More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4111 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4111  ABC transporter related  100 
 
 		 248 aa  490  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2716  ABC transporter related  78.54 
 
 		 234 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0337117  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1207  ABC transporter-related protein  71.67 
 
 		 232 aa  323  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  48.85 
 
 		 236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  47.47 
 
 		 234 aa  205  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  45.45 
 
 		 231 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  45.45 
 
 		 231 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 		 231 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  44.6 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  42.31 
 
 		 240 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  45.49 
 
 		 236 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1793  ABC transporter related  43.84 
 
 		 235 aa  194  9e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  43.91 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2954  ABC transporter related  44.64 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  45.06 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  45.74 
 
 		 246 aa  193  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0502  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.7 
 
 		 237 aa  192  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0108614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  46.73 
 
 		 233 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  46.73 
 
 		 233 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  45.37 
 
 		 232 aa  191  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  46.76 
 
 		 235 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  46.26 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3737  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47 
 
 		 234 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  46.34 
 
 		 243 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3207  ABC transporter related  46.51 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.973641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  43.23 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  43.52 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  45.37 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  44.91 
 
 		 232 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  43.95 
 
 		 232 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  46.51 
 
 		 484 aa  189  5e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3649  ABC transporter-related protein  46.19 
 
 		 237 aa  189  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  47.47 
 
 		 233 aa  189  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  44.29 
 
 		 235 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  45.66 
 
 		 230 aa  187  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1230  ABC transporter-related protein  44.7 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  43.98 
 
 		 235 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  47.14 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1099  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.24 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.810395  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  46.45 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  43.72 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  45.37 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  42.33 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3377  ABC transporter related  43.72 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  44.59 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  44.91 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2157  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.52 
 
 		 232 aa  186  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.360084  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6135  ABC transporter related  42.33 
 
 		 238 aa  185  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112796  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0701  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 		 230 aa  185  5e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2052  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 		 230 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0728  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 		 230 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  42.06 
 
 		 232 aa  185  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2180  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.83 
 
 		 230 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.701508  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2561  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 		 230 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.371156  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  42.79 
 
 		 231 aa  184  8e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2742  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.98 
 
 		 232 aa  184  8e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.78 
 
 		 237 aa  184  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  43.72 
 
 		 232 aa  184  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1683  ABC transporter related  42.79 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6326  ABC transporter related  45.28 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1088  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.79 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2189  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.05 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.113026 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  45.95 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0192  ABC transporter related  42.67 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0955  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF, putative  44.91 
 
 		 241 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  44.95 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  43.72 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5755  ABC transporter related  43.93 
 
 		 235 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.805145  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  43.26 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  42.79 
 
 		 237 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  43.87 
 
 		 233 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4008  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.65 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  43.84 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1397  ABC transporter related  43.93 
 
 		 230 aa  183  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  44.13 
 
 		 234 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  43.32 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3131  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.37 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1500  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.37 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.456075  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  44.6 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3107  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.37 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.168461  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  42.4 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0125  ABC transporter related  46.54 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.550206  normal  0.120761 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3071  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.37 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.664903  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2255  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.21 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2057  ABC transporter related  46.22 
 
 		 233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2926  ABC transporter related  43.72 
 
 		 231 aa  182  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1866  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.61 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1321  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.24 
 
 		 237 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2814  ABC transporter related  43.24 
 
 		 237 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0747835 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2496  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.59 
 
 		 232 aa  182  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0491391  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  44.91 
 
 		 235 aa  181  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.17 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1333  ABC transporter related  43.32 
 
 		 237 aa  181  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529108  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0669  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  46.23 
 
 		 234 aa  181  8.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  43.12 
 
 		 233 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2450  ABC transporter related  46.22 
 
 		 233 aa  181  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  42.48 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5146  ABC transporter related  44.39 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  43.32 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  41.85 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>