More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2387 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  100 
 
 		 231 aa  473  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1683  ABC transporter related  80.09 
 
 		 231 aa  388  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  80.09 
 
 		 231 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2574  ABC transporter related  79.22 
 
 		 231 aa  384  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261355  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1793  ABC transporter related  79.15 
 
 		 235 aa  378  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2926  ABC transporter related  78.35 
 
 		 231 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  78.35 
 
 		 231 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1841  ABC transporter related  75.76 
 
 		 231 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2930  ABC transporter-related protein  78.79 
 
 		 231 aa  356  9.999999999999999e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.208893  normal  0.372931 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  68.94 
 
 		 236 aa  345  4e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1403  ABC transporter related  69.1 
 
 		 237 aa  338  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668018  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  70.39 
 
 		 237 aa  337  9e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  67.38 
 
 		 239 aa  330  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  67.38 
 
 		 239 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  66.95 
 
 		 239 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1853  ABC transporter-related protein  65.53 
 
 		 235 aa  322  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4568  ABC transporter related  61.9 
 
 		 232 aa  306  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  61.47 
 
 		 231 aa  304  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  61.04 
 
 		 232 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4171  ABC transporter related  60.17 
 
 		 231 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  58.87 
 
 		 241 aa  284  7e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  58.8 
 
 		 238 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.08 
 
 		 238 aa  280  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  58.08 
 
 		 243 aa  278  5e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.65 
 
 		 238 aa  276  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2814  ABC transporter related  54.94 
 
 		 237 aa  257  9e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0747835 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1604  ABC transporter related  54.08 
 
 		 237 aa  257  9e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1321  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  53.65 
 
 		 237 aa  255  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  45.26 
 
 		 232 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  46.09 
 
 		 231 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  46.09 
 
 		 231 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.65 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.78 
 
 		 237 aa  221  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  46.35 
 
 		 237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  46.98 
 
 		 234 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  45.45 
 
 		 231 aa  217  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  46.32 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  46.32 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  46.55 
 
 		 234 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  47.44 
 
 		 236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  46.15 
 
 		 236 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  44.02 
 
 		 234 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  45.92 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  45.26 
 
 		 234 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1297  ABC transporter related  48.48 
 
 		 234 aa  209  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  45.26 
 
 		 234 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  45.69 
 
 		 233 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0935  ABC transporter related  49.32 
 
 		 234 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302332  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  41.45 
 
 		 236 aa  208  6e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1417  ABC transporter related  49.32 
 
 		 234 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  46.12 
 
 		 233 aa  207  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1395  ABC transporter related  49.32 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.858988 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.26 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  45.69 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  45.69 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  47.49 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  46.12 
 
 		 234 aa  205  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1898  ABC transporter related  46.96 
 
 		 234 aa  204  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1678  ABC transporter related  47.49 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  44.12 
 
 		 259 aa  202  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  44.12 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  43.1 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  46.55 
 
 		 237 aa  201  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  41.38 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  42.49 
 
 		 236 aa  200  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  43.29 
 
 		 234 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4997  ABC transporter related  44.59 
 
 		 235 aa  200  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  45.26 
 
 		 235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3554  ABC transporter related  42.74 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.256863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  41.81 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0479  ABC transporter related protein  43.23 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000373417  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  47.03 
 
 		 239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4561  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  49.06 
 
 		 234 aa  198  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.474601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  41.26 
 
 		 236 aa  198  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  41.26 
 
 		 236 aa  198  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5343  ABC transporter related  42.92 
 
 		 235 aa  197  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5955  ABC transporter related  46.67 
 
 		 247 aa  197  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0145925  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3781  ABC transporter related  45.57 
 
 		 245 aa  197  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3519  ABC transporter-related protein  45.92 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0545  ABC transporter related  42.31 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756199 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  44.87 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1076  ABC transporter related  44.83 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000101179  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  45.22 
 
 		 234 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  41.2 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  42.8 
 
 		 240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  41.88 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0614  ABC transporter related  42.36 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1284  ABC transporter related  41.88 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2929  ABC transporter related  45.85 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2027  ABC transporter related  42.74 
 
 		 234 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  42.02 
 
 		 252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3343  ABC transporter ATP-binding protein  47.73 
 
 		 246 aa  195  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5861  ABC transporter related  43.28 
 
 		 250 aa  195  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  42.37 
 
 		 240 aa  195  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1336  ABC transporter related  47.62 
 
 		 234 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6267  ABC transporter related  45.89 
 
 		 239 aa  194  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3370  ABC transporter related  45.92 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0849  ATPase  41.92 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  42.15 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  44.4 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>