More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4207 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  100 
 
 		 232 aa  461  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  55.6 
 
 		 232 aa  280  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  57.69 
 
 		 237 aa  274  7e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  56.84 
 
 		 237 aa  272  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  56.65 
 
 		 233 aa  271  6e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  57.51 
 
 		 233 aa  270  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  56.6 
 
 		 239 aa  269  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  57.94 
 
 		 233 aa  268  5e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.22 
 
 		 234 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  59.13 
 
 		 230 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  52.79 
 
 		 236 aa  259  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  55.36 
 
 		 236 aa  257  9e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0179  ABC transporter related  54.51 
 
 		 233 aa  254  7e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3170  ABC transporter-related protein  55.79 
 
 		 236 aa  250  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5099  ABC transporter related  56.47 
 
 		 229 aa  249  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.999414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2233  ABC transporter related  54.08 
 
 		 228 aa  244  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  54.01 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0858  ABC transporter related  54.7 
 
 		 230 aa  240  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.152569 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4606  ABC transporter related  53.02 
 
 		 235 aa  240  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4047  ABC transporter related  51.93 
 
 		 236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1988  ABC transporter related  48.5 
 
 		 236 aa  238  5.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.69422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0632  ABC transporter related  52.12 
 
 		 242 aa  237  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3826  ABC transporter related  52.36 
 
 		 237 aa  236  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 236 aa  229  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  49.36 
 
 		 240 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4367  ABC transporter related  51.07 
 
 		 236 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.583666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0362  ABC transporter related  50.63 
 
 		 243 aa  227  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1230  ABC transporter-related protein  51.93 
 
 		 238 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  50.21 
 
 		 236 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  50.43 
 
 		 484 aa  223  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2989  ABC transporter related  51.34 
 
 		 246 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1903  ABC transporter related  47.64 
 
 		 244 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.638808  normal  0.412761 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1333  ABC transporter related  50.21 
 
 		 237 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529108  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  48.07 
 
 		 240 aa  221  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1618  ABC transporter related  51.34 
 
 		 237 aa  221  7e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4748  ABC transporter related  49.78 
 
 		 237 aa  221  9e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.597836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3085  ABC transporter related  46.78 
 
 		 237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  48.07 
 
 		 237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  46.55 
 
 		 243 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  48.71 
 
 		 234 aa  214  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  46.55 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  44.64 
 
 		 237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  46.58 
 
 		 234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  46.12 
 
 		 234 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  46.55 
 
 		 231 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  46.55 
 
 		 231 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  45.26 
 
 		 232 aa  210  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0210  ABC transporter related  47.64 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.12 
 
 		 231 aa  208  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0081  ABC transporter related  47.64 
 
 		 237 aa  208  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0056  ABC transporter related  48.71 
 
 		 246 aa  207  9e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2954  ABC transporter related  47.64 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  45.02 
 
 		 231 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  48.71 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3649  ABC transporter-related protein  48.07 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  47.86 
 
 		 230 aa  205  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  49.14 
 
 		 246 aa  205  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  48.71 
 
 		 244 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  46.12 
 
 		 234 aa  204  8e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  47.26 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  45.99 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  47.26 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  43.1 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  43.97 
 
 		 248 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  45.26 
 
 		 233 aa  201  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  45.26 
 
 		 233 aa  201  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2717  ABC transporter related  47.84 
 
 		 231 aa  201  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  43.53 
 
 		 248 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  46.12 
 
 		 237 aa  201  7e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  44.75 
 
 		 236 aa  201  7e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  43.53 
 
 		 248 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  47.7 
 
 		 238 aa  201  9e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  47.7 
 
 		 238 aa  201  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  45.26 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0083  ABC transporter related  45.92 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0566  ABC transporter related  45.19 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.328556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  45.26 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  43.84 
 
 		 236 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  43.16 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  45.26 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  45.69 
 
 		 233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  47.7 
 
 		 238 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  41.81 
 
 		 232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  41.38 
 
 		 234 aa  198  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  43.78 
 
 		 234 aa  197  7.999999999999999e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0545  ABC transporter related  46.35 
 
 		 234 aa  197  7.999999999999999e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.699298  hitchhiker  0.000807716 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  43.53 
 
 		 248 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  44.64 
 
 		 239 aa  197  9e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  46.55 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  46.55 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2929  ABC transporter related  46.12 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2136  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  45.69 
 
 		 243 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  43.1 
 
 		 240 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  43.35 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  45.06 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.64 
 
 		 236 aa  196  3e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1821  ABC transporter related  45.69 
 
 		 243 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  42.06 
 
 		 236 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1678  ABC transporter related  44.4 
 
 		 239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0007  ABC transporter related  42.86 
 
 		 234 aa  195  5.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>