More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1577 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  100 
 
 		 238 aa  483  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  78.15 
 
 		 238 aa  393  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  78.15 
 
 		 238 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  58.65 
 
 		 239 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  58.65 
 
 		 239 aa  287  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  60.09 
 
 		 231 aa  286  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  58.9 
 
 		 237 aa  284  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1793  ABC transporter related  58.05 
 
 		 235 aa  283  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  58.37 
 
 		 231 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  58.8 
 
 		 231 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  58.9 
 
 		 239 aa  281  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1683  ABC transporter related  58.37 
 
 		 231 aa  282  4.0000000000000003e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1403  ABC transporter related  59.4 
 
 		 237 aa  281  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668018  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  60.26 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2574  ABC transporter related  58.37 
 
 		 231 aa  278  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261355  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  58.9 
 
 		 236 aa  276  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  59.57 
 
 		 243 aa  274  9e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2926  ABC transporter related  56.22 
 
 		 231 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4568  ABC transporter related  57.51 
 
 		 232 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1841  ABC transporter related  56.65 
 
 		 231 aa  270  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  57.51 
 
 		 232 aa  269  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4171  ABC transporter related  57.51 
 
 		 231 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  56.65 
 
 		 231 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2930  ABC transporter-related protein  58.37 
 
 		 231 aa  263  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.208893  normal  0.372931 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1853  ABC transporter-related protein  54.66 
 
 		 235 aa  258  7e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  49.15 
 
 		 236 aa  235  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1321  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.27 
 
 		 237 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1604  ABC transporter related  50 
 
 		 237 aa  229  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  47.01 
 
 		 236 aa  228  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2814  ABC transporter related  50.42 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0747835 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  45.69 
 
 		 234 aa  222  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  45.26 
 
 		 234 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  46.78 
 
 		 237 aa  219  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.78 
 
 		 237 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  45.34 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  43.78 
 
 		 232 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  44.92 
 
 		 236 aa  217  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  44.21 
 
 		 234 aa  215  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1395  ABC transporter related  47.66 
 
 		 234 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.858988 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  43.78 
 
 		 231 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  43.78 
 
 		 231 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  47.44 
 
 		 238 aa  211  5.999999999999999e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0935  ABC transporter related  46.58 
 
 		 234 aa  211  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302332  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1417  ABC transporter related  46.58 
 
 		 234 aa  211  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  43.1 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  43.16 
 
 		 232 aa  210  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1297  ABC transporter related  48.09 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  45.53 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.35 
 
 		 231 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  45.3 
 
 		 240 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  45.42 
 
 		 259 aa  208  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  44.87 
 
 		 234 aa  208  7e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  45.26 
 
 		 235 aa  207  9e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  45 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  44.64 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  44.87 
 
 		 231 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  43.7 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  43.28 
 
 		 237 aa  205  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  44.44 
 
 		 234 aa  205  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  43.28 
 
 		 237 aa  205  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  43.35 
 
 		 233 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  43.35 
 
 		 233 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  44.69 
 
 		 237 aa  205  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  43.78 
 
 		 240 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  43.35 
 
 		 233 aa  204  8e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  42.06 
 
 		 240 aa  204  8e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  46.32 
 
 		 237 aa  204  8e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4561  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50.93 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.474601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  43.78 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4748  ABC transporter related  44.21 
 
 		 237 aa  202  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.597836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  41.88 
 
 		 237 aa  202  3e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  44.44 
 
 		 234 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.98 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1336  ABC transporter related  46.58 
 
 		 234 aa  201  9e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  41.88 
 
 		 236 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  44.64 
 
 		 234 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1898  ABC transporter related  45.49 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  45.96 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  44.21 
 
 		 235 aa  198  6e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  42.06 
 
 		 233 aa  198  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  41.77 
 
 		 235 aa  197  7.999999999999999e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2989  ABC transporter related  42.49 
 
 		 246 aa  197  9e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  41.45 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  44.68 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  43.93 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  43.22 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  44.78 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3085  ABC transporter related  39.91 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  39.91 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1207  ABC transporter-related protein  44.44 
 
 		 232 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1372  ABC transporter related  44.26 
 
 		 240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.06 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6017  ABC transporter related  45.76 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.896257  hitchhiker  0.00867061 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1618  ABC transporter related  42.74 
 
 		 237 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  45.92 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  45.11 
 
 		 239 aa  196  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  42.98 
 
 		 243 aa  196  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  45.49 
 
 		 240 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  42.49 
 
 		 234 aa  195  5.000000000000001e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  42.74 
 
 		 235 aa  194  7e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>