More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4002 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  100 
 
 
232 aa  473  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  74.25 
 
 
233 aa  368  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  69.96 
 
 
233 aa  351  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  62.5 
 
 
230 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  59.4 
 
 
239 aa  284  8e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  59.4 
 
 
237 aa  284  9e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  58.97 
 
 
237 aa  281  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  55.6 
 
 
232 aa  280  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.36 
 
 
234 aa  280  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  58.18 
 
 
233 aa  278  6e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  55.79 
 
 
236 aa  272  3e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  56.41 
 
 
236 aa  268  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3170  ABC transporter-related protein  56.65 
 
 
236 aa  266  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0632  ABC transporter related  52.97 
 
 
242 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  53.16 
 
 
237 aa  265  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1988  ABC transporter related  54.08 
 
 
236 aa  264  8.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.69422  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0362  ABC transporter related  54.2 
 
 
243 aa  260  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4047  ABC transporter related  52.77 
 
 
236 aa  254  6e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  52.36 
 
 
234 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4606  ABC transporter related  51.72 
 
 
235 aa  248  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0179  ABC transporter related  53.65 
 
 
233 aa  248  5e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  53.88 
 
 
234 aa  248  5e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3826  ABC transporter related  51.07 
 
 
237 aa  247  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  52.36 
 
 
240 aa  245  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  51.72 
 
 
237 aa  244  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  53.45 
 
 
233 aa  244  9e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  53.45 
 
 
233 aa  244  9e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  53.45 
 
 
233 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  51.52 
 
 
231 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  51.52 
 
 
231 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  50.43 
 
 
233 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  52.79 
 
 
240 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.08 
 
 
231 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2233  ABC transporter related  51.5 
 
 
228 aa  238  5e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  52.36 
 
 
236 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50 
 
 
233 aa  237  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  51.72 
 
 
237 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  51.72 
 
 
237 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4367  ABC transporter related  51.07 
 
 
236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.583666  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  49.78 
 
 
231 aa  232  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0858  ABC transporter related  50 
 
 
230 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.152569 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  48.92 
 
 
234 aa  229  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  47.84 
 
 
243 aa  228  8e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  47.86 
 
 
234 aa  227  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  48.93 
 
 
237 aa  226  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  48.71 
 
 
235 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5099  ABC transporter related  48.71 
 
 
229 aa  224  9e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.999414  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4748  ABC transporter related  48.5 
 
 
237 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.597836  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  47.84 
 
 
237 aa  222  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0081  ABC transporter related  48 
 
 
237 aa  221  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  46.78 
 
 
237 aa  221  9e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  44.02 
 
 
236 aa  219  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1903  ABC transporter related  47.21 
 
 
244 aa  219  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.638808  normal  0.412761 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6027  ABC transporter related  50.43 
 
 
236 aa  217  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3085  ABC transporter related  45.49 
 
 
237 aa  217  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2989  ABC transporter related  45.92 
 
 
246 aa  216  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1333  ABC transporter related  47.64 
 
 
237 aa  215  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529108  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  47.83 
 
 
230 aa  214  5.9999999999999996e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0083  ABC transporter related  48.5 
 
 
233 aa  215  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1618  ABC transporter related  45.06 
 
 
237 aa  213  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  45.69 
 
 
232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  45.69 
 
 
234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  46.12 
 
 
236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2954  ABC transporter related  44.21 
 
 
239 aa  211  7e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  45.66 
 
 
236 aa  211  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1230  ABC transporter-related protein  48.5 
 
 
238 aa  208  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1679  ABC transporter-like protein  46.61 
 
 
234 aa  208  6e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.0768267 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  46.35 
 
 
236 aa  206  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6326  ABC transporter related  47.87 
 
 
231 aa  205  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  45.69 
 
 
484 aa  205  5e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  43.59 
 
 
239 aa  204  9e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  46.98 
 
 
246 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  46.52 
 
 
234 aa  204  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2136  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  46.55 
 
 
243 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3649  ABC transporter-related protein  45.58 
 
 
237 aa  203  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1821  ABC transporter related  46.55 
 
 
243 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  44.64 
 
 
237 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  44.87 
 
 
237 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  43.1 
 
 
234 aa  202  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  46.35 
 
 
234 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  43.93 
 
 
232 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  45.49 
 
 
237 aa  201  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0799  ABC transporter related  43.53 
 
 
240 aa  201  7e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  44.83 
 
 
236 aa  201  8e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  42.67 
 
 
235 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  42.17 
 
 
235 aa  201  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  41.81 
 
 
234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  43.97 
 
 
234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  42.67 
 
 
238 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  43.1 
 
 
234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.78 
 
 
237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  45.96 
 
 
234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  43.1 
 
 
235 aa  199  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  41.81 
 
 
231 aa  199  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  46.95 
 
 
239 aa  199  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  43.1 
 
 
238 aa  199  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0210  ABC transporter related  42.06 
 
 
237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  42.31 
 
 
239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  45.26 
 
 
234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  45.06 
 
 
243 aa  198  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.131918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>