More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2110 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2110  ABC transporter related  100 
 
 		 236 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  53.16 
 
 		 237 aa  232  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  49.79 
 
 		 249 aa  230  2e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  48.72 
 
 		 239 aa  222  4e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  48.72 
 
 		 239 aa  221  8e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  47.86 
 
 		 236 aa  221  8e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  51.06 
 
 		 247 aa  221  9e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  51.06 
 
 		 247 aa  221  9e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  51.06 
 
 		 247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  51.91 
 
 		 236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  49.79 
 
 		 238 aa  218  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  47.01 
 
 		 234 aa  218  6e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  47.86 
 
 		 235 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5343  ABC transporter related  47.44 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  50.64 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  48.29 
 
 		 242 aa  216  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  49.15 
 
 		 238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  46.84 
 
 		 237 aa  215  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  46.81 
 
 		 234 aa  215  4e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  49.79 
 
 		 253 aa  215  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  50 
 
 		 234 aa  215  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  47.23 
 
 		 236 aa  215  5e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  50.43 
 
 		 234 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  49.15 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.44 
 
 		 234 aa  214  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  48.29 
 
 		 235 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3570  ABC transporter related  49.79 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0703152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  50 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  48.94 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  50.21 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  49.57 
 
 		 234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  50.85 
 
 		 242 aa  212  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  45.73 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  44.26 
 
 		 237 aa  211  5.999999999999999e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  46.58 
 
 		 235 aa  211  5.999999999999999e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  46.81 
 
 		 239 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  47.88 
 
 		 238 aa  210  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  46.15 
 
 		 233 aa  210  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  47.01 
 
 		 238 aa  210  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 		 236 aa  210  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  47.44 
 
 		 265 aa  209  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  45.73 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6584  ABC transporter related  49.15 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633643  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  48.72 
 
 		 236 aa  209  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  48.94 
 
 		 235 aa  209  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.68 
 
 		 235 aa  209  4e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  45.73 
 
 		 233 aa  208  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  49.57 
 
 		 258 aa  208  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  49.15 
 
 		 245 aa  208  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  49.15 
 
 		 236 aa  208  6e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.73 
 
 		 233 aa  208  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  47.44 
 
 		 256 aa  207  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  48.29 
 
 		 244 aa  207  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.73 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  46.58 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  44.54 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.73 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.73 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.73 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.54 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  44.73 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  47.01 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.73 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.73 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.73 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  44.73 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  45.15 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  44.73 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  45.96 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  47.01 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5991  branched chain amino acid ABC tranpsorter ATP-binding protein  46.15 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  46.15 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  45.11 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  47.21 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  45.11 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  46.58 
 
 		 237 aa  205  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  43.59 
 
 		 234 aa  205  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.73 
 
 		 234 aa  205  6e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 		 234 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  50.43 
 
 		 237 aa  205  6e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  45.53 
 
 		 244 aa  205  6e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2365  ABC transporter related  48.72 
 
 		 235 aa  204  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2552  ABC transporter-related protein  47.44 
 
 		 237 aa  204  9e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  44.87 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  44.3 
 
 		 238 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  47.01 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  44.3 
 
 		 238 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1679  ABC transporter-like protein  50 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.0768267 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  45.53 
 
 		 236 aa  204  1e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  44.3 
 
 		 238 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  44.68 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  44.12 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  43.46 
 
 		 237 aa  202  3e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1069  ABC transporter related  48.33 
 
 		 240 aa  202  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1086  ABC transporter related  49.79 
 
 		 237 aa  202  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0710157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  45.73 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2169  ABC transporter related  47.44 
 
 		 235 aa  202  4e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2611  ABC transporter related  48.51 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  46.15 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  45.38 
 
 		 238 aa  202  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>