More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0081 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0081  ABC transporter related  100 
 
 
237 aa  472  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0083  ABC transporter related  71.67 
 
 
233 aa  337  7e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2954  ABC transporter related  61.86 
 
 
239 aa  298  5e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3649  ABC transporter-related protein  67.29 
 
 
237 aa  295  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0210  ABC transporter related  62.56 
 
 
237 aa  295  6e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  59.92 
 
 
237 aa  293  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1333  ABC transporter related  59.92 
 
 
237 aa  292  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529108  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  57.69 
 
 
243 aa  282  4.0000000000000003e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4748  ABC transporter related  56.12 
 
 
237 aa  280  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.597836  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1230  ABC transporter-related protein  66.34 
 
 
238 aa  280  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  56.54 
 
 
237 aa  280  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1618  ABC transporter related  56.96 
 
 
237 aa  275  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1903  ABC transporter related  59.21 
 
 
244 aa  274  8e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.638808  normal  0.412761 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2989  ABC transporter related  58.33 
 
 
246 aa  273  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3085  ABC transporter related  55.7 
 
 
237 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  55.9 
 
 
236 aa  252  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4367  ABC transporter related  55.02 
 
 
236 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.583666  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  52.36 
 
 
236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4606  ABC transporter related  55.79 
 
 
235 aa  241  7.999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  49.79 
 
 
240 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  52.42 
 
 
240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  56.54 
 
 
230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  50.64 
 
 
233 aa  229  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.79 
 
 
234 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  48.12 
 
 
239 aa  227  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  51.5 
 
 
233 aa  227  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  48 
 
 
232 aa  221  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  47.03 
 
 
237 aa  221  7e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  46.61 
 
 
237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  45.3 
 
 
236 aa  219  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  48.5 
 
 
234 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  50.44 
 
 
237 aa  214  9e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0632  ABC transporter related  48 
 
 
242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  47.64 
 
 
233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0362  ABC transporter related  50 
 
 
243 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3170  ABC transporter-related protein  47.21 
 
 
236 aa  209  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  46.58 
 
 
234 aa  209  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  47.64 
 
 
232 aa  208  7e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0179  ABC transporter related  47.21 
 
 
233 aa  207  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  46.26 
 
 
236 aa  205  6e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  46.26 
 
 
236 aa  204  8e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4778  high-affinity branched-chain amino acid transport protein of the ABC transporter ATP binding  47.44 
 
 
233 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000236786  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.77 
 
 
231 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3826  ABC transporter related  46.84 
 
 
237 aa  203  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  47.32 
 
 
231 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  47.32 
 
 
231 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  46.15 
 
 
234 aa  202  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  46.26 
 
 
236 aa  201  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  47.39 
 
 
237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0858  ABC transporter related  51.64 
 
 
230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.152569 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  44.83 
 
 
231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1988  ABC transporter related  43.35 
 
 
236 aa  199  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.69422  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4010  ABC transporter related  49.15 
 
 
233 aa  198  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  43.78 
 
 
233 aa  198  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  45.73 
 
 
232 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  48.6 
 
 
237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  45.06 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  48.6 
 
 
237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4047  ABC transporter related  49.54 
 
 
236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  43.78 
 
 
237 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  42.41 
 
 
237 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.78 
 
 
233 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  42.92 
 
 
251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  45.73 
 
 
238 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5099  ABC transporter related  48.13 
 
 
229 aa  194  8.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.999414  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  41.42 
 
 
236 aa  193  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  44.21 
 
 
233 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2450  ABC transporter related  45.73 
 
 
233 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  44.21 
 
 
233 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4816  hypothetical protein  47.23 
 
 
739 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2057  ABC transporter related  45.73 
 
 
233 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  42.62 
 
 
234 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5146  ABC transporter related  47.51 
 
 
245 aa  192  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1583  ABC transporter related  48.32 
 
 
240 aa  191  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457294  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  44.21 
 
 
233 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.85 
 
 
238 aa  191  8e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3728  ABC transporter related  39.32 
 
 
236 aa  190  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0255597  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  41.77 
 
 
234 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  42.06 
 
 
238 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  45.7 
 
 
241 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5703  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.3 
 
 
238 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  39.91 
 
 
235 aa  189  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1115  ABC transporter related  42.98 
 
 
248 aa  189  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000583905  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  42.44 
 
 
246 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  41.38 
 
 
234 aa  188  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1590  ABC transporter related  47.9 
 
 
240 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  41 
 
 
234 aa  189  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  46.79 
 
 
243 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  44.21 
 
 
235 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  42.98 
 
 
233 aa  188  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  40.85 
 
 
254 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1722  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 
248 aa  188  5.999999999999999e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  45.65 
 
 
240 aa  188  7e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  44.44 
 
 
234 aa  187  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  42.49 
 
 
239 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  40.93 
 
 
248 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2756  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.78 
 
 
234 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.211076  normal  0.384438 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6435  ABC transporter related  40.93 
 
 
234 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942423  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3370  ABC transporter related  41.77 
 
 
241 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  43.16 
 
 
838 aa  186  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>