More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1230 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1230  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 238 aa  473  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1333  ABC transporter related  82.55 
 
 		 237 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529108  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2954  ABC transporter related  70.04 
 
 		 239 aa  332  3e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3649  ABC transporter-related protein  68.91 
 
 		 237 aa  324  8.000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0210  ABC transporter related  64.71 
 
 		 237 aa  315  6e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2989  ABC transporter related  63.03 
 
 		 246 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  63.36 
 
 		 243 aa  302  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1618  ABC transporter related  63.52 
 
 		 237 aa  302  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4748  ABC transporter related  61.37 
 
 		 237 aa  300  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.597836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  62.23 
 
 		 237 aa  299  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1903  ABC transporter related  61.8 
 
 		 244 aa  296  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.638808  normal  0.412761 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0083  ABC transporter related  65.64 
 
 		 233 aa  296  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0081  ABC transporter related  62.01 
 
 		 237 aa  289  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3085  ABC transporter related  57.94 
 
 		 237 aa  279  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  56.65 
 
 		 237 aa  271  4.0000000000000004e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  55.98 
 
 		 236 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4367  ABC transporter related  54.94 
 
 		 236 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.583666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  54.01 
 
 		 240 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  52.36 
 
 		 240 aa  245  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  57.21 
 
 		 230 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  50.85 
 
 		 237 aa  232  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  51.93 
 
 		 232 aa  229  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  52.36 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3170  ABC transporter-related protein  52.34 
 
 		 236 aa  226  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  52.74 
 
 		 237 aa  221  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  50.64 
 
 		 233 aa  221  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  48.09 
 
 		 236 aa  219  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  47.86 
 
 		 237 aa  219  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  48.09 
 
 		 236 aa  218  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3826  ABC transporter related  50.42 
 
 		 237 aa  218  7e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  48.5 
 
 		 232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4606  ABC transporter related  51.06 
 
 		 235 aa  215  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  46.78 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.78 
 
 		 234 aa  213  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0362  ABC transporter related  51.48 
 
 		 243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 239 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1988  ABC transporter related  46.15 
 
 		 236 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.69422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  45.96 
 
 		 234 aa  204  7e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  46.35 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  42.92 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  48.7 
 
 		 238 aa  203  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  47.64 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  47.64 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  47.21 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.64 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 		 232 aa  202  5e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  45.53 
 
 		 239 aa  202  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  42.55 
 
 		 236 aa  201  6e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.06 
 
 		 233 aa  201  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  45.73 
 
 		 241 aa  201  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  43.83 
 
 		 234 aa  201  9e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  44.87 
 
 		 232 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  44.02 
 
 		 232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  41.7 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  47.44 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  48.5 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  48.5 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  48.5 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0632  ABC transporter related  46.61 
 
 		 242 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5703  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.96 
 
 		 238 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5099  ABC transporter related  47.06 
 
 		 229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.999414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  44.64 
 
 		 254 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  44.64 
 
 		 251 aa  198  5e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  47.01 
 
 		 234 aa  198  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  45.11 
 
 		 248 aa  198  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0955  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF, putative  44.73 
 
 		 241 aa  198  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4047  ABC transporter related  47.68 
 
 		 236 aa  197  9e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  47.06 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  47.06 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  45.96 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  47.06 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  44.02 
 
 		 248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0858  ABC transporter related  48.29 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.152569 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  45.53 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  46.22 
 
 		 237 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  46.26 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  46.35 
 
 		 233 aa  195  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0896  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF  44.3 
 
 		 241 aa  195  6e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.54469  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  45.02 
 
 		 243 aa  195  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0179  ABC transporter related  47.44 
 
 		 233 aa  195  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4778  high-affinity branched-chain amino acid transport protein of the ABC transporter ATP binding  48.72 
 
 		 233 aa  194  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000236786  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  44.49 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  43.59 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  44.54 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  42.24 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0056  ABC transporter related  47.44 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  43.1 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2929  ABC transporter related  45.92 
 
 		 230 aa  192  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  42.92 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  43.46 
 
 		 240 aa  192  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2233  ABC transporter related  47.66 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0007  ABC transporter related  43.28 
 
 		 234 aa  191  7e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315079  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3755  ABC transporter ATP-binding protein  43.97 
 
 		 237 aa  191  9e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  42.67 
 
 		 234 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  44.49 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  42.92 
 
 		 234 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  46.67 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  42.49 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  43.4 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>