More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1683 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  99.57 
 
 
231 aa  470  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1683  ABC transporter related  100 
 
 
231 aa  473  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  86.58 
 
 
231 aa  417  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1793  ABC transporter related  82.98 
 
 
235 aa  402  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2574  ABC transporter related  81.39 
 
 
231 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261355  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2930  ABC transporter-related protein  85.28 
 
 
231 aa  393  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.208893  normal  0.372931 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  80.09 
 
 
231 aa  388  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2926  ABC transporter related  82.25 
 
 
231 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1841  ABC transporter related  77.92 
 
 
231 aa  377  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1403  ABC transporter related  69.96 
 
 
237 aa  338  2.9999999999999998e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668018  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  68.94 
 
 
236 aa  338  5e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  69.1 
 
 
237 aa  334  7e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  67.81 
 
 
239 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  67.38 
 
 
239 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  67.38 
 
 
239 aa  322  3e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1853  ABC transporter-related protein  64.26 
 
 
235 aa  311  6.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  61.04 
 
 
231 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4568  ABC transporter related  60.17 
 
 
232 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  60.17 
 
 
232 aa  299  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4171  ABC transporter related  59.74 
 
 
231 aa  294  7e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  59.31 
 
 
241 aa  287  8e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  59.39 
 
 
243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  58.37 
 
 
238 aa  282  4.0000000000000003e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.08 
 
 
238 aa  280  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.65 
 
 
238 aa  276  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1321  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  54.08 
 
 
237 aa  256  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172388  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1604  ABC transporter related  53.65 
 
 
237 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2814  ABC transporter related  53.22 
 
 
237 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0747835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  49.15 
 
 
236 aa  224  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  44.78 
 
 
232 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  47.44 
 
 
236 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  45.22 
 
 
231 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  45.22 
 
 
231 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  48.72 
 
 
237 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.22 
 
 
231 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.07 
 
 
237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  46.12 
 
 
234 aa  214  9e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0935  ABC transporter related  48.92 
 
 
234 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302332  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1417  ABC transporter related  48.92 
 
 
234 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  43.16 
 
 
236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  45.45 
 
 
237 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  45.45 
 
 
237 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1395  ABC transporter related  48.48 
 
 
234 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.858988 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  46.55 
 
 
233 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  43.72 
 
 
231 aa  209  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  43.59 
 
 
234 aa  208  6e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  46.12 
 
 
233 aa  208  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  46.12 
 
 
233 aa  208  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  44.83 
 
 
234 aa  207  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1297  ABC transporter related  48.05 
 
 
234 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  45.26 
 
 
234 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  43.53 
 
 
235 aa  204  7e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  43.5 
 
 
236 aa  204  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  43.5 
 
 
236 aa  204  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  46.98 
 
 
237 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1317  ABC transporter related protein  42.92 
 
 
238 aa  202  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  43.53 
 
 
233 aa  202  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  45.49 
 
 
237 aa  202  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1284  ABC transporter related  42.31 
 
 
234 aa  202  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275207  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  42.31 
 
 
234 aa  202  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  44.4 
 
 
234 aa  201  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5955  ABC transporter related  43.72 
 
 
247 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0145925  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3554  ABC transporter related  42.31 
 
 
234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.256863  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4561  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  49.06 
 
 
234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.474601  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  45.26 
 
 
234 aa  199  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  43.97 
 
 
235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  43.97 
 
 
234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1898  ABC transporter related  45.65 
 
 
234 aa  198  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  43.35 
 
 
236 aa  198  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  44.83 
 
 
235 aa  198  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  44.21 
 
 
239 aa  198  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.67 
 
 
233 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0479  ABC transporter related protein  41.92 
 
 
231 aa  197  9e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000373417  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  43.1 
 
 
237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2157  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.98 
 
 
232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.360084  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2496  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.98 
 
 
232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0491391  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2027  ABC transporter related  42.31 
 
 
234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3519  ABC transporter-related protein  44.21 
 
 
241 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  41.63 
 
 
237 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  42.86 
 
 
234 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6267  ABC transporter related  44.16 
 
 
239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  42.86 
 
 
244 aa  195  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  45.91 
 
 
240 aa  194  8.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0955  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF, putative  44.64 
 
 
241 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0849  ATPase  41.05 
 
 
231 aa  194  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  42.02 
 
 
259 aa  193  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  42.44 
 
 
259 aa  193  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  44.55 
 
 
238 aa  193  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1336  ABC transporter related  47.19 
 
 
234 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.256607  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1281  ABC transporter-related protein  44.16 
 
 
237 aa  193  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal  0.295015 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  43.53 
 
 
239 aa  192  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  42.34 
 
 
254 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  41.38 
 
 
237 aa  192  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5343  ABC transporter related  39.91 
 
 
235 aa  192  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3370  ABC transporter related  43.78 
 
 
241 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1400  ABC transporter related  42.31 
 
 
251 aa  192  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7910  ABC transporter related  43.29 
 
 
275 aa  191  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  42.34 
 
 
251 aa  191  7e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  41.18 
 
 
252 aa  191  8e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0179  ABC transporter related  42.06 
 
 
233 aa  191  8e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>