More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1660 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  100 
 
 		 234 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  82.91 
 
 		 234 aa  401  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  75.21 
 
 		 234 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  65.95 
 
 		 237 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  65.52 
 
 		 237 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  63.79 
 
 		 237 aa  314  8e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  60.34 
 
 		 236 aa  290  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  58.23 
 
 		 244 aa  289  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  58.23 
 
 		 252 aa  286  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  59.07 
 
 		 259 aa  282  4.0000000000000003e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  58.65 
 
 		 259 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  58.19 
 
 		 236 aa  279  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  56.96 
 
 		 536 aa  275  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1177  ABC transporter related  52.59 
 
 		 236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  46.55 
 
 		 232 aa  232  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  46.84 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  47.41 
 
 		 237 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  49.79 
 
 		 233 aa  221  6e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  45.92 
 
 		 236 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  46.55 
 
 		 237 aa  217  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  44.87 
 
 		 234 aa  217  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  46.55 
 
 		 237 aa  217  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  47.84 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  46.55 
 
 		 234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.53 
 
 		 234 aa  215  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  46.09 
 
 		 233 aa  214  7e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  46.15 
 
 		 233 aa  214  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  48.87 
 
 		 246 aa  214  7e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.58 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  47.77 
 
 		 236 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  45.89 
 
 		 235 aa  212  3.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  47.77 
 
 		 236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 		 238 aa  211  7e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  45.89 
 
 		 237 aa  211  7.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  46.35 
 
 		 237 aa  210  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  47.41 
 
 		 248 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  43.1 
 
 		 238 aa  210  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  45.26 
 
 		 231 aa  209  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  45.3 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  45.69 
 
 		 231 aa  209  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  45.3 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  43.53 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  43.53 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  43.78 
 
 		 234 aa  209  4e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  48.71 
 
 		 232 aa  208  5e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  46.55 
 
 		 248 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1853  ABC transporter-related protein  44.68 
 
 		 235 aa  208  7e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  43.59 
 
 		 237 aa  207  8e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  48.28 
 
 		 234 aa  207  8e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.1 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  44.83 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3664  ABC transporter component  45.06 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  46.55 
 
 		 246 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2926  ABC transporter related  43.97 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  45.49 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  46.09 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  44.87 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  46.98 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.97 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  44.4 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  45.19 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  46.98 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1683  ABC transporter related  45.26 
 
 		 231 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  42.24 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  45.69 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  46.15 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  45.3 
 
 		 239 aa  205  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1679  ABC transporter-like protein  43.1 
 
 		 234 aa  205  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.0768267 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  44.02 
 
 		 239 aa  205  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4568  ABC transporter related  45.96 
 
 		 232 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  44.83 
 
 		 234 aa  205  5e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  43.35 
 
 		 231 aa  205  6e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  44.77 
 
 		 236 aa  204  6e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  45.06 
 
 		 237 aa  204  9e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  45.26 
 
 		 236 aa  204  9e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  43.59 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1793  ABC transporter related  44.26 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2574  ABC transporter related  44.4 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261355  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  45.26 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3085  ABC transporter related  43.16 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  43.1 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  46.55 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  43.97 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  42.55 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.69 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  45.06 
 
 		 239 aa  202  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6326  ABC transporter related  45.06 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4171  ABC transporter related  45.92 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  46.35 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1333  ABC transporter related  44.83 
 
 		 237 aa  202  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529108  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  43.59 
 
 		 239 aa  202  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  46.12 
 
 		 254 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  47.84 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  42.37 
 
 		 235 aa  202  5e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  46.12 
 
 		 244 aa  201  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0179  ABC transporter related  46.12 
 
 		 233 aa  201  6e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  44.87 
 
 		 238 aa  201  7e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  44.64 
 
 		 234 aa  201  8e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  43.1 
 
 		 235 aa  201  9e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3755  ABC transporter ATP-binding protein  45.53 
 
 		 237 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>