More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1903 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1903  ABC transporter related  100 
 
 		 244 aa  496  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.638808  normal  0.412761 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4748  ABC transporter related  88.09 
 
 		 237 aa  432  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.597836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2989  ABC transporter related  87.61 
 
 		 246 aa  428  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1618  ABC transporter related  86.38 
 
 		 237 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  76.45 
 
 		 243 aa  374  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  63.4 
 
 		 237 aa  316  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  64.26 
 
 		 237 aa  310  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3085  ABC transporter related  62.98 
 
 		 237 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1333  ABC transporter related  63.09 
 
 		 237 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529108  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1230  ABC transporter-related protein  61.8 
 
 		 238 aa  284  9e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0083  ABC transporter related  59.83 
 
 		 233 aa  279  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  58.37 
 
 		 236 aa  278  4e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3649  ABC transporter-related protein  57.45 
 
 		 237 aa  277  9e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4367  ABC transporter related  57.26 
 
 		 236 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.583666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0081  ABC transporter related  59.21 
 
 		 237 aa  274  8e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2954  ABC transporter related  55.32 
 
 		 239 aa  271  8.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0210  ABC transporter related  52.34 
 
 		 237 aa  264  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  54.47 
 
 		 240 aa  258  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  53.65 
 
 		 240 aa  248  6e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  50.64 
 
 		 236 aa  233  3e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.06 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  48.72 
 
 		 237 aa  227  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4606  ABC transporter related  52.36 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  48.72 
 
 		 237 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  49.78 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  48.75 
 
 		 239 aa  222  4e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  48.9 
 
 		 233 aa  222  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  47.21 
 
 		 231 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  47.64 
 
 		 232 aa  222  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  47.21 
 
 		 231 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  50.67 
 
 		 230 aa  221  7e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.21 
 
 		 231 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  47.21 
 
 		 232 aa  219  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  46.58 
 
 		 231 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  48.02 
 
 		 233 aa  215  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3826  ABC transporter related  49.79 
 
 		 237 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3170  ABC transporter-related protein  47.64 
 
 		 236 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  48.46 
 
 		 234 aa  212  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  45.73 
 
 		 234 aa  211  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  45.3 
 
 		 233 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1988  ABC transporter related  46.38 
 
 		 236 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.69422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  45.3 
 
 		 233 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  44.87 
 
 		 233 aa  208  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  44.87 
 
 		 233 aa  208  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  44.87 
 
 		 236 aa  208  6e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  45.06 
 
 		 234 aa  207  8e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0179  ABC transporter related  47.86 
 
 		 233 aa  207  9e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.87 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  46.35 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  47.6 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  45.49 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  43.78 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0362  ABC transporter related  47.11 
 
 		 243 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  44.21 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0632  ABC transporter related  44.81 
 
 		 242 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0858  ABC transporter related  49.57 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.152569 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  45.06 
 
 		 236 aa  202  5e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 238 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5099  ABC transporter related  45.06 
 
 		 229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.999414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  48.21 
 
 		 236 aa  198  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  45.06 
 
 		 237 aa  198  7e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  45.06 
 
 		 237 aa  198  7e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1177  ABC transporter related  46.41 
 
 		 236 aa  198  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  42.11 
 
 		 236 aa  197  9e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  46.05 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  43.78 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  42.49 
 
 		 236 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  43.85 
 
 		 246 aa  194  8.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  43.64 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  46.41 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  42.92 
 
 		 238 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1619  ABC transporter related  46.58 
 
 		 244 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5326  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.01 
 
 		 243 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4047  ABC transporter related  47.44 
 
 		 236 aa  192  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4816  hypothetical protein  46.38 
 
 		 739 aa  193  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2084  ABC transporter related  43.62 
 
 		 245 aa  192  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  43.48 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  43.35 
 
 		 236 aa  192  5e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.49 
 
 		 235 aa  192  6e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  43.35 
 
 		 235 aa  191  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  45.73 
 
 		 238 aa  191  7e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  40.34 
 
 		 235 aa  191  7e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  44.3 
 
 		 234 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  44.21 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  43.86 
 
 		 234 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  40.77 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  42.55 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2233  ABC transporter related  44.87 
 
 		 228 aa  189  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4333  ABC transporter related  45.3 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.175987  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  42.13 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  41.85 
 
 		 237 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  40.77 
 
 		 240 aa  189  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0007  ABC transporter related  42.13 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315079  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  44.93 
 
 		 239 aa  189  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  42.06 
 
 		 231 aa  188  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.41 
 
 		 237 aa  188  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3903  ABC transporter related  41.98 
 
 		 257 aa  188  8e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.784547  normal  0.979503 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3684  ABC transporter related  45.38 
 
 		 246 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  44.49 
 
 		 234 aa  188  9e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>