More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2136 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2136  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  100 
 
 
243 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1821  ABC transporter related  98.77 
 
 
243 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1678  ABC transporter related  81.78 
 
 
239 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  71 
 
 
239 aa  335  2.9999999999999997e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  64.2 
 
 
240 aa  323  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6435  ABC transporter related  67.38 
 
 
234 aa  320  9.000000000000001e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942423  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1281  ABC transporter-related protein  66.53 
 
 
237 aa  317  1e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal  0.295015 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0007  ABC transporter related  67.69 
 
 
234 aa  316  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315079  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  65.8 
 
 
234 aa  315  4e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0007  ABC transporter related  67.25 
 
 
234 aa  315  4e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0678223 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1076  ABC transporter related  66.23 
 
 
234 aa  315  5e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000101179  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3121  ABC transporter related  65.8 
 
 
237 aa  314  7e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3048  ABC transporter related  68.4 
 
 
251 aa  314  8e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3486  ABC transporter related  66.67 
 
 
238 aa  314  9e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265059  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  65.8 
 
 
234 aa  314  9.999999999999999e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0018  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  66.38 
 
 
252 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3914  ABC transporter related  66.67 
 
 
252 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3330  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  68.1 
 
 
251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0086  ABC transporter related  67.53 
 
 
251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610645  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0075  ABC transporter related  67.53 
 
 
251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3266  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  66.67 
 
 
251 aa  306  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0084  ABC transporter related  67.1 
 
 
251 aa  306  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911043  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5163  ABC transporter related  65.4 
 
 
236 aa  306  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.726387  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4074  ABC transporter related  63.18 
 
 
241 aa  304  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3370  ABC transporter related  64.38 
 
 
241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0102  ABC transporter related  66.23 
 
 
251 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2971  ABC transporter related  66.23 
 
 
251 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0084  ABC transporter related  66.23 
 
 
251 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0199  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding subunit  67.24 
 
 
251 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24485  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  67.24 
 
 
251 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4066  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  67.24 
 
 
251 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2993  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  67.24 
 
 
251 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.399368  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3376  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  67.24 
 
 
251 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1608  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  67.24 
 
 
251 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3519  ABC transporter-related protein  63.95 
 
 
241 aa  301  8.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2467  ABC transporter related  63.2 
 
 
237 aa  300  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.766044  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0056  ABC transporter related  61.34 
 
 
246 aa  299  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3755  ABC transporter ATP-binding protein  65.09 
 
 
237 aa  300  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3212  ABC transporter related  62.24 
 
 
246 aa  299  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3538  ABC transporter related  62.24 
 
 
246 aa  298  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0777529 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5955  ABC transporter related  64.5 
 
 
247 aa  298  7e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0145925  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3343  ABC transporter ATP-binding protein  63.07 
 
 
246 aa  296  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6267  ABC transporter related  64.66 
 
 
239 aa  295  6e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3781  ABC transporter related  64.14 
 
 
245 aa  293  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  58.16 
 
 
254 aa  292  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  57.38 
 
 
248 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  59.13 
 
 
251 aa  288  5.0000000000000004e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  58.92 
 
 
246 aa  287  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  56.12 
 
 
248 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  56.9 
 
 
248 aa  284  8e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  55.88 
 
 
248 aa  281  9e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  60 
 
 
244 aa  280  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  60 
 
 
244 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  58.7 
 
 
233 aa  275  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  57.83 
 
 
233 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  57.83 
 
 
233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  59.13 
 
 
234 aa  271  5.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2929  ABC transporter related  60.87 
 
 
230 aa  270  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  58.37 
 
 
239 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0955  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF, putative  57.02 
 
 
241 aa  267  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3305  ABC transporter component  55.97 
 
 
242 aa  266  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  57.83 
 
 
232 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  57.39 
 
 
232 aa  265  5e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  56.96 
 
 
232 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  57.83 
 
 
237 aa  264  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0896  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF  56.6 
 
 
241 aa  264  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.54469  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3521  ABC transporter related  60.87 
 
 
236 aa  260  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.295541  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0937  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  53.16 
 
 
240 aa  254  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0476932  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  53.19 
 
 
246 aa  242  3e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  53.48 
 
 
230 aa  239  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1792  ABC transporter related  50 
 
 
230 aa  220  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000519176 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1802  ABC transporter related  50 
 
 
230 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.639319  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.57 
 
 
231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  49.13 
 
 
231 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  49.13 
 
 
231 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  46.52 
 
 
236 aa  209  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  46.52 
 
 
236 aa  210  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  47.6 
 
 
234 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  48.7 
 
 
234 aa  207  9e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  47.16 
 
 
231 aa  207  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  50.43 
 
 
234 aa  207  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  47.48 
 
 
259 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  47.48 
 
 
259 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  46.55 
 
 
232 aa  203  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  47.83 
 
 
232 aa  203  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  48.26 
 
 
233 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  48.26 
 
 
233 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  48.26 
 
 
233 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  46.96 
 
 
233 aa  201  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  43.97 
 
 
234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.96 
 
 
233 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  47.39 
 
 
237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  48.7 
 
 
237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  48.07 
 
 
237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  48.7 
 
 
237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  46.78 
 
 
233 aa  198  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  45.69 
 
 
232 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  45.95 
 
 
234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  46.19 
 
 
237 aa  196  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  42.28 
 
 
243 aa  196  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.23625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>