More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2431 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  100 
 
 		 234 aa  475  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  78.21 
 
 		 234 aa  385  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  75.21 
 
 		 234 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  64.22 
 
 		 237 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  64.22 
 
 		 237 aa  324  9e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  64.22 
 
 		 237 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  61.18 
 
 		 244 aa  305  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  61.6 
 
 		 252 aa  303  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  58.19 
 
 		 236 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  59.07 
 
 		 536 aa  282  4.0000000000000003e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  58.19 
 
 		 236 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  59.07 
 
 		 259 aa  280  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  58.65 
 
 		 259 aa  279  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  50.43 
 
 		 236 aa  238  9e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  48.28 
 
 		 232 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1177  ABC transporter related  50.43 
 
 		 236 aa  228  5e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  49.35 
 
 		 236 aa  224  7e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  48.92 
 
 		 236 aa  224  8e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  48.5 
 
 		 239 aa  221  8e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  46.98 
 
 		 237 aa  221  9e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  45.26 
 
 		 238 aa  219  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3664  ABC transporter component  46.98 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  47.64 
 
 		 237 aa  218  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  46.98 
 
 		 234 aa  218  8.999999999999998e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.26 
 
 		 238 aa  216  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  47.41 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  47.41 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  45.3 
 
 		 234 aa  214  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  45.92 
 
 		 239 aa  214  9e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  47.41 
 
 		 235 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  46.58 
 
 		 239 aa  213  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  48.7 
 
 		 233 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  44.87 
 
 		 233 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  44.87 
 
 		 233 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  46.12 
 
 		 232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4568  ABC transporter related  47.23 
 
 		 232 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  45.3 
 
 		 233 aa  211  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.83 
 
 		 238 aa  211  9e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  46.12 
 
 		 233 aa  210  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  45.26 
 
 		 231 aa  210  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.3 
 
 		 233 aa  210  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  46.35 
 
 		 231 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1793  ABC transporter related  45.11 
 
 		 235 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1841  ABC transporter related  47.41 
 
 		 231 aa  210  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  44.44 
 
 		 233 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  46.38 
 
 		 232 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  45.26 
 
 		 231 aa  209  4e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  47.75 
 
 		 246 aa  209  4e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  45.11 
 
 		 237 aa  209  4e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  44.83 
 
 		 235 aa  208  5e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  47.41 
 
 		 241 aa  208  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  43.78 
 
 		 231 aa  208  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  44.83 
 
 		 233 aa  208  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  43.53 
 
 		 231 aa  207  8e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1853  ABC transporter-related protein  44.3 
 
 		 235 aa  207  8e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  43.53 
 
 		 231 aa  207  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1683  ABC transporter related  44.83 
 
 		 231 aa  207  8e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.53 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  47.39 
 
 		 243 aa  206  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1403  ABC transporter related  45.49 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668018  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  45.54 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  45.26 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4171  ABC transporter related  46.35 
 
 		 231 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  46.12 
 
 		 246 aa  205  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  42.92 
 
 		 236 aa  205  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  45.69 
 
 		 245 aa  205  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2574  ABC transporter related  45.26 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261355  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  44.83 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  46.12 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  44.59 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  45.95 
 
 		 239 aa  202  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  46.55 
 
 		 254 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  45.26 
 
 		 248 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0007  ABC transporter related  44.02 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315079  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  43.53 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  44.89 
 
 		 233 aa  202  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  45.69 
 
 		 238 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2926  ABC transporter related  44.83 
 
 		 231 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  45.69 
 
 		 237 aa  202  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  42.68 
 
 		 236 aa  202  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  45.69 
 
 		 238 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  44.16 
 
 		 234 aa  201  8e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0614  ABC transporter related  45.65 
 
 		 231 aa  201  8e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  45.26 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  44.21 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  45.33 
 
 		 239 aa  201  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  43.1 
 
 		 232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  47.87 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  45.26 
 
 		 238 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  43.48 
 
 		 233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  44.4 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.78 
 
 		 233 aa  198  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  44.83 
 
 		 244 aa  198  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3903  ABC transporter related  45.45 
 
 		 257 aa  198  7e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.784547  normal  0.979503 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6326  ABC transporter related  45.21 
 
 		 231 aa  197  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3781  ABC transporter related  44.73 
 
 		 245 aa  197  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  44.78 
 
 		 233 aa  197  9e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  43.78 
 
 		 237 aa  197  9e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0955  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF, putative  45.54 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  46.12 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>