More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2808 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  100 
 
 		 232 aa  470  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  62.93 
 
 		 234 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  51.74 
 
 		 234 aa  248  6e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  53.02 
 
 		 231 aa  239  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  53.71 
 
 		 234 aa  239  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  53.04 
 
 		 231 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  53.04 
 
 		 231 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.74 
 
 		 231 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  53.68 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  52.17 
 
 		 233 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  52.17 
 
 		 233 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  53.45 
 
 		 234 aa  230  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  52.17 
 
 		 233 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  48.48 
 
 		 236 aa  230  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  48.05 
 
 		 236 aa  229  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  48.71 
 
 		 232 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  50.43 
 
 		 234 aa  228  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  45.69 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  47.44 
 
 		 234 aa  224  6e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  51.74 
 
 		 233 aa  224  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.3 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  52.38 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  52.38 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  50.65 
 
 		 235 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  49.34 
 
 		 237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  47.84 
 
 		 232 aa  218  6e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3131  ABC transporter related  50.43 
 
 		 250 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00980337  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  47.64 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  47.83 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5703  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.05 
 
 		 238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  50 
 
 		 234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  47.62 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  47.41 
 
 		 232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  48.07 
 
 		 238 aa  215  5e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  46.98 
 
 		 232 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  49.13 
 
 		 240 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  47.19 
 
 		 233 aa  214  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  46.58 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  45.69 
 
 		 232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  45.3 
 
 		 239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.35 
 
 		 235 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  45.06 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  46.12 
 
 		 234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  48.7 
 
 		 251 aa  211  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  49.13 
 
 		 248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6435  ABC transporter related  48.47 
 
 		 234 aa  211  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942423  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3826  ABC transporter related  48.5 
 
 		 250 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  44.64 
 
 		 237 aa  211  9e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1385  ABC transporter related  48.07 
 
 		 251 aa  210  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.692316  normal  0.0515657 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  43.16 
 
 		 238 aa  210  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  47.01 
 
 		 237 aa  210  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  46.96 
 
 		 237 aa  210  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  45.26 
 
 		 232 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1948  ABC transporter related  47.41 
 
 		 250 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  45.92 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.06 
 
 		 234 aa  209  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  44.44 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  48.26 
 
 		 246 aa  209  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  46.98 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1400  ABC transporter related  47.64 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  47.39 
 
 		 233 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  46.41 
 
 		 237 aa  209  4e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  48.71 
 
 		 234 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2989  ABC transporter related  45.49 
 
 		 246 aa  208  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2763  ABC transporter related  48.28 
 
 		 250 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  50.43 
 
 		 246 aa  208  6e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  44.64 
 
 		 234 aa  208  6e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3714  ABC transporter related  49.56 
 
 		 250 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.473058  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3737  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.36 
 
 		 234 aa  207  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1903  ABC transporter related  46.35 
 
 		 244 aa  207  9e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.638808  normal  0.412761 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6027  ABC transporter related  51.74 
 
 		 236 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0086  ABC transporter related  48.48 
 
 		 251 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  47.83 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  45.53 
 
 		 237 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0056  ABC transporter related  47.62 
 
 		 246 aa  206  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0075  ABC transporter related  48.48 
 
 		 251 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  47.19 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3370  ABC transporter related  48.5 
 
 		 241 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  45.06 
 
 		 235 aa  206  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1618  ABC transporter related  44.64 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  46.78 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  44.68 
 
 		 243 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  46.58 
 
 		 236 aa  205  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  46.75 
 
 		 248 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 238 aa  205  5e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  45.06 
 
 		 237 aa  205  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  48.26 
 
 		 244 aa  205  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  45.65 
 
 		 484 aa  205  5e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  41.63 
 
 		 235 aa  204  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3085  ABC transporter related  42.92 
 
 		 237 aa  205  6e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  47.39 
 
 		 248 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  48.26 
 
 		 244 aa  205  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3486  ABC transporter related  47.44 
 
 		 238 aa  204  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265059  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3519  ABC transporter-related protein  48.07 
 
 		 241 aa  204  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1403  ABC transporter related  44.87 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668018  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3121  ABC transporter related  46.75 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  42.74 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3048  ABC transporter related  47.62 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2136  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  47.83 
 
 		 243 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>