More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1400 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1400  ABC transporter related  100 
 
 		 251 aa  503  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1515  ABC transporter related  86.45 
 
 		 251 aa  441  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.274382  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1385  ABC transporter related  78.09 
 
 		 251 aa  400  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.692316  normal  0.0515657 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3131  ABC transporter related  66.53 
 
 		 250 aa  295  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00980337  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2763  ABC transporter related  66.11 
 
 		 250 aa  292  3e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1948  ABC transporter related  66.11 
 
 		 250 aa  291  8e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3714  ABC transporter related  64.58 
 
 		 250 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.473058  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3826  ABC transporter related  64.81 
 
 		 250 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  46.78 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1177  ABC transporter related  48.54 
 
 		 236 aa  211  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  50.21 
 
 		 236 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  50.64 
 
 		 236 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  48.28 
 
 		 231 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  49.57 
 
 		 232 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  48.28 
 
 		 231 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.84 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  47.64 
 
 		 232 aa  209  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  45.49 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  47.21 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  46.98 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  48.09 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  50.64 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  44.49 
 
 		 236 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  47.88 
 
 		 237 aa  205  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  47.41 
 
 		 234 aa  205  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  46.81 
 
 		 235 aa  204  9e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  47.26 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  47.26 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  46.38 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  48.48 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  46.81 
 
 		 238 aa  202  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  44.86 
 
 		 244 aa  202  6e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0545  ABC transporter related  47.88 
 
 		 234 aa  201  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756199 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  46.78 
 
 		 233 aa  201  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  45.83 
 
 		 259 aa  201  9e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  45.76 
 
 		 237 aa  201  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  48.88 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2926  ABC transporter related  44.49 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  45.8 
 
 		 238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  45.64 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  44.07 
 
 		 237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  45.53 
 
 		 249 aa  199  5e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2118  ABC transporter related  46.22 
 
 		 240 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  48.1 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.78 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2365  ABC transporter related  47.23 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  46.78 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  46.78 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  45.92 
 
 		 235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  47.28 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  44.96 
 
 		 237 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  45.26 
 
 		 234 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  48.51 
 
 		 238 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  45.06 
 
 		 233 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2495  ABC transporter related  44.73 
 
 		 238 aa  195  5.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  45.69 
 
 		 234 aa  195  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5861  ABC transporter related  44.08 
 
 		 250 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  46.78 
 
 		 233 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 235 aa  195  6e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  45.06 
 
 		 256 aa  195  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  45.27 
 
 		 247 aa  195  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3326  ABC transporter related  46.22 
 
 		 244 aa  195  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  45.27 
 
 		 247 aa  195  6e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  45.49 
 
 		 238 aa  195  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1076  ABC transporter related  45.69 
 
 		 234 aa  195  7e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000101179  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0419  ABC transporter-like protein  47.68 
 
 		 240 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  43.7 
 
 		 237 aa  195  8.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1162  ABC transporter related  45.19 
 
 		 241 aa  194  9e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.596535 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3199  ABC transporter-related protein  44.44 
 
 		 234 aa  194  9e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0566  ABC transporter related  45.61 
 
 		 241 aa  194  9e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.328556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  46.55 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0056  ABC transporter related  46.5 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  44.68 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  44.07 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  44.86 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1722  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  46.35 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  46.03 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  45.57 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2084  ABC transporter related  44.44 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  44.58 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  43.51 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2574  ABC transporter related  42.74 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261355  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  46.19 
 
 		 237 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  44.73 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  46.58 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4863  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45 
 
 		 238 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000477464  hitchhiker  0.0000052401 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4741  ABC transporter related  45 
 
 		 238 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000344378  hitchhiker  0.000000131699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0556  ABC transporter-like  44.54 
 
 		 238 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000214193  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  46.44 
 
 		 238 aa  192  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1841  ABC transporter related  43.16 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  44.49 
 
 		 259 aa  192  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  45.34 
 
 		 237 aa  192  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  45 
 
 		 259 aa  192  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  46.35 
 
 		 232 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  45.61 
 
 		 240 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3554  ABC transporter related  45.76 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.256863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  42.98 
 
 		 236 aa  192  6e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  42.31 
 
 		 231 aa  192  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  45.76 
 
 		 234 aa  192  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>