More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5131 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  100 
 
 		 236 aa  477  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4047  ABC transporter related  68.22 
 
 		 236 aa  337  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3170  ABC transporter-related protein  69.49 
 
 		 236 aa  332  4e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  65.25 
 
 		 236 aa  327  1.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1988  ABC transporter related  62.71 
 
 		 236 aa  317  1e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.69422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  64.14 
 
 		 237 aa  311  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4606  ABC transporter related  64.41 
 
 		 235 aa  305  5.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3826  ABC transporter related  63.98 
 
 		 237 aa  303  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  63.52 
 
 		 234 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0362  ABC transporter related  59.58 
 
 		 243 aa  291  8e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0632  ABC transporter related  59.66 
 
 		 242 aa  282  4.0000000000000003e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  55.79 
 
 		 233 aa  275  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  54.85 
 
 		 237 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  56.41 
 
 		 232 aa  268  4e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  57.94 
 
 		 233 aa  267  8.999999999999999e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  58.8 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  54.43 
 
 		 237 aa  266  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  52.79 
 
 		 232 aa  259  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0179  ABC transporter related  54.51 
 
 		 233 aa  259  4e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  56.6 
 
 		 230 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  52.56 
 
 		 239 aa  248  7e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5099  ABC transporter related  50 
 
 		 229 aa  226  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.999414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  49.15 
 
 		 236 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  50.64 
 
 		 233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  45.76 
 
 		 236 aa  225  6e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  45.76 
 
 		 236 aa  224  8e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  50.43 
 
 		 237 aa  223  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.06 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4367  ABC transporter related  47.88 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.583666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  50.43 
 
 		 234 aa  223  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0210  ABC transporter related  46.35 
 
 		 237 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  50.21 
 
 		 237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  50.21 
 
 		 237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  47.9 
 
 		 235 aa  219  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2954  ABC transporter related  46.78 
 
 		 239 aa  218  6e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  48.5 
 
 		 234 aa  218  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  44.87 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2233  ABC transporter related  49.36 
 
 		 228 aa  217  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  48.74 
 
 		 237 aa  215  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  45.53 
 
 		 240 aa  214  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1333  ABC transporter related  45.11 
 
 		 237 aa  214  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529108  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  48.07 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  48.07 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0858  ABC transporter related  47.26 
 
 		 230 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.152569 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  48.07 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3649  ABC transporter-related protein  45.49 
 
 		 237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6027  ABC transporter related  50.64 
 
 		 236 aa  212  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  44.44 
 
 		 234 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  46.38 
 
 		 237 aa  211  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4748  ABC transporter related  49.34 
 
 		 237 aa  210  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.597836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  45.87 
 
 		 240 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  48.5 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  48.5 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.5 
 
 		 231 aa  208  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1230  ABC transporter-related protein  48.09 
 
 		 238 aa  208  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3085  ABC transporter related  47.46 
 
 		 237 aa  208  6e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  44.64 
 
 		 237 aa  204  7e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  45.96 
 
 		 237 aa  204  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  45.11 
 
 		 484 aa  204  8e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  45.49 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  44.4 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  45.99 
 
 		 238 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5703  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.15 
 
 		 238 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0081  ABC transporter related  46.26 
 
 		 237 aa  201  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  44.12 
 
 		 240 aa  201  9e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2989  ABC transporter related  45.96 
 
 		 246 aa  200  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  43.35 
 
 		 232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  45.53 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  44.59 
 
 		 237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1618  ABC transporter related  45.53 
 
 		 237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  42.98 
 
 		 235 aa  198  5e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1903  ABC transporter related  48.21 
 
 		 244 aa  198  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.638808  normal  0.412761 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  47.01 
 
 		 243 aa  198  7e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  42.37 
 
 		 236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  45.73 
 
 		 235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  39.48 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  45.06 
 
 		 823 aa  195  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0083  ABC transporter related  44.64 
 
 		 233 aa  195  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  43.1 
 
 		 234 aa  194  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3737  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.3 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  42.67 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  43.78 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  43.59 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  44.87 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  43.59 
 
 		 236 aa  192  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  41.1 
 
 		 236 aa  192  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  44.64 
 
 		 823 aa  192  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  42.74 
 
 		 235 aa  191  6e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0545  ABC transporter related  44.26 
 
 		 234 aa  191  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756199 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  42.06 
 
 		 234 aa  191  8e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1931  ABC transporter related  47.64 
 
 		 233 aa  190  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  41.53 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  40.85 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  42.98 
 
 		 254 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  40.77 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  42.31 
 
 		 232 aa  189  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  43.4 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  44.02 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  40.43 
 
 		 236 aa  189  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  40.68 
 
 		 237 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>