489  ABC transporter related protein  43.35 
 
 		 251 aa  174  9e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0988  ABC transporter-like  39.91 
 
 		 247 aa  174  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0162069  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0815  ATPase  41.33 
 
 		 243 aa  174  9e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3388  ABC transporter related  42.02 
 
 		 239 aa  174  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  39.22 
 
 		 233 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6414  ABC transporter related  42.44 
 
 		 239 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0209306  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6647  ABC transporter related  42.44 
 
 		 239 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6245  ABC transporter related  42.44 
 
 		 239 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.284693  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1975  ABC transporter related protein  40.26 
 
 		 279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1185  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  40.52 
 
 		 280 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0567598  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0545  ABC transporter related  41.23 
 
 		 234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.699298  hitchhiker  0.000807716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  39.66 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1155  ABC transporter related  38.63 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0959835  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.22 
 
 		 233 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1228  ABC transporter related  38.2 
 
 		 257 aa  171  9e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000178729 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  38.63 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  39.22 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0329  ABC transporter related  39.06 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.287188  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  39.22 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3586  ABC transporter related  42.06 
 
 		 254 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0486614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  39.22 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2206  ABC transporter related  40.09 
 
 		 271 aa  170  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3930  ABC transporter related  36.73 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  39.22 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2532  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.06 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  38.03 
 
 		 234 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1722  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.71 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  41.41 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5320  ABC transporter related  41.63 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3206  ABC transporter related protein  38.2 
 
 		 290 aa  169  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404801  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6114  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.6 
 
 		 245 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579004  normal  0.282799 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1980  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  42.73 
 
 		 240 aa  168  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.681741 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  39.22 
 
 		 233 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2252  ABC transporter related  42.34 
 
 		 265 aa  169  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.54606 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  38.79 
 
 		 233 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  37.5 
 
 		 236 aa  168  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1115  ABC transporter related  40.71 
 
 		 248 aa  168  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000583905  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5326  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.17 
 
 		 243 aa  167  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  38.36 
 
 		 233 aa  167  9e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03303  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  40.09 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0261  ABC transporter related protein  40.09 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.09 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0745  ABC transporter related  40.52 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4895  ABC transporter related protein  41.63 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  37.5 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0716  ABC transporter related  40.52 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03256  hypothetical protein  40.09 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3735  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.09 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3933  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.09 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4770  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.09 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1145  ABC transporter related  39.21 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.457841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0884  ABC transporter-like protein protein  40.35 
 
 		 242 aa  167  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.34 
 
 		 233 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3652  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.09 
 
 		 233 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4333  ABC transporter related  41.28 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.175987  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1776  ABC transporter related  41.05 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3960  ABC transporter related  41.15 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3934  ABC transporter related  41.2 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  38.36 
 
 		 233 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0262  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.09 
 
 		 237 aa  166  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2917  ABC transporter related  39.06 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3903  ABC transporter related  40.09 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.784547  normal  0.979503 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3199  ABC transporter-related protein  37.5 
 
 		 234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  40.34 
 
 		 233 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4170  ABC transporter related  40.44 
 
 		 245 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2614  ABC transporter related  41.05 
 
 		 247 aa  165  5e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796579  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.66 
 
 		 237 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.66 
 
 		 237 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.66 
 
 		 237 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.66 
 
 		 237 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3684  ABC transporter related  41.05 
 
 		 246 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.66 
 
 		 237 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  38.89 
 
 		 233 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1976  ABC transporter related  40.26 
 
 		 286 aa  165  6.9999999999999995e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1743  ABC transporter related  40.09 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3155  ABC transporter related protein  38.96 
 
 		 289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  38.6 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2925  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  37.12 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  36.71 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>