More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4329 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  100 
 
 		 237 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  97.47 
 
 		 237 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  83.12 
 
 		 237 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  75 
 
 		 244 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  73.95 
 
 		 252 aa  355  5e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  70.42 
 
 		 536 aa  331  6e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  66.81 
 
 		 234 aa  331  6e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  65.52 
 
 		 234 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  64.22 
 
 		 234 aa  324  9e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  66.53 
 
 		 259 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  66.11 
 
 		 259 aa  310  1e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  62.55 
 
 		 236 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  60.94 
 
 		 236 aa  296  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  51.07 
 
 		 236 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  48.5 
 
 		 232 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  48.93 
 
 		 231 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  48.5 
 
 		 232 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  47.26 
 
 		 237 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4568  ABC transporter related  48.5 
 
 		 232 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  47.68 
 
 		 239 aa  227  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1177  ABC transporter related  49.58 
 
 		 236 aa  224  7e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4171  ABC transporter related  47.64 
 
 		 231 aa  223  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  47.06 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.88 
 
 		 238 aa  222  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  47.41 
 
 		 236 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  46.98 
 
 		 236 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  48.74 
 
 		 236 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1853  ABC transporter-related protein  48.52 
 
 		 235 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  46.35 
 
 		 231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  48.71 
 
 		 243 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  46.78 
 
 		 238 aa  219  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  48.72 
 
 		 231 aa  219  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  45.73 
 
 		 236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  47.44 
 
 		 241 aa  218  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  45.53 
 
 		 239 aa  218  6e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1683  ABC transporter related  48.72 
 
 		 231 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.46 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  51.42 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  45.15 
 
 		 239 aa  217  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  49.29 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  47.19 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1403  ABC transporter related  45.8 
 
 		 237 aa  216  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668018  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2929  ABC transporter related  50.71 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  43.35 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  47.23 
 
 		 248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2926  ABC transporter related  45.49 
 
 		 231 aa  211  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  45.92 
 
 		 231 aa  211  7.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  46.35 
 
 		 234 aa  211  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1793  ABC transporter related  44.92 
 
 		 235 aa  210  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  46.48 
 
 		 233 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  44.87 
 
 		 233 aa  210  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  47.01 
 
 		 248 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  50.24 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  45.06 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1841  ABC transporter related  45.92 
 
 		 231 aa  209  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1076  ABC transporter related  46.41 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000101179  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  47.01 
 
 		 256 aa  209  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  46.19 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2574  ABC transporter related  45.06 
 
 		 231 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261355  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  45.57 
 
 		 234 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  44.73 
 
 		 234 aa  208  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  43.78 
 
 		 237 aa  208  6e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  41.63 
 
 		 231 aa  207  9e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  41.63 
 
 		 231 aa  207  9e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  47.21 
 
 		 248 aa  207  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3664  ABC transporter component  44.21 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  46.92 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  45.3 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.06 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  45.3 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.88 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  45.53 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  44.4 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  44.49 
 
 		 248 aa  205  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  45.49 
 
 		 236 aa  205  4e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  46.55 
 
 		 235 aa  205  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  46.81 
 
 		 237 aa  205  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  44.49 
 
 		 246 aa  205  6e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  45.69 
 
 		 234 aa  204  7e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  45.8 
 
 		 239 aa  204  7e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  45.49 
 
 		 251 aa  204  7e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2930  ABC transporter-related protein  46.35 
 
 		 231 aa  204  7e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.208893  normal  0.372931 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6435  ABC transporter related  44.68 
 
 		 234 aa  204  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942423  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  45.73 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  44.54 
 
 		 238 aa  204  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  46.12 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  46.55 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  44.87 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  44.87 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  44.13 
 
 		 239 aa  202  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3755  ABC transporter ATP-binding protein  44.77 
 
 		 237 aa  202  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  44.59 
 
 		 233 aa  202  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  44.96 
 
 		 239 aa  201  6e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  46.81 
 
 		 237 aa  201  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  44.49 
 
 		 237 aa  201  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  44.26 
 
 		 234 aa  201  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  44.44 
 
 		 244 aa  201  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  43.53 
 
 		 236 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  43.51 
 
 		 239 aa  200  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  41.81 
 
 		 236 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>