More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1020 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  100 
 
 		 240 aa  480  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  85.83 
 
 		 240 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  56.54 
 
 		 237 aa  274  9e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  56.22 
 
 		 243 aa  260  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2989  ABC transporter related  55.13 
 
 		 246 aa  259  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4748  ABC transporter related  53.16 
 
 		 237 aa  258  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.597836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1618  ABC transporter related  54.01 
 
 		 237 aa  258  6e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1903  ABC transporter related  54.47 
 
 		 244 aa  258  8e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.638808  normal  0.412761 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4367  ABC transporter related  55.56 
 
 		 236 aa  255  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.583666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  52.79 
 
 		 233 aa  254  7e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3085  ABC transporter related  50.63 
 
 		 237 aa  250  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  50.21 
 
 		 237 aa  249  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  54.7 
 
 		 236 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  52.36 
 
 		 232 aa  245  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1333  ABC transporter related  51.93 
 
 		 237 aa  241  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529108  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1230  ABC transporter-related protein  52.36 
 
 		 238 aa  240  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  50.64 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0081  ABC transporter related  49.79 
 
 		 237 aa  238  8e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0083  ABC transporter related  50.21 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  50.43 
 
 		 230 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3649  ABC transporter-related protein  50.22 
 
 		 237 aa  231  6e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2954  ABC transporter related  46.84 
 
 		 239 aa  230  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  49.36 
 
 		 232 aa  228  5e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0362  ABC transporter related  48.75 
 
 		 243 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.51 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0210  ABC transporter related  46.81 
 
 		 237 aa  224  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  49.36 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  48.95 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3826  ABC transporter related  48.51 
 
 		 237 aa  221  7e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  48.09 
 
 		 237 aa  221  7e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4047  ABC transporter related  47.93 
 
 		 236 aa  221  9e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  48.1 
 
 		 237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4606  ABC transporter related  49.38 
 
 		 235 aa  218  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  46.15 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  45.73 
 
 		 236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0632  ABC transporter related  44.49 
 
 		 242 aa  214  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3170  ABC transporter-related protein  45.96 
 
 		 236 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.07 
 
 		 238 aa  211  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  45.87 
 
 		 236 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  44.87 
 
 		 237 aa  208  7e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  44.02 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  45.3 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  44.02 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  44.68 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.07 
 
 		 238 aa  207  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  44.68 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  44.68 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1988  ABC transporter related  44.02 
 
 		 236 aa  205  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.69422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.3 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  43.78 
 
 		 238 aa  205  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  47.09 
 
 		 231 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  47.09 
 
 		 231 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  45.73 
 
 		 239 aa  204  8e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  45.06 
 
 		 234 aa  204  9e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.09 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0179  ABC transporter related  46.22 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  46.35 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  44.93 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  46.12 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  43.78 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  45.26 
 
 		 237 aa  198  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  42.19 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  42.13 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  46.23 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  41.88 
 
 		 239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  41.88 
 
 		 239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  44.21 
 
 		 232 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  44.21 
 
 		 239 aa  196  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  43.61 
 
 		 243 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0858  ABC transporter related  47.11 
 
 		 230 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.152569 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  46.22 
 
 		 237 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  46.22 
 
 		 237 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4111  ABC transporter related  42.31 
 
 		 248 aa  195  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  43.22 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5634  ABC transporter ATP-binding protein  41.53 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  41.45 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  45.98 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64310  putative ABC transport ATP-binding subunit  45.37 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.349847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  44.54 
 
 		 852 aa  192  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  42.67 
 
 		 234 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5583  urea ABC transporter ATP-binding protein UrtE  44.91 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0412532  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0697  ABC transporter related  43.75 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1434  ABC transporter related  45.58 
 
 		 230 aa  192  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1177  ABC transporter related  46.41 
 
 		 236 aa  191  6e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496575  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4889  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.2 
 
 		 232 aa  191  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  42.06 
 
 		 232 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  41.03 
 
 		 237 aa  191  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2157  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.86 
 
 		 232 aa  190  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.360084  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4902  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.64 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24992  normal  0.0123469 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  41.53 
 
 		 240 aa  191  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  40.34 
 
 		 231 aa  190  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  42.31 
 
 		 235 aa  190  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64860  ABC transporter ATP-binding protein  41.1 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000027849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0601  ABC transporter  39.83 
 
 		 238 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.190896  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4430  ABC transporter  44.2 
 
 		 232 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  43.75 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  43.35 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5099  ABC transporter related  44.39 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.999414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  42.92 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>