More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1980 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1980  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  100 
 
 		 240 aa  471  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.681741 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0815  ATPase  48.09 
 
 		 243 aa  209  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0660  ABC transporter related protein  47.41 
 
 		 245 aa  206  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1185  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  46.12 
 
 		 280 aa  205  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0567598  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3969  ABC transporter related protein  46.98 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3155  ABC transporter related protein  45.81 
 
 		 289 aa  203  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1155  ABC transporter related  42.86 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0959835  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1228  ABC transporter related  43.72 
 
 		 257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000178729 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3016  ABC transporter related  43.72 
 
 		 260 aa  198  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1975  ABC transporter related protein  45.13 
 
 		 279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2206  ABC transporter related  47.14 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4895  ABC transporter related protein  45.06 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4170  ABC transporter related  42.19 
 
 		 245 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0105  ABC transporter related protein  42.73 
 
 		 286 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750026  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2891  ABC transporter related protein  42.98 
 
 		 284 aa  189  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3135  ABC transporter related  42.13 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0988  ABC transporter-like  42.19 
 
 		 247 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0162069  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1421  ABC transporter related  41.1 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1737  ABC transporter related protein  45.69 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3206  ABC transporter related protein  43.86 
 
 		 290 aa  185  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404801  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1826  ABC transporter related  44.26 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.514017  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0884  ABC transporter-like protein protein  42.92 
 
 		 242 aa  182  5.0000000000000004e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1520  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  42.29 
 
 		 277 aa  180  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4467  ABC transporter related  44.86 
 
 		 242 aa  179  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0716  ABC transporter related  41.7 
 
 		 245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0745  ABC transporter related  41.7 
 
 		 245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0329  ABC transporter related  42.06 
 
 		 230 aa  177  9e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.287188  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6245  ABC transporter related  44.07 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.284693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6414  ABC transporter related  44.07 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0209306  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3388  ABC transporter related  43.64 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6647  ABC transporter related  44.07 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2925  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.68 
 
 		 236 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0600  ABC transporter related  43.97 
 
 		 234 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1570  ABC transporter related  40.68 
 
 		 236 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755782  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1145  ABC transporter related  41 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.457841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1274  ABC transporter related  41.35 
 
 		 237 aa  176  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2163  ABC transporter related  40.53 
 
 		 276 aa  175  6e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3930  ABC transporter related  41.81 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1093  ABC transporter related  42.61 
 
 		 555 aa  172  5.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.403079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6114  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.42 
 
 		 245 aa  171  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579004  normal  0.282799 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3089  ABC transporter related protein  44.73 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3690  ABC transporter-related protein  40.74 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0504  ABC transporter related  44.21 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  41.6 
 
 		 238 aa  169  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0924  ABC transporter related  39.41 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.359133  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0223  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.31 
 
 		 241 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0851652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0314  ABC transporter related  42.73 
 
 		 234 aa  168  6e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  42.31 
 
 		 234 aa  168  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1807  ABC transporter related  42.86 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.820748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  42.98 
 
 		 240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1489  ABC transporter related protein  41.45 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2095  ABC transporter related  42.98 
 
 		 276 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.156364  normal  0.0133806 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  41.18 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1507  ABC transporter related  42.26 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3835  ABC transporter related  42.44 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.554718  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1654  ABC transporter related protein  41.56 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.10025  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3960  ABC transporter related  42.86 
 
 		 235 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  41.18 
 
 		 240 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  41.26 
 
 		 234 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  43.16 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.75 
 
 		 235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1498  ABC transporter related  40.77 
 
 		 235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0823  ABC transporter related  40.17 
 
 		 235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1580  ABC transporter related  39.22 
 
 		 237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0266  ABC transporter related  42.02 
 
 		 249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  43.32 
 
 		 236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  41.74 
 
 		 239 aa  162  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4486  ABC transporter related  38.63 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.064197  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  41.94 
 
 		 233 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3555  ABC transporter related  42.42 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.651056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0683  ABC transporter related protein  39.41 
 
 		 244 aa  161  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000101053  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  41.88 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0803  ABC transporter related  43.28 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0310  ABC transporter related  39.74 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327886  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  40.17 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.77 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3843  ABC transporter related  41.56 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.434627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  42.19 
 
 		 234 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  39.5 
 
 		 240 aa  159  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  38.33 
 
 		 233 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  41.55 
 
 		 238 aa  159  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2264  ABC transporter related  40.77 
 
 		 234 aa  158  7e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0714908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7593  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.8 
 
 		 240 aa  158  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  41.28 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.54 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  40.28 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  39.5 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1852  ABC transporter related  38.82 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231349  normal  0.204249 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1501  ABC transporter related  41.15 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.196054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1102  ABC transporter related  40.85 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.0079799  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0799  ABC transporter related  42.31 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0092  ABC transporter related  42.67 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.65269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0889  ABC transporter related  41.38 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2267  ABC transporter related  39.5 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00164993 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  39.73 
 
 		 258 aa  156  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1952  ABC transporter related  36.05 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.571715  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1654  ABC transporter related  40.08 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.611887 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  38.66 
 
 		 240 aa  156  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0027  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.69 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1544  ABC transporter related  44.87 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>