More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1774 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1774  ABC transporter related  100 
 
 		 243 aa  481  1e-135  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000270769 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1586  ABC transporter related  82.16 
 
 		 242 aa  409  1e-113  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0503  ABC transporter related  81.25 
 
 		 242 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.372423 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1702  ABC transporter related  81.67 
 
 		 267 aa  401  1e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.411618 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1807  ABC transporter related  49.37 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.820748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1501  ABC transporter related  47.7 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.196054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0599  ABC transporter related  46.86 
 
 		 238 aa  209  2e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0314  ABC transporter related  46.86 
 
 		 234 aa  208  6e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1580  ABC transporter related  46.03 
 
 		 237 aa  202  3e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  46.32 
 
 		 240 aa  202  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  46.86 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  46.69 
 
 		 239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  45 
 
 		 233 aa  198  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  46.03 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0545  ABC transporter related  46.03 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.699298  hitchhiker  0.000807716 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  44.17 
 
 		 233 aa  195  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  45.42 
 
 		 233 aa  194  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  43.75 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  45.49 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  46.44 
 
 		 234 aa  194  2e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  44.58 
 
 		 233 aa  192  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  44.17 
 
 		 233 aa  192  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1115  ABC transporter related  44.4 
 
 		 248 aa  190  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000583905  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  44.58 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  44.58 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3903  ABC transporter related  44.49 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.784547  normal  0.979503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4863  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.03 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000477464  hitchhiker  0.0000052401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  43.15 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.58 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1520  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  46.41 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1421  ABC transporter related  45.87 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  44.58 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4741  ABC transporter related  43.03 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000344378  hitchhiker  0.000000131699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  44.58 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1722  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.57 
 
 		 248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  45.23 
 
 		 237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  44.92 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  42.32 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0796  ABC transporter related  45.61 
 
 		 236 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64860  ABC transporter ATP-binding protein  43.03 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000027849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4655  ABC transporter related  43.03 
 
 		 238 aa  188  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000808014  hitchhiker  0.00473023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0556  ABC transporter-like  43.03 
 
 		 238 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000214193  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4919  ABC transporter related  42.62 
 
 		 238 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000800081  decreased coverage  0.0000000000000903598 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  44.67 
 
 		 239 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1145  ABC transporter related  43.57 
 
 		 249 aa  188  8e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.457841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.98 
 
 		 238 aa  188  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  46.49 
 
 		 235 aa  187  9e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  40.57 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  45.61 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  44.17 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  46.47 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4895  ABC transporter related protein  44.81 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.98 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.98 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.98 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.85 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.98 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.85 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1776  ABC transporter related  45.92 
 
 		 244 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.85 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  44.49 
 
 		 247 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  41.25 
 
 		 236 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.85 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.85 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.98 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.98 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  40.91 
 
 		 237 aa  186  4e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3930  ABC transporter related  43.85 
 
 		 236 aa  185  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  45 
 
 		 245 aa  185  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0601  ABC transporter  41.39 
 
 		 238 aa  185  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.190896  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5634  ABC transporter ATP-binding protein  42.21 
 
 		 238 aa  185  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  44.05 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.09 
 
 		 234 aa  185  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0924  ABC transporter related  46.84 
 
 		 241 aa  185  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.359133  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  43.15 
 
 		 234 aa  185  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  44.81 
 
 		 235 aa  185  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  42.62 
 
 		 238 aa  185  7e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0490  ABC transporter related  45.68 
 
 		 244 aa  184  8e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0438645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2264  ABC transporter related  45.19 
 
 		 234 aa  184  9e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0714908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  45.23 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4915  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.39 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0988  ABC transporter-like  43.33 
 
 		 247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0162069  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2925  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.41 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  43.16 
 
 		 247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1570  ABC transporter related  46.41 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755782  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  45.23 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  40.57 
 
 		 238 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.83 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1228  ABC transporter related  44.17 
 
 		 257 aa  182  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000178729 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.16 
 
 		 238 aa  182  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  44.81 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  42.92 
 
 		 233 aa  183  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  40.57 
 
 		 238 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1274  ABC transporter related  44.49 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3326  ABC transporter related  43.27 
 
 		 244 aa  182  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3155  ABC transporter related protein  44.17 
 
 		 289 aa  182  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1952  ABC transporter related  44.81 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.571715  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  43.17 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>