More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1376 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  100 
 
 
240 aa  487  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  77.92 
 
 
239 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1678  ABC transporter related  67.81 
 
 
239 aa  346  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6435  ABC transporter related  69.26 
 
 
234 aa  339  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942423  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0007  ABC transporter related  69.43 
 
 
234 aa  329  3e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315079  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  66.67 
 
 
234 aa  326  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  66.67 
 
 
234 aa  324  8.000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2136  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  64.2 
 
 
243 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3048  ABC transporter related  68.4 
 
 
251 aa  323  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1821  ABC transporter related  65.8 
 
 
243 aa  321  7e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0007  ABC transporter related  65.5 
 
 
234 aa  319  1.9999999999999998e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0678223 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1076  ABC transporter related  65.37 
 
 
234 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000101179  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3370  ABC transporter related  64.34 
 
 
241 aa  317  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6267  ABC transporter related  64.88 
 
 
239 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3914  ABC transporter related  66.67 
 
 
252 aa  314  8e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0018  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  66.67 
 
 
252 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  63.48 
 
 
234 aa  313  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0084  ABC transporter related  66.23 
 
 
251 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911043  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3519  ABC transporter-related protein  63.11 
 
 
241 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3343  ABC transporter ATP-binding protein  65.56 
 
 
246 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3266  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  66.67 
 
 
251 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3330  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.23 
 
 
251 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  61.74 
 
 
232 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0102  ABC transporter related  66.67 
 
 
251 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2971  ABC transporter related  66.67 
 
 
251 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0084  ABC transporter related  66.67 
 
 
251 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3376  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.37 
 
 
251 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0199  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding subunit  65.37 
 
 
251 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24485  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2993  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.37 
 
 
251 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.399368  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4066  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  65.37 
 
 
251 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1608  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.37 
 
 
251 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  61.74 
 
 
232 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  65.37 
 
 
251 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3212  ABC transporter related  64.32 
 
 
246 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3538  ABC transporter related  64.32 
 
 
246 aa  308  6.999999999999999e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0777529 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  61.74 
 
 
232 aa  307  8e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0086  ABC transporter related  64.94 
 
 
251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610645  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0075  ABC transporter related  64.94 
 
 
251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2467  ABC transporter related  62.77 
 
 
237 aa  305  5.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.766044  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3486  ABC transporter related  64.1 
 
 
238 aa  305  5.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265059  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5955  ABC transporter related  61.54 
 
 
247 aa  304  8.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0145925  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3121  ABC transporter related  62.77 
 
 
237 aa  303  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2929  ABC transporter related  63.04 
 
 
230 aa  303  1.0000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3781  ABC transporter related  61.29 
 
 
245 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  60.25 
 
 
248 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  60.92 
 
 
248 aa  300  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4074  ABC transporter related  60.83 
 
 
241 aa  300  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  61.3 
 
 
251 aa  300  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5163  ABC transporter related  62.77 
 
 
236 aa  298  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.726387  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3755  ABC transporter ATP-binding protein  62.98 
 
 
237 aa  297  1e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  58.8 
 
 
239 aa  297  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  60.87 
 
 
248 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  60.87 
 
 
254 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1281  ABC transporter-related protein  61.9 
 
 
237 aa  296  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal  0.295015 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0955  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF, putative  58.72 
 
 
241 aa  295  6e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  58.26 
 
 
233 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  60.87 
 
 
246 aa  292  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0056  ABC transporter related  60.43 
 
 
246 aa  292  4e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0896  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF  58.3 
 
 
241 aa  291  7e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.54469  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  57.39 
 
 
233 aa  291  7e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  57.39 
 
 
233 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  58.26 
 
 
248 aa  288  6e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  60 
 
 
244 aa  286  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  60 
 
 
244 aa  286  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3305  ABC transporter component  56.3 
 
 
242 aa  280  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  55.42 
 
 
237 aa  276  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3521  ABC transporter related  57.51 
 
 
236 aa  266  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.295541  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0937  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  53.33 
 
 
240 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0476932  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  53.48 
 
 
230 aa  255  5e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  51.46 
 
 
246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1802  ABC transporter related  47.83 
 
 
230 aa  223  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.639319  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  48.47 
 
 
234 aa  220  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  46.52 
 
 
236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  46.96 
 
 
236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1792  ABC transporter related  46.52 
 
 
230 aa  218  6e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000519176 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  52.4 
 
 
231 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  52.4 
 
 
231 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.44 
 
 
231 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  47.6 
 
 
231 aa  214  7e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  49.13 
 
 
232 aa  214  7e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  44.44 
 
 
236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  45.42 
 
 
241 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  47.83 
 
 
233 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  47.83 
 
 
233 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.82 
 
 
237 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  47.39 
 
 
233 aa  208  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  47.47 
 
 
234 aa  207  9e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  46.92 
 
 
237 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  48.39 
 
 
232 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  45.91 
 
 
237 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  47.49 
 
 
231 aa  206  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  45.54 
 
 
234 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  50.72 
 
 
234 aa  204  8e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  44.96 
 
 
259 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  47.41 
 
 
237 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  44.75 
 
 
234 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  45.69 
 
 
239 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  45.69 
 
 
239 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  44.96 
 
 
259 aa  203  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.39 
 
 
233 aa  201  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>