More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0736 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 234 aa  475  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3170  ABC transporter-related protein  66.09 
 
 		 236 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  63.52 
 
 		 236 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  63.52 
 
 		 236 aa  299  2e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4047  ABC transporter related  63.52 
 
 		 236 aa  299  3e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1988  ABC transporter related  61.37 
 
 		 236 aa  294  8e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.69422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  59.66 
 
 		 233 aa  293  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  58.12 
 
 		 237 aa  288  7e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  59.23 
 
 		 233 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4606  ABC transporter related  63.09 
 
 		 235 aa  284  7e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  58.37 
 
 		 233 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3826  ABC transporter related  60.52 
 
 		 237 aa  280  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  55.36 
 
 		 232 aa  280  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  55.98 
 
 		 237 aa  278  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  58.65 
 
 		 237 aa  275  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  59.05 
 
 		 230 aa  275  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0179  ABC transporter related  56.22 
 
 		 233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  55.13 
 
 		 239 aa  270  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  56.22 
 
 		 232 aa  268  5.9999999999999995e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0632  ABC transporter related  56.36 
 
 		 242 aa  256  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0362  ABC transporter related  53.16 
 
 		 243 aa  254  7e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2233  ABC transporter related  54.27 
 
 		 228 aa  248  4e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  51.28 
 
 		 237 aa  241  5e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  51.28 
 
 		 237 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0858  ABC transporter related  50 
 
 		 230 aa  237  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.152569 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5099  ABC transporter related  53.22 
 
 		 229 aa  237  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.999414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3085  ABC transporter related  49.57 
 
 		 237 aa  232  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4748  ABC transporter related  49.79 
 
 		 237 aa  231  7.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.597836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  50.85 
 
 		 234 aa  231  8.000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  51.07 
 
 		 243 aa  229  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  47.01 
 
 		 236 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1903  ABC transporter related  51.06 
 
 		 244 aa  229  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.638808  normal  0.412761 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0081  ABC transporter related  49.79 
 
 		 237 aa  229  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  48.51 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2989  ABC transporter related  49.79 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  50.64 
 
 		 234 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  47.21 
 
 		 240 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4367  ABC transporter related  50.21 
 
 		 236 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.583666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  48.73 
 
 		 233 aa  224  9e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  50.43 
 
 		 236 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1618  ABC transporter related  48.94 
 
 		 237 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  48.73 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  48.73 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  49.58 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  45.49 
 
 		 236 aa  222  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  45.49 
 
 		 236 aa  221  6e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50 
 
 		 233 aa  221  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  48.5 
 
 		 231 aa  221  7e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  48.5 
 
 		 231 aa  221  7e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0083  ABC transporter related  48.5 
 
 		 233 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  48.5 
 
 		 235 aa  219  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.09 
 
 		 231 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  48.5 
 
 		 237 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2954  ABC transporter related  46.58 
 
 		 239 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  48.29 
 
 		 234 aa  218  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  49.79 
 
 		 237 aa  217  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  49.79 
 
 		 237 aa  217  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0210  ABC transporter related  44.02 
 
 		 237 aa  215  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  45.53 
 
 		 234 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1333  ABC transporter related  45.06 
 
 		 237 aa  214  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529108  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  47.21 
 
 		 244 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  47.21 
 
 		 244 aa  211  9e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6027  ABC transporter related  50.64 
 
 		 236 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  43.78 
 
 		 231 aa  209  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  45.06 
 
 		 232 aa  209  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  46.78 
 
 		 232 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  45.11 
 
 		 234 aa  208  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  45.06 
 
 		 240 aa  207  9e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3649  ABC transporter-related protein  44.87 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  46.35 
 
 		 246 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  47.21 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  46.35 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1230  ABC transporter-related protein  46.78 
 
 		 238 aa  205  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0056  ABC transporter related  46.78 
 
 		 246 aa  205  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  43.78 
 
 		 234 aa  205  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  45.92 
 
 		 237 aa  204  9e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  44.44 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  44.64 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  46.12 
 
 		 237 aa  202  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  43.1 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5163  ABC transporter related  43.1 
 
 		 236 aa  202  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.726387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  45.49 
 
 		 251 aa  202  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  42.49 
 
 		 256 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  43.4 
 
 		 234 aa  202  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  46.35 
 
 		 233 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  44.64 
 
 		 248 aa  201  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  42.49 
 
 		 237 aa  201  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  43.97 
 
 		 234 aa  201  8e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4074  ABC transporter related  46.45 
 
 		 241 aa  200  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3521  ABC transporter related  49.53 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.295541  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  44.21 
 
 		 484 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  44.92 
 
 		 237 aa  199  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1678  ABC transporter related  43.78 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.92 
 
 		 237 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  44.21 
 
 		 233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  42.8 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  42.24 
 
 		 823 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3121  ABC transporter related  42.67 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  43.78 
 
 		 245 aa  199  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  42.49 
 
 		 237 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>