More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4568 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4568  ABC transporter related  100 
 
 		 232 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  95.69 
 
 		 232 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  95.24 
 
 		 231 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4171  ABC transporter related  90.48 
 
 		 231 aa  427  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  66.38 
 
 		 239 aa  327  8e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  66.52 
 
 		 239 aa  327  9e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  66.95 
 
 		 239 aa  325  5e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  67.81 
 
 		 237 aa  324  8.000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1403  ABC transporter related  67.38 
 
 		 237 aa  323  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668018  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  67.69 
 
 		 243 aa  321  7e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  66.67 
 
 		 241 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  61.9 
 
 		 231 aa  306  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  61.02 
 
 		 236 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  62.34 
 
 		 231 aa  304  7e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  60.17 
 
 		 231 aa  302  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1683  ABC transporter related  60.17 
 
 		 231 aa  301  5.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1841  ABC transporter related  62.77 
 
 		 231 aa  300  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2574  ABC transporter related  61.9 
 
 		 231 aa  298  4e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261355  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2926  ABC transporter related  61.47 
 
 		 231 aa  298  6e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1793  ABC transporter related  62.55 
 
 		 235 aa  297  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1853  ABC transporter-related protein  59.15 
 
 		 235 aa  294  7e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2930  ABC transporter-related protein  62.34 
 
 		 231 aa  287  8e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.208893  normal  0.372931 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.51 
 
 		 238 aa  279  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.94 
 
 		 238 aa  276  3e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  57.51 
 
 		 238 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1604  ABC transporter related  52.14 
 
 		 237 aa  247  9e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2814  ABC transporter related  50.85 
 
 		 237 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0747835 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  48.5 
 
 		 237 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.5 
 
 		 237 aa  230  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1321  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.72 
 
 		 237 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  48.72 
 
 		 234 aa  224  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  47.39 
 
 		 232 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  49.36 
 
 		 234 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  47.62 
 
 		 237 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  47.62 
 
 		 237 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  46.81 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 236 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  48.66 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  48.07 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  47.84 
 
 		 234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  46.38 
 
 		 236 aa  215  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  47.21 
 
 		 233 aa  215  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.07 
 
 		 233 aa  214  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  46.78 
 
 		 233 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  46.78 
 
 		 233 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  46.15 
 
 		 237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  47.23 
 
 		 234 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  45.06 
 
 		 236 aa  209  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.48 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  43.48 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1297  ABC transporter related  45.45 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  43.48 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0935  ABC transporter related  45.45 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302332  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1417  ABC transporter related  45.45 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  47.06 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  47.06 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  47.41 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  43.35 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  45.96 
 
 		 234 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6017  ABC transporter related  45.3 
 
 		 251 aa  204  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.896257  hitchhiker  0.00867061 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1395  ABC transporter related  45.02 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.858988 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  43.35 
 
 		 235 aa  203  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  42.67 
 
 		 259 aa  202  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2929  ABC transporter related  49.76 
 
 		 230 aa  202  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  43.7 
 
 		 244 aa  202  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  47.77 
 
 		 254 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  44.02 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  45.49 
 
 		 237 aa  202  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  45.69 
 
 		 235 aa  201  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  43.35 
 
 		 238 aa  202  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1898  ABC transporter related  44.78 
 
 		 234 aa  201  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  43.29 
 
 		 231 aa  201  6e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6584  ABC transporter related  43.59 
 
 		 245 aa  201  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633643  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5955  ABC transporter related  43.78 
 
 		 247 aa  201  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0145925  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  46.15 
 
 		 239 aa  200  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4561  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.64 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.474601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  44.35 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  44.87 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  44.83 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  45.26 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  46.64 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  46.64 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0955  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF, putative  44.26 
 
 		 241 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6267  ABC transporter related  45.45 
 
 		 239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  46.64 
 
 		 248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  42.67 
 
 		 234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  42.79 
 
 		 236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6492  ABC transporter related  43.16 
 
 		 244 aa  198  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0130202  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  42.15 
 
 		 236 aa  198  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  43.91 
 
 		 240 aa  198  6e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3519  ABC transporter-related protein  45.92 
 
 		 241 aa  198  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3370  ABC transporter related  45.49 
 
 		 241 aa  198  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  43.1 
 
 		 235 aa  198  7e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  44.14 
 
 		 232 aa  198  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  45.95 
 
 		 248 aa  197  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  41.35 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  41.63 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  43.69 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  44.26 
 
 		 239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1076  ABC transporter related  43.53 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000101179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>