More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3592 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 239 aa  479  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  77.92 
 
 		 240 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6435  ABC transporter related  73.71 
 
 		 234 aa  354  5.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942423  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  71.98 
 
 		 234 aa  351  5.9999999999999994e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  71.12 
 
 		 234 aa  345  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1678  ABC transporter related  67.36 
 
 		 239 aa  345  3e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1076  ABC transporter related  69.53 
 
 		 234 aa  338  5e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000101179  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1821  ABC transporter related  71 
 
 		 243 aa  335  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2136  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  71 
 
 		 243 aa  335  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0007  ABC transporter related  67.25 
 
 		 234 aa  329  3e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678223 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0007  ABC transporter related  68.97 
 
 		 234 aa  329  3e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315079  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3486  ABC transporter related  66.24 
 
 		 238 aa  318  5e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265059  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0084  ABC transporter related  66.39 
 
 		 251 aa  318  6e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911043  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3343  ABC transporter ATP-binding protein  65.98 
 
 		 246 aa  317  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5955  ABC transporter related  67.53 
 
 		 247 aa  317  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0145925  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3266  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  66.39 
 
 		 251 aa  317  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3048  ABC transporter related  68.83 
 
 		 251 aa  317  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3212  ABC transporter related  65.15 
 
 		 246 aa  316  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0086  ABC transporter related  66.39 
 
 		 251 aa  315  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3538  ABC transporter related  65.15 
 
 		 246 aa  316  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0777529 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0075  ABC transporter related  66.39 
 
 		 251 aa  315  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0018  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  66.39 
 
 		 252 aa  315  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3781  ABC transporter related  67.51 
 
 		 245 aa  314  6e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5163  ABC transporter related  67.1 
 
 		 236 aa  312  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.726387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0102  ABC transporter related  65.56 
 
 		 251 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2971  ABC transporter related  65.56 
 
 		 251 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0084  ABC transporter related  65.56 
 
 		 251 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3914  ABC transporter related  65.98 
 
 		 252 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6267  ABC transporter related  66.67 
 
 		 239 aa  311  7.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3370  ABC transporter related  66.09 
 
 		 241 aa  311  7.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2929  ABC transporter related  63.91 
 
 		 230 aa  309  2e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3519  ABC transporter-related protein  64.81 
 
 		 241 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4074  ABC transporter related  62.66 
 
 		 241 aa  309  2.9999999999999997e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2467  ABC transporter related  65.37 
 
 		 237 aa  308  4e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.766044  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3330  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  67.53 
 
 		 251 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3121  ABC transporter related  64.94 
 
 		 237 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  59.75 
 
 		 248 aa  305  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1281  ABC transporter-related protein  65.37 
 
 		 237 aa  306  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal  0.295015 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  63.04 
 
 		 234 aa  305  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4066  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 		 251 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1608  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.67 
 
 		 251 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0199  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding subunit  66.67 
 
 		 251 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24485  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 		 251 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2993  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.67 
 
 		 251 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.399368  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3376  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.67 
 
 		 251 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  60.43 
 
 		 248 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  60.43 
 
 		 254 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  60.43 
 
 		 251 aa  300  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  57.98 
 
 		 248 aa  299  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  58.9 
 
 		 237 aa  298  6e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  62.17 
 
 		 232 aa  297  9e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  60 
 
 		 233 aa  297  9e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  58.05 
 
 		 248 aa  296  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3755  ABC transporter ATP-binding protein  64.66 
 
 		 237 aa  296  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  61.74 
 
 		 232 aa  295  5e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0056  ABC transporter related  59.32 
 
 		 246 aa  293  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  58.16 
 
 		 246 aa  291  9e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3305  ABC transporter component  58.26 
 
 		 242 aa  290  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  60.43 
 
 		 232 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  57.83 
 
 		 233 aa  288  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  58.7 
 
 		 244 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  58.7 
 
 		 244 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  57.83 
 
 		 233 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0937  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  57.83 
 
 		 240 aa  276  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0476932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  56.65 
 
 		 239 aa  275  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0955  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF, putative  55.04 
 
 		 241 aa  272  4.0000000000000004e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3521  ABC transporter related  60.43 
 
 		 236 aa  271  9e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.295541  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0896  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF  54.62 
 
 		 241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.54469  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  52.17 
 
 		 230 aa  251  6e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  50.42 
 
 		 246 aa  246  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  50 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1802  ABC transporter related  49.13 
 
 		 230 aa  228  5e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.639319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  50.22 
 
 		 234 aa  226  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1792  ABC transporter related  48.26 
 
 		 230 aa  225  6e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000519176 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  48.7 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  49.58 
 
 		 237 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  49.57 
 
 		 233 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  50.43 
 
 		 236 aa  223  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  50 
 
 		 236 aa  221  7e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  52.7 
 
 		 234 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.4 
 
 		 231 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  51.92 
 
 		 231 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  51.92 
 
 		 231 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  50.43 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  50.43 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  48.13 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  44.78 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  48.13 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  50 
 
 		 233 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  48.7 
 
 		 237 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  48.7 
 
 		 237 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  48.03 
 
 		 231 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  50.24 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  52.15 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.64 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  46.78 
 
 		 237 aa  208  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  48.07 
 
 		 234 aa  208  6e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  48.31 
 
 		 236 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  46.78 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  43.59 
 
 		 236 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>