More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2891 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  100 
 
 
240 aa  472  1e-132  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  54.7 
 
 
238 aa  245  4e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  50.64 
 
 
237 aa  232  4.0000000000000004e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.86 
 
 
234 aa  226  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  47.23 
 
 
231 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  47.23 
 
 
231 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  48.93 
 
 
235 aa  225  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.23 
 
 
231 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  49.79 
 
 
234 aa  224  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0338  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.09 
 
 
235 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  47.48 
 
 
237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  47.48 
 
 
237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3737  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.15 
 
 
234 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  47.21 
 
 
233 aa  218  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  47.21 
 
 
233 aa  218  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  48.5 
 
 
231 aa  218  8.999999999999998e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  47.64 
 
 
232 aa  217  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  46.78 
 
 
233 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  46.22 
 
 
237 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3751  ABC transporter related  46.15 
 
 
234 aa  216  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  47.21 
 
 
232 aa  215  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  46.35 
 
 
234 aa  215  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4171  ABC transporter related  45.57 
 
 
231 aa  214  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.78 
 
 
233 aa  214  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  46.67 
 
 
248 aa  214  9e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  46.35 
 
 
233 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  45.83 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  45.92 
 
 
234 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  46.12 
 
 
235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.97 
 
 
235 aa  212  3.9999999999999995e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  47.88 
 
 
232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  44.83 
 
 
234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1284  ABC transporter related  47.44 
 
 
234 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275207  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  47.44 
 
 
234 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3554  ABC transporter related  46.58 
 
 
234 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.256863  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  45 
 
 
237 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  47.21 
 
 
234 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  44.49 
 
 
234 aa  209  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  46.5 
 
 
237 aa  209  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  46.35 
 
 
232 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  44.92 
 
 
254 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.19 
 
 
234 aa  209  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  45.96 
 
 
233 aa  209  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  49.58 
 
 
246 aa  209  4e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  45.87 
 
 
234 aa  208  5e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  45.34 
 
 
234 aa  207  9e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  44.07 
 
 
259 aa  207  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.06 
 
 
234 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0223  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.73 
 
 
241 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0851652  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  46.41 
 
 
237 aa  207  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  46.35 
 
 
233 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  46.19 
 
 
248 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  46.41 
 
 
238 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  42.24 
 
 
234 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  46.41 
 
 
238 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  45.92 
 
 
232 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4568  ABC transporter related  43.35 
 
 
232 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  46.03 
 
 
256 aa  205  4e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  44.87 
 
 
235 aa  205  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  47.41 
 
 
242 aa  205  5e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6027  ABC transporter related  46.15 
 
 
236 aa  205  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  45.96 
 
 
237 aa  205  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  45.38 
 
 
237 aa  205  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  42.06 
 
 
238 aa  204  8e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  44.87 
 
 
235 aa  204  8e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  46.03 
 
 
237 aa  204  9e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 
234 aa  204  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  42.92 
 
 
233 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  45.73 
 
 
238 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  43.64 
 
 
235 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1890  ABC transporter related  44.02 
 
 
239 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.865524  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  45.34 
 
 
251 aa  204  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  46.25 
 
 
236 aa  204  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4793  ABC transporter related  46.35 
 
 
233 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.262545  normal  0.126622 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  45.76 
 
 
239 aa  203  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  45.34 
 
 
235 aa  203  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  42.26 
 
 
236 aa  203  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  44.07 
 
 
248 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6215  ABC transporter related  42.98 
 
 
250 aa  202  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  44.02 
 
 
237 aa  202  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  41.84 
 
 
236 aa  202  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  43.97 
 
 
233 aa  202  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  43.53 
 
 
233 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  43.16 
 
 
236 aa  202  4e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0955  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF, putative  46.64 
 
 
241 aa  201  6e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  41.63 
 
 
233 aa  201  6e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  42.49 
 
 
231 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0731  ABC transporter related  46.12 
 
 
237 aa  201  7e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0545  ABC transporter related  46.15 
 
 
234 aa  201  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.756199 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  42.8 
 
 
237 aa  201  8e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  45.73 
 
 
244 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  44.12 
 
 
236 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  45.73 
 
 
244 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  43.64 
 
 
236 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26090  ABC transporter, ATP-binding protein  45.73 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0561039  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  42.02 
 
 
252 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  44.07 
 
 
233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  44.4 
 
 
233 aa  199  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1993  ABC transporter related  45.3 
 
 
239 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535094  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0475  ABC transporter related  45.06 
 
 
233 aa  199  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>