More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0655 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  100 
 
 
231 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  100 
 
 
231 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  99.13 
 
 
231 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  65.79 
 
 
231 aa  325  5e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  64.78 
 
 
234 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  62.17 
 
 
237 aa  298  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  61.74 
 
 
233 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  61.14 
 
 
233 aa  297  9e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  63.48 
 
 
237 aa  297  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  63.48 
 
 
237 aa  297  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  61.3 
 
 
233 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  61.3 
 
 
233 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  60.7 
 
 
233 aa  294  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  62.45 
 
 
235 aa  293  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  59.13 
 
 
234 aa  289  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  59.13 
 
 
234 aa  282  4.0000000000000003e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  59.57 
 
 
237 aa  280  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6027  ABC transporter related  62.88 
 
 
236 aa  279  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  53.88 
 
 
233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  51.52 
 
 
232 aa  241  7e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  53.04 
 
 
232 aa  238  6.999999999999999e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  51.95 
 
 
233 aa  237  9e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  53.42 
 
 
236 aa  236  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  52.97 
 
 
236 aa  236  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  51.54 
 
 
230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  51.29 
 
 
232 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  49.15 
 
 
234 aa  230  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  48.26 
 
 
237 aa  229  2e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  55.29 
 
 
237 aa  228  9e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  45.73 
 
 
236 aa  227  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  48.71 
 
 
234 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  55.29 
 
 
246 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  47.23 
 
 
240 aa  226  3e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  54.81 
 
 
248 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  46.09 
 
 
231 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  45.22 
 
 
231 aa  225  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  48.5 
 
 
235 aa  223  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4748  ABC transporter related  46.35 
 
 
237 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.597836  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  54.81 
 
 
244 aa  222  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1177  ABC transporter related  51.08 
 
 
236 aa  222  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496575  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  54.81 
 
 
244 aa  222  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  44.21 
 
 
236 aa  222  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1903  ABC transporter related  47.21 
 
 
244 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.638808  normal  0.412761 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.5 
 
 
234 aa  221  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  49.78 
 
 
235 aa  221  7e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1793  ABC transporter related  45.3 
 
 
235 aa  220  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  45.76 
 
 
236 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2574  ABC transporter related  46.09 
 
 
231 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261355  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2989  ABC transporter related  45.92 
 
 
246 aa  220  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2926  ABC transporter related  46.09 
 
 
231 aa  220  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  45.73 
 
 
236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  56.25 
 
 
230 aa  220  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  47.39 
 
 
234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  46.78 
 
 
237 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  45.22 
 
 
231 aa  218  5e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1618  ABC transporter related  45.06 
 
 
237 aa  218  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  51.92 
 
 
251 aa  218  6e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  51.92 
 
 
239 aa  218  7e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  46.81 
 
 
239 aa  218  7e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  52.4 
 
 
240 aa  218  7.999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  47.86 
 
 
236 aa  218  7.999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1683  ABC transporter related  45.22 
 
 
231 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  48.46 
 
 
243 aa  217  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  46.81 
 
 
238 aa  216  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  47.83 
 
 
234 aa  216  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  51.9 
 
 
233 aa  216  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0056  ABC transporter related  52.88 
 
 
246 aa  216  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  52.56 
 
 
246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1678  ABC transporter related  52.63 
 
 
239 aa  215  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  45.49 
 
 
234 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3305  ABC transporter component  52.4 
 
 
242 aa  214  8e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0937  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50.24 
 
 
240 aa  214  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0476932  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  50.48 
 
 
254 aa  214  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  46.58 
 
 
237 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  46.52 
 
 
232 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2929  ABC transporter related  49.57 
 
 
230 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  47.21 
 
 
235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  47.01 
 
 
235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1821  ABC transporter related  49.13 
 
 
243 aa  212  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  43.1 
 
 
237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  45.96 
 
 
239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  45.92 
 
 
235 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2136  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  49.13 
 
 
243 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  46.09 
 
 
234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  45.49 
 
 
233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  46.52 
 
 
234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4606  ABC transporter related  49.14 
 
 
235 aa  212  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  43.78 
 
 
238 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  43.97 
 
 
239 aa  211  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  43.97 
 
 
239 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  50.71 
 
 
233 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  47.86 
 
 
238 aa  211  5.999999999999999e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.22 
 
 
247 aa  211  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 
238 aa  211  7e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  47.66 
 
 
239 aa  211  7e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1841  ABC transporter related  44.78 
 
 
231 aa  211  7.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  43.91 
 
 
232 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  45.3 
 
 
236 aa  210  1e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1400  ABC transporter related  48.28 
 
 
251 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  47.68 
 
 
238 aa  210  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>