More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3121 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3121  ABC transporter related  100 
 
 		 237 aa  482  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2467  ABC transporter related  92.41 
 
 		 237 aa  449  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.766044  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1281  ABC transporter-related protein  89.45 
 
 		 237 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal  0.295015 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5163  ABC transporter related  87.55 
 
 		 236 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.726387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4074  ABC transporter related  86.44 
 
 		 241 aa  426  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3486  ABC transporter related  84.81 
 
 		 238 aa  410  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265059  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3330  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  80.08 
 
 		 251 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3048  ABC transporter related  80.59 
 
 		 251 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2993  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  79.24 
 
 		 251 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.399368  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  79.24 
 
 		 251 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3370  ABC transporter related  79.41 
 
 		 241 aa  391  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0199  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding subunit  79.24 
 
 		 251 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24485  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4066  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  79.24 
 
 		 251 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3376  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  79.24 
 
 		 251 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3519  ABC transporter-related protein  80.93 
 
 		 241 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0084  ABC transporter related  78.81 
 
 		 251 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1608  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  79.24 
 
 		 251 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3914  ABC transporter related  80.69 
 
 		 252 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3538  ABC transporter related  78.28 
 
 		 246 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0777529 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3266  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  78.39 
 
 		 251 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3212  ABC transporter related  78.28 
 
 		 246 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0102  ABC transporter related  77.97 
 
 		 251 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0086  ABC transporter related  79.24 
 
 		 251 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0018  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  80.17 
 
 		 252 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2971  ABC transporter related  77.97 
 
 		 251 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0075  ABC transporter related  79.24 
 
 		 251 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0084  ABC transporter related  77.97 
 
 		 251 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3343  ABC transporter ATP-binding protein  77.05 
 
 		 246 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6267  ABC transporter related  77.54 
 
 		 239 aa  377  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3781  ABC transporter related  73.97 
 
 		 245 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3755  ABC transporter ATP-binding protein  75.11 
 
 		 237 aa  359  2e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5955  ABC transporter related  72.84 
 
 		 247 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0145925  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1076  ABC transporter related  74.89 
 
 		 234 aa  355  2.9999999999999997e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000101179  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  72.73 
 
 		 234 aa  348  5e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  72.29 
 
 		 234 aa  348  5e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6435  ABC transporter related  69.66 
 
 		 234 aa  334  9e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942423  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0007  ABC transporter related  68.8 
 
 		 234 aa  331  6e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678223 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0007  ABC transporter related  67.67 
 
 		 234 aa  324  7e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315079  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1821  ABC transporter related  66.23 
 
 		 243 aa  316  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2136  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  65.8 
 
 		 243 aa  314  6e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  61.02 
 
 		 239 aa  311  3.9999999999999997e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1678  ABC transporter related  63.2 
 
 		 239 aa  311  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  64.94 
 
 		 239 aa  307  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  61.44 
 
 		 246 aa  305  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  62.77 
 
 		 240 aa  303  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  62.23 
 
 		 244 aa  301  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  62.23 
 
 		 244 aa  301  5.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  60.52 
 
 		 233 aa  299  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  59.74 
 
 		 233 aa  298  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  58.05 
 
 		 248 aa  298  6e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0056  ABC transporter related  61.47 
 
 		 246 aa  297  7e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  56.78 
 
 		 248 aa  295  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0955  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF, putative  58.9 
 
 		 241 aa  295  4e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  59.74 
 
 		 233 aa  295  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  58.01 
 
 		 251 aa  295  5e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  59.31 
 
 		 232 aa  294  9e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  61.28 
 
 		 237 aa  294  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  58.87 
 
 		 232 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0896  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF  58.47 
 
 		 241 aa  291  5e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.54469  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  55.74 
 
 		 248 aa  291  7e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  56.36 
 
 		 254 aa  291  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  55.93 
 
 		 248 aa  289  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  58.01 
 
 		 232 aa  289  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  58.12 
 
 		 234 aa  286  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3305  ABC transporter component  57.08 
 
 		 242 aa  278  6e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2929  ABC transporter related  58.01 
 
 		 230 aa  276  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3521  ABC transporter related  56.72 
 
 		 236 aa  271  7e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.295541  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0937  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  52.81 
 
 		 240 aa  258  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0476932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  52.14 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  49.35 
 
 		 230 aa  241  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  50.85 
 
 		 236 aa  229  4e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  50.43 
 
 		 236 aa  228  7e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  45.02 
 
 		 231 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  45.02 
 
 		 231 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.59 
 
 		 231 aa  207  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1802  ABC transporter related  43.72 
 
 		 230 aa  205  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.639319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1792  ABC transporter related  43.29 
 
 		 230 aa  205  6e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000519176 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  43.64 
 
 		 239 aa  204  8e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  45.57 
 
 		 237 aa  204  9e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  46.75 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  45.3 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  45.02 
 
 		 231 aa  202  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  46.09 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  46.28 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.67 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3737  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 234 aa  198  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  43.72 
 
 		 233 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1284  ABC transporter related  44.49 
 
 		 234 aa  197  9e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  44.49 
 
 		 234 aa  197  9e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  46.67 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  44.73 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  42.86 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  46.98 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.29 
 
 		 233 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  48.58 
 
 		 234 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  42.92 
 
 		 236 aa  195  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3554  ABC transporter related  44.21 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.256863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1853  ABC transporter-related protein  45.99 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  43.59 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1403  ABC transporter related  43.35 
 
 		 237 aa  191  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>