More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2926 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2926  ABC transporter related  100 
 
 		 231 aa  471  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2574  ABC transporter related  84.85 
 
 		 231 aa  407  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261355  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  83.12 
 
 		 231 aa  401  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1793  ABC transporter related  82.55 
 
 		 235 aa  395  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1841  ABC transporter related  83.55 
 
 		 231 aa  396  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  82.68 
 
 		 231 aa  393  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1683  ABC transporter related  82.25 
 
 		 231 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  78.35 
 
 		 231 aa  375  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2930  ABC transporter-related protein  82.68 
 
 		 231 aa  375  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.208893  normal  0.372931 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1403  ABC transporter related  72.1 
 
 		 237 aa  347  9e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668018  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  69.96 
 
 		 237 aa  335  5e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  69.53 
 
 		 239 aa  334  7e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  66.81 
 
 		 236 aa  333  1e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  69.53 
 
 		 239 aa  333  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  69.66 
 
 		 239 aa  332  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1853  ABC transporter-related protein  66.81 
 
 		 235 aa  325  5e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  61.9 
 
 		 241 aa  299  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4568  ABC transporter related  61.47 
 
 		 232 aa  298  6e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  61.47 
 
 		 231 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  61.04 
 
 		 232 aa  295  3e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  61.57 
 
 		 243 aa  292  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4171  ABC transporter related  60.61 
 
 		 231 aa  291  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  56.22 
 
 		 238 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2814  ABC transporter related  54.94 
 
 		 237 aa  267  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0747835 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1604  ABC transporter related  53.65 
 
 		 237 aa  262  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1321  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  54.08 
 
 		 237 aa  261  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  46.09 
 
 		 232 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  46.09 
 
 		 231 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  46.09 
 
 		 231 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  47.19 
 
 		 237 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  47.19 
 
 		 237 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.09 
 
 		 231 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  45.53 
 
 		 236 aa  218  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  45.73 
 
 		 234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  46.12 
 
 		 234 aa  214  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  45.22 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  44.78 
 
 		 236 aa  211  5.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.49 
 
 		 237 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0935  ABC transporter related  48.4 
 
 		 234 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302332  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1417  ABC transporter related  48.4 
 
 		 234 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  45.49 
 
 		 237 aa  211  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1297  ABC transporter related  46.75 
 
 		 234 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  46.98 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  46.55 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  46.78 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1395  ABC transporter related  46.32 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.858988 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  46.12 
 
 		 233 aa  208  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  46.12 
 
 		 233 aa  208  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  47.41 
 
 		 237 aa  208  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  46.98 
 
 		 235 aa  208  6e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  43.97 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  45.06 
 
 		 236 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  44.59 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1898  ABC transporter related  45.22 
 
 		 234 aa  205  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  43.78 
 
 		 236 aa  204  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  45.69 
 
 		 233 aa  204  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  44.54 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  44.54 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  44.83 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  44.83 
 
 		 234 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  41.63 
 
 		 237 aa  201  6e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.83 
 
 		 233 aa  201  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  41.99 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1400  ABC transporter related  44.49 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3737  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  43.35 
 
 		 236 aa  199  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  45.5 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4561  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.17 
 
 		 234 aa  198  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.474601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2651  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.84 
 
 		 234 aa  197  9e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3085  ABC transporter related  44.14 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6027  ABC transporter related  46.12 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3519  ABC transporter-related protein  44.64 
 
 		 241 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2027  ABC transporter related  42.31 
 
 		 234 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  43.5 
 
 		 237 aa  196  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1336  ABC transporter related  45.89 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3554  ABC transporter related  41.45 
 
 		 234 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.256863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1385  ABC transporter related  42.13 
 
 		 251 aa  195  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.692316  normal  0.0515657 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  41.81 
 
 		 235 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2157  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.92 
 
 		 232 aa  195  5.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.360084  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1284  ABC transporter related  41.45 
 
 		 234 aa  195  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  41.45 
 
 		 234 aa  195  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6267  ABC transporter related  44.16 
 
 		 239 aa  194  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1827  putative branched amino acid related transport system protein  48.71 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1673  ABC transporter, ATP-binding protein  48.71 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836277  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1651  ABC transporter, ATP-binding protein  48.71 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5343  ABC transporter related  40.77 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  43.91 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7910  ABC transporter related  44.16 
 
 		 275 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1317  ABC transporter related protein  40.34 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1259  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.67 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.575608 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  43.29 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0479  ABC transporter related protein  40.61 
 
 		 231 aa  192  4e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000373417  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  44.64 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  45.24 
 
 		 233 aa  192  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  42.67 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  40.95 
 
 		 259 aa  191  6e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1076  ABC transporter related  42.24 
 
 		 234 aa  191  6e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000101179  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2496  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.86 
 
 		 232 aa  191  8e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0491391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>