More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2095 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2095  ABC transporter related  100 
 
 		 276 aa  545  1e-154  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.156364  normal  0.0133806 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1737  ABC transporter related protein  75.54 
 
 		 234 aa  334  7.999999999999999e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3089  ABC transporter related protein  73.82 
 
 		 234 aa  328  4e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1421  ABC transporter related  54.7 
 
 		 235 aa  255  7e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1145  ABC transporter related  52.63 
 
 		 249 aa  250  2e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.457841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3930  ABC transporter related  52.21 
 
 		 236 aa  244  9e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1520  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  53.3 
 
 		 277 aa  244  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1185  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  50 
 
 		 280 aa  240  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0567598  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0988  ABC transporter-like  51.5 
 
 		 247 aa  239  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0162069  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3206  ABC transporter related protein  47.69 
 
 		 290 aa  238  6.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404801  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1274  ABC transporter related  52.19 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2925  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50.22 
 
 		 236 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0924  ABC transporter related  50.22 
 
 		 241 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.359133  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1570  ABC transporter related  50.22 
 
 		 236 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755782  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3135  ABC transporter related  55.79 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2163  ABC transporter related  51.54 
 
 		 276 aa  235  5.0000000000000005e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3016  ABC transporter related  50.64 
 
 		 260 aa  233  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3155  ABC transporter related protein  43.97 
 
 		 289 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4170  ABC transporter related  50.64 
 
 		 245 aa  228  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3969  ABC transporter related protein  52.36 
 
 		 249 aa  226  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1228  ABC transporter related  47.88 
 
 		 257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000178729 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.01 
 
 		 236 aa  222  6e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  45.96 
 
 		 236 aa  222  6e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0600  ABC transporter related  52.79 
 
 		 234 aa  221  7e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0716  ABC transporter related  54.74 
 
 		 245 aa  221  9e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0745  ABC transporter related  54.74 
 
 		 245 aa  221  9e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2891  ABC transporter related protein  48.72 
 
 		 284 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1975  ABC transporter related protein  46.8 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0660  ABC transporter related protein  51.49 
 
 		 245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0884  ABC transporter-like protein protein  49.79 
 
 		 242 aa  219  5e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4895  ABC transporter related protein  52.56 
 
 		 243 aa  217  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  47.84 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0310  ABC transporter related  46.78 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327886  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  45.96 
 
 		 258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0105  ABC transporter related protein  43.06 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750026  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  48.28 
 
 		 234 aa  215  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0815  ATPase  50.21 
 
 		 243 aa  215  7e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.92 
 
 		 235 aa  214  9.999999999999999e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  45.06 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  45.34 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0108  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.92 
 
 		 233 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.78 
 
 		 233 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  45.92 
 
 		 233 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.92 
 
 		 233 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0102  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.06 
 
 		 233 aa  210  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  46.78 
 
 		 233 aa  210  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.78 
 
 		 233 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  46.35 
 
 		 233 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2917  ABC transporter related  44.87 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.49 
 
 		 233 aa  209  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  45.73 
 
 		 249 aa  209  3e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3498  ABC transporter related  46.19 
 
 		 236 aa  209  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  45.92 
 
 		 233 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  45.34 
 
 		 259 aa  209  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  46.84 
 
 		 257 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  45.92 
 
 		 233 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  46.38 
 
 		 243 aa  209  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  45.61 
 
 		 239 aa  209  5e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  45.92 
 
 		 233 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  45.3 
 
 		 235 aa  209  5e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1155  ABC transporter related  44.87 
 
 		 256 aa  209  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0959835  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  45.92 
 
 		 233 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0383  ABC transporter related  45.06 
 
 		 241 aa  209  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4055  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.49 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3751  ABC transporter related  45.92 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0223  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.44 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0851652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1482  ABC transporter related  47.44 
 
 		 234 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  47.01 
 
 		 233 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  47.23 
 
 		 237 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.3 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  45.49 
 
 		 234 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1426  ABC transporter related  44.77 
 
 		 249 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.26 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  46.35 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1908  ABC transporter related  46.78 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.240732 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.26 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.26 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  45.49 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  42.55 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.26 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.26 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 		 234 aa  206  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 		 234 aa  206  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  44.02 
 
 		 237 aa  206  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  46.38 
 
 		 238 aa  206  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.98 
 
 		 238 aa  205  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2206  ABC transporter related  46.81 
 
 		 271 aa  206  5e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  42.55 
 
 		 238 aa  205  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3970  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.49 
 
 		 233 aa  205  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.394941  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3664  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.49 
 
 		 233 aa  205  7e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  46.15 
 
 		 256 aa  205  8e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  42.55 
 
 		 238 aa  204  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0248  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.49 
 
 		 233 aa  204  9e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  45.49 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  46.35 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  45.19 
 
 		 247 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  45.92 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  47.84 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1617  ABC transporter related  46.35 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  45.19 
 
 		 247 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>