More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3170 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3170  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 236 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  69.49 
 
 		 236 aa  347  7e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1988  ABC transporter related  68.22 
 
 		 236 aa  338  4e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.69422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  66.09 
 
 		 234 aa  330  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  67.8 
 
 		 236 aa  328  3e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4047  ABC transporter related  66.53 
 
 		 236 aa  317  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4606  ABC transporter related  67.37 
 
 		 235 aa  314  6e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3826  ABC transporter related  65.96 
 
 		 237 aa  310  2e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  66.24 
 
 		 237 aa  303  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0632  ABC transporter related  62.18 
 
 		 242 aa  287  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  57.94 
 
 		 233 aa  286  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0362  ABC transporter related  60.25 
 
 		 243 aa  281  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  59.49 
 
 		 237 aa  281  9e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  57.51 
 
 		 232 aa  274  9e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  57.56 
 
 		 237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  58.55 
 
 		 239 aa  269  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  61.8 
 
 		 233 aa  268  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  59.66 
 
 		 233 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0179  ABC transporter related  55.79 
 
 		 233 aa  265  5e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  60.94 
 
 		 230 aa  262  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  56.22 
 
 		 232 aa  256  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  53.39 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  51.49 
 
 		 237 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  53.81 
 
 		 236 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4367  ABC transporter related  52.97 
 
 		 236 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.583666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5099  ABC transporter related  52.97 
 
 		 229 aa  230  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.999414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2954  ABC transporter related  51.5 
 
 		 239 aa  229  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1333  ABC transporter related  51.06 
 
 		 237 aa  228  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529108  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2233  ABC transporter related  51.06 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0210  ABC transporter related  48.93 
 
 		 237 aa  224  8e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0858  ABC transporter related  52.32 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.152569 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  43.16 
 
 		 236 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  47.44 
 
 		 234 aa  220  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3085  ABC transporter related  48.94 
 
 		 237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0083  ABC transporter related  49.36 
 
 		 233 aa  218  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2989  ABC transporter related  48.5 
 
 		 246 aa  218  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1230  ABC transporter-related protein  52.34 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  50.43 
 
 		 234 aa  217  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4748  ABC transporter related  47.21 
 
 		 237 aa  217  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.597836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  47.03 
 
 		 240 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1618  ABC transporter related  47.64 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3649  ABC transporter-related protein  47.64 
 
 		 237 aa  216  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  49.36 
 
 		 234 aa  214  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  48.71 
 
 		 243 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1903  ABC transporter related  47.64 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.638808  normal  0.412761 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  49.58 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  42.8 
 
 		 236 aa  210  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  42.8 
 
 		 236 aa  210  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0081  ABC transporter related  47.21 
 
 		 237 aa  209  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  46.78 
 
 		 233 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  47.46 
 
 		 235 aa  209  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  48.94 
 
 		 237 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  48.94 
 
 		 237 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  46.81 
 
 		 237 aa  208  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  48.07 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  48.07 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  48.07 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5703  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.41 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  46.19 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.35 
 
 		 233 aa  204  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  44.92 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  46.41 
 
 		 238 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  45.15 
 
 		 240 aa  202  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0056  ABC transporter related  48.72 
 
 		 246 aa  201  9e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  42.49 
 
 		 236 aa  200  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  43.53 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  44.64 
 
 		 231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  46.32 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  44.64 
 
 		 231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  44.68 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.21 
 
 		 231 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  44.64 
 
 		 254 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  43.88 
 
 		 240 aa  198  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6027  ABC transporter related  48.07 
 
 		 236 aa  198  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  46.78 
 
 		 234 aa  198  7e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0383  ABC transporter related  44.83 
 
 		 241 aa  197  7.999999999999999e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  46.35 
 
 		 244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  41.95 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  47.64 
 
 		 822 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  46.35 
 
 		 244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0799  ABC transporter related  44.83 
 
 		 240 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  40.34 
 
 		 234 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  44.21 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  44.64 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.67 
 
 		 233 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  41.63 
 
 		 232 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  40.08 
 
 		 242 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  44.87 
 
 		 233 aa  195  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  43.97 
 
 		 237 aa  195  6e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  43.97 
 
 		 237 aa  195  6e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  41.77 
 
 		 240 aa  194  7e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  41.45 
 
 		 236 aa  194  9e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  42.24 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  42.02 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  42.06 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0477  ABC transporter related  42.86 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  43.16 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5343  ABC transporter related  41.03 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  43.46 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  42.24 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>