More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4397 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  100 
 
 
233 aa  477  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.66 
 
 
234 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  61.82 
 
 
230 aa  280  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  57.26 
 
 
237 aa  280  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  59.56 
 
 
233 aa  280  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3170  ABC transporter-related protein  57.94 
 
 
236 aa  279  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  58.67 
 
 
233 aa  278  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  58.18 
 
 
232 aa  278  6e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  57.51 
 
 
236 aa  276  3e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  55.79 
 
 
236 aa  275  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  55.56 
 
 
237 aa  275  5e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0179  ABC transporter related  57.51 
 
 
233 aa  274  9e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  56.65 
 
 
232 aa  271  6e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4047  ABC transporter related  56.22 
 
 
236 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1988  ABC transporter related  53.65 
 
 
236 aa  263  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.69422  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  54.43 
 
 
237 aa  261  6e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3826  ABC transporter related  54.94 
 
 
237 aa  260  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0858  ABC transporter related  56.84 
 
 
230 aa  258  7e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.152569 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5099  ABC transporter related  58.3 
 
 
229 aa  256  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.999414  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  53.85 
 
 
239 aa  255  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4606  ABC transporter related  53.65 
 
 
235 aa  249  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0632  ABC transporter related  51.69 
 
 
242 aa  241  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0362  ABC transporter related  50.63 
 
 
243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2233  ABC transporter related  52.14 
 
 
228 aa  234  8e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1333  ABC transporter related  48.93 
 
 
237 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529108  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  47.64 
 
 
236 aa  226  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  47.21 
 
 
236 aa  226  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  49.36 
 
 
240 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  49.36 
 
 
234 aa  221  6e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  48.28 
 
 
234 aa  220  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  47.64 
 
 
234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  48.28 
 
 
234 aa  219  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  48.07 
 
 
233 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  46.15 
 
 
236 aa  218  5e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.5 
 
 
233 aa  218  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  46.35 
 
 
237 aa  217  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0083  ABC transporter related  48.07 
 
 
233 aa  217  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  47.64 
 
 
233 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  47.64 
 
 
233 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  48.5 
 
 
235 aa  217  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0210  ABC transporter related  45.06 
 
 
237 aa  217  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  48.5 
 
 
240 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  46.35 
 
 
234 aa  216  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  45.73 
 
 
234 aa  216  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0799  ABC transporter related  45.73 
 
 
240 aa  216  4e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1903  ABC transporter related  48.02 
 
 
244 aa  215  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.638808  normal  0.412761 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  48.93 
 
 
237 aa  214  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  45.92 
 
 
236 aa  214  8e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  47.64 
 
 
233 aa  214  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  48.93 
 
 
237 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  48.93 
 
 
237 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0081  ABC transporter related  47.64 
 
 
237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  46.55 
 
 
237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.49 
 
 
231 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  45.49 
 
 
231 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  44.1 
 
 
232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  45.92 
 
 
235 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  45.49 
 
 
231 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  45.49 
 
 
231 aa  212  4.9999999999999996e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  42.49 
 
 
236 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  44.87 
 
 
237 aa  210  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  43.78 
 
 
237 aa  210  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  46.12 
 
 
243 aa  209  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  46.12 
 
 
233 aa  209  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  42.49 
 
 
236 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.06 
 
 
234 aa  209  4e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  47.84 
 
 
242 aa  208  5e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 
234 aa  207  8e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  45.49 
 
 
235 aa  207  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4748  ABC transporter related  45.49 
 
 
237 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.597836  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  44.21 
 
 
234 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  43.44 
 
 
252 aa  206  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.59 
 
 
237 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1230  ABC transporter-related protein  46.78 
 
 
238 aa  206  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  43.88 
 
 
238 aa  206  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  46.78 
 
 
236 aa  205  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2989  ABC transporter related  44.64 
 
 
246 aa  205  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  45.8 
 
 
238 aa  205  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1002  ABC transporter related  47.01 
 
 
238 aa  205  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  45.26 
 
 
823 aa  204  7e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  44.68 
 
 
244 aa  204  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  45.3 
 
 
235 aa  204  7e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1618  ABC transporter related  45.81 
 
 
237 aa  204  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  45.38 
 
 
238 aa  204  8e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  45.38 
 
 
238 aa  204  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  46.15 
 
 
243 aa  204  9e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0056  ABC transporter related  44.64 
 
 
246 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0545  ABC transporter related  45.92 
 
 
234 aa  204  1e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.699298  hitchhiker  0.000807716 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4367  ABC transporter related  46.35 
 
 
236 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.583666  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  43.59 
 
 
237 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.12 
 
 
247 aa  203  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  45.26 
 
 
823 aa  203  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0338  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.55 
 
 
235 aa  203  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0477  ABC transporter related  44.54 
 
 
238 aa  203  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  43.35 
 
 
254 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3751  ABC transporter related  43.16 
 
 
234 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3085  ABC transporter related  42.49 
 
 
237 aa  203  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  44.96 
 
 
247 aa  203  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  44.64 
 
 
234 aa  203  2e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  42.92 
 
 
234 aa  203  2e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>