More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1244 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  100 
 
 		 236 aa  472  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  88.56 
 
 		 236 aa  421  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  63.33 
 
 		 252 aa  298  5e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  60.94 
 
 		 237 aa  296  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  60.52 
 
 		 237 aa  294  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  61.76 
 
 		 244 aa  291  8e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  59.23 
 
 		 237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  59.48 
 
 		 234 aa  282  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  58.19 
 
 		 234 aa  281  9e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  58.19 
 
 		 234 aa  279  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  60.08 
 
 		 259 aa  268  5.9999999999999995e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  59.66 
 
 		 259 aa  266  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  57.98 
 
 		 536 aa  264  8.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  49.79 
 
 		 236 aa  250  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  48.93 
 
 		 232 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1177  ABC transporter related  54.31 
 
 		 236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  49.79 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.07 
 
 		 238 aa  230  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  49.79 
 
 		 233 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  49.79 
 
 		 233 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  47.01 
 
 		 238 aa  228  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.64 
 
 		 238 aa  226  3e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  49.36 
 
 		 233 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  49.15 
 
 		 231 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1683  ABC transporter related  49.15 
 
 		 231 aa  224  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3664  ABC transporter component  48.93 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  47.66 
 
 		 231 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  47.44 
 
 		 231 aa  222  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1853  ABC transporter-related protein  50.42 
 
 		 235 aa  219  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  46.81 
 
 		 232 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4171  ABC transporter related  47.66 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4568  ABC transporter related  46.38 
 
 		 232 aa  215  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2574  ABC transporter related  46.35 
 
 		 231 aa  215  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261355  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  45.92 
 
 		 233 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  47.21 
 
 		 234 aa  214  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  48.29 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  49.15 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  45.58 
 
 		 236 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1793  ABC transporter related  46.64 
 
 		 235 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  47.01 
 
 		 239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  47.44 
 
 		 237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  47.44 
 
 		 231 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  45.13 
 
 		 236 aa  211  4.9999999999999996e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.49 
 
 		 233 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1841  ABC transporter related  45.92 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  42.49 
 
 		 233 aa  209  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  47.21 
 
 		 237 aa  207  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1403  ABC transporter related  46.15 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668018  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  42.31 
 
 		 236 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  46.58 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  46.58 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.16 
 
 		 231 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  42.49 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  44.02 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2926  ABC transporter related  45.06 
 
 		 231 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  42.49 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  43.1 
 
 		 231 aa  205  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  45.73 
 
 		 238 aa  205  4e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2930  ABC transporter-related protein  46.78 
 
 		 231 aa  206  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.208893  normal  0.372931 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  44.02 
 
 		 239 aa  205  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  47.62 
 
 		 243 aa  205  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  45.34 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0796  ABC transporter related  45.73 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  41.88 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  46.58 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  44.02 
 
 		 237 aa  202  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  41.45 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  45.76 
 
 		 235 aa  202  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  44.92 
 
 		 240 aa  202  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  46.78 
 
 		 246 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  46.78 
 
 		 234 aa  202  5e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  45.73 
 
 		 232 aa  202  5e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5343  ABC transporter related  45.96 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  44.73 
 
 		 237 aa  201  7e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  44.64 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2989  ABC transporter related  42.13 
 
 		 246 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1321  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.49 
 
 		 237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  46.35 
 
 		 244 aa  198  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4748  ABC transporter related  41.63 
 
 		 237 aa  198  7e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.597836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1908  ABC transporter related  44.02 
 
 		 254 aa  197  7.999999999999999e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.240732 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6326  ABC transporter related  43.22 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  44.21 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  43.35 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  45.06 
 
 		 248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  46.64 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  45.92 
 
 		 244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  43.4 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  45.73 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2814  ABC transporter related  44.73 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0747835 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  45.02 
 
 		 237 aa  196  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1618  ABC transporter related  41.2 
 
 		 237 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4056  ABC transporter related  44.92 
 
 		 240 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  44.21 
 
 		 251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1903  ABC transporter related  42.49 
 
 		 244 aa  195  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.638808  normal  0.412761 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.56 
 
 		 235 aa  195  5.000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  47.87 
 
 		 230 aa  195  6e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5099  ABC transporter related  44.49 
 
 		 229 aa  195  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.999414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  40.77 
 
 		 237 aa  195  6e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  43.29 
 
 		 233 aa  194  8.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  42.8 
 
 		 240 aa  194  9e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>