More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1580 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1580  ABC transporter related  100 
 
 		 237 aa  471  1e-132  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0988  ABC transporter-like  47.23 
 
 		 247 aa  209  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0162069  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  49.32 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1489  ABC transporter related protein  47.58 
 
 		 251 aa  209  4e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  49.09 
 
 		 235 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  49.54 
 
 		 235 aa  204  8e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  46.52 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  46.03 
 
 		 247 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  43.64 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1774  ABC transporter related  46.03 
 
 		 243 aa  202  3e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000270769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  47.83 
 
 		 238 aa  201  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3835  ABC transporter related  44.68 
 
 		 237 aa  199  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.554718  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0503  ABC transporter related  44.67 
 
 		 242 aa  199  3e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.372423 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1702  ABC transporter related  43.98 
 
 		 267 aa  198  5e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.411618 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1145  ABC transporter related  45.3 
 
 		 249 aa  198  6e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.457841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 259 aa  198  7e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  44.4 
 
 		 242 aa  197  9e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.77 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1586  ABC transporter related  44.63 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  44.26 
 
 		 235 aa  195  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1185  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  45.65 
 
 		 280 aa  195  6e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0567598  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  48.13 
 
 		 234 aa  194  7e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3930  ABC transporter related  44.89 
 
 		 236 aa  194  7e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  43.51 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  43.1 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  43.51 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  45 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3502  ABC transporter related  44.29 
 
 		 265 aa  192  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  47.42 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  45.05 
 
 		 233 aa  192  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1520  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  47.06 
 
 		 277 aa  192  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  45.33 
 
 		 237 aa  191  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0429  ABC transporter related protein  44.91 
 
 		 236 aa  191  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0665376  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  47.09 
 
 		 237 aa  191  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0924  ABC transporter related  47.09 
 
 		 241 aa  191  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.359133  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  46.43 
 
 		 237 aa  191  7e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1228  ABC transporter related  44.26 
 
 		 257 aa  191  7e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000178729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  45.11 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  47.2 
 
 		 233 aa  189  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0716  ABC transporter related  47.06 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2925  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.52 
 
 		 236 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2163  ABC transporter related  44.69 
 
 		 276 aa  189  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1570  ABC transporter related  47.52 
 
 		 236 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755782  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3555  ABC transporter related  46.38 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.651056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.22 
 
 		 234 aa  189  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1155  ABC transporter related  44.26 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0959835  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2110  ABC transporter related  43.88 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0745  ABC transporter related  47.06 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  41.88 
 
 		 235 aa  189  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  46.9 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4170  ABC transporter related  44.26 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3135  ABC transporter related  46.64 
 
 		 242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  44.4 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  43.05 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0223  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.59 
 
 		 241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0851652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1426  ABC transporter related  42.13 
 
 		 249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  46.73 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5343  ABC transporter related  43.11 
 
 		 235 aa  188  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  42.98 
 
 		 238 aa  188  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  41.96 
 
 		 231 aa  188  7e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  44.69 
 
 		 236 aa  188  7e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0545  ABC transporter related  41.2 
 
 		 234 aa  188  8e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.699298  hitchhiker  0.000807716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  44.91 
 
 		 236 aa  187  9e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1683  ABC transporter related  41.96 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0884  ABC transporter-like protein protein  45.96 
 
 		 242 aa  187  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  43.56 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  45.87 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  44.68 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1425  ABC transporter related protein  44.49 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0964175  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  41.28 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1274  ABC transporter related  44.69 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  43.36 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3155  ABC transporter related protein  43.84 
 
 		 289 aa  186  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1722  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.81 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  42.98 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  41.45 
 
 		 234 aa  186  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1115  ABC transporter related  42.92 
 
 		 248 aa  186  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000583905  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0266  ABC transporter related  43.86 
 
 		 249 aa  185  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2611  ABC transporter related  45.66 
 
 		 234 aa  185  5e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0660  ABC transporter related protein  43.83 
 
 		 245 aa  185  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0105  ABC transporter related protein  43.4 
 
 		 286 aa  185  6e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750026  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0098  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.29 
 
 		 262 aa  185  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.359537 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.11 
 
 		 234 aa  184  7e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  42.37 
 
 		 240 aa  184  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  42.79 
 
 		 233 aa  185  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0988  ABC transporter-related protein  44.64 
 
 		 247 aa  184  8e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0566  ABC transporter related  42.17 
 
 		 241 aa  184  8e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.328556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  45.54 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1679  ABC transporter-like protein  45.78 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.0768267 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4420  ABC transporter related  40.08 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1421  ABC transporter related  41.35 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  41.95 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0683  ABC transporter related protein  44.64 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000101053  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3206  ABC transporter related protein  42.98 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404801  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0803  ABC transporter related  44.93 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2118  ABC transporter related  42.24 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0556  ABC transporter-like  42.34 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000214193  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  42.79 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  41.96 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1162  ABC transporter related  42.08 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.596535 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>