More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1501 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1501  ABC transporter related  100 
 
 
233 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.196054  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0823  ABC transporter related  74.57 
 
 
235 aa  347  8e-95  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1807  ABC transporter related  67.67 
 
 
233 aa  325  4.0000000000000003e-88  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.820748  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0314  ABC transporter related  64.66 
 
 
234 aa  310  7.999999999999999e-84  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0503  ABC transporter related  47.28 
 
 
242 aa  217  1e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.372423 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1774  ABC transporter related  47.7 
 
 
243 aa  213  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000270769 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1586  ABC transporter related  45.19 
 
 
242 aa  209  4e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1702  ABC transporter related  44.77 
 
 
267 aa  208  6e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.411618 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0599  ABC transporter related  44.44 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2206  ABC transporter related  43.91 
 
 
271 aa  186  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  43.59 
 
 
234 aa  185  6e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3930  ABC transporter related  41.56 
 
 
236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1274  ABC transporter related  41.3 
 
 
237 aa  176  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  40.87 
 
 
234 aa  174  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0924  ABC transporter related  41.23 
 
 
241 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.359133  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4895  ABC transporter related protein  42.49 
 
 
243 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3206  ABC transporter related protein  39.48 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404801  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0988  ABC transporter-like  39.06 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0162069  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  39.32 
 
 
236 aa  173  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1975  ABC transporter related protein  40.77 
 
 
279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1421  ABC transporter related  42.24 
 
 
235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2925  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.35 
 
 
236 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0545  ABC transporter related  42.11 
 
 
234 aa  169  2e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.699298  hitchhiker  0.000807716 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2917  ABC transporter related  37.34 
 
 
239 aa  170  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1570  ABC transporter related  40.35 
 
 
236 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755782  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3960  ABC transporter related  43.42 
 
 
235 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1520  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  40 
 
 
277 aa  169  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1185  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  40.85 
 
 
280 aa  167  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0567598  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1489  ABC transporter related protein  42.67 
 
 
251 aa  167  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1976  ABC transporter related  38.53 
 
 
286 aa  167  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.18 
 
 
234 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2163  ABC transporter related  38.26 
 
 
276 aa  166  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0504  ABC transporter related  39.66 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  37.93 
 
 
238 aa  166  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  38.03 
 
 
233 aa  165  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1544  ABC transporter related  40.43 
 
 
238 aa  164  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  38.2 
 
 
233 aa  164  8e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  38.72 
 
 
235 aa  164  9e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  39.06 
 
 
236 aa  164  9e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1145  ABC transporter related  38.94 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.457841  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  36.17 
 
 
244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  36.75 
 
 
235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  37.18 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3016  ABC transporter related  39.06 
 
 
260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2532  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.77 
 
 
254 aa  162  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1093  ABC transporter related  38.96 
 
 
555 aa  163  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.403079  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0338  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.02 
 
 
235 aa  162  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0889  ABC transporter related  39.32 
 
 
233 aa  162  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  38.79 
 
 
233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3843  ABC transporter related  42.11 
 
 
235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.434627  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4170  ABC transporter related  38.63 
 
 
245 aa  161  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1580  ABC transporter related  42.29 
 
 
237 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  37.93 
 
 
234 aa  160  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  36.6 
 
 
239 aa  160  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2891  ABC transporter related protein  37.77 
 
 
284 aa  160  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  39.3 
 
 
234 aa  161  1e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  37.93 
 
 
233 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0479  ABC transporter related protein  38.79 
 
 
231 aa  160  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000373417  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 
233 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1228  ABC transporter related  38.63 
 
 
257 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000178729 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 
233 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3586  ABC transporter related  39.91 
 
 
254 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0486614  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0429  ABC transporter related protein  40.17 
 
 
236 aa  159  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0665376  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3751  ABC transporter related  37.61 
 
 
234 aa  159  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5320  ABC transporter related  39.91 
 
 
254 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3089  ABC transporter related protein  40.52 
 
 
234 aa  159  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  37.34 
 
 
237 aa  159  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  35.62 
 
 
234 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1841  ABC transporter related  38.98 
 
 
263 aa  159  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.17 
 
 
235 aa  158  5e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0884  ABC transporter-like protein protein  37.77 
 
 
242 aa  159  5e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  36.29 
 
 
238 aa  159  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0600  ABC transporter related  39.73 
 
 
234 aa  158  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  35.34 
 
 
236 aa  159  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  36.05 
 
 
234 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3155  ABC transporter related protein  38.2 
 
 
289 aa  158  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  37.34 
 
 
239 aa  158  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  41.28 
 
 
484 aa  158  7e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  37.97 
 
 
234 aa  158  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  37.34 
 
 
235 aa  158  7e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  37.5 
 
 
233 aa  158  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3934  ABC transporter related  39.91 
 
 
254 aa  157  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  37.07 
 
 
233 aa  157  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4793  ABC transporter related  36.44 
 
 
233 aa  157  9e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.262545  normal  0.126622 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.91 
 
 
234 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1980  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  41.15 
 
 
240 aa  157  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.681741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  40.54 
 
 
245 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0751  ABC transporter, ATP-binding protein  35.78 
 
 
241 aa  157  1e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.54301  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0310  ABC transporter related  35.47 
 
 
234 aa  157  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327886  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  37.02 
 
 
243 aa  157  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0529  ABC transporter related  40.26 
 
 
240 aa  156  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000281948  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1776  ABC transporter related  38.03 
 
 
244 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  34.91 
 
 
233 aa  156  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3326  ABC transporter related  37.07 
 
 
244 aa  156  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5099  ABC transporter related  39.48 
 
 
254 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.23505  normal  0.121092 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1393  ABC transporter related protein  37.39 
 
 
236 aa  156  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0556  ABC transporter-like  37.61 
 
 
238 aa  156  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000214193  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3135  ABC transporter related  40.09 
 
 
242 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0335  ABC transporter related  35.37 
 
 
249 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1654  ABC transporter related protein  36.17 
 
 
243 aa  156  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.10025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>