More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3423 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  100 
 
 		 237 aa  478  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  51.5 
 
 		 232 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  51.93 
 
 		 236 aa  236  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.68 
 
 		 237 aa  234  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  49.79 
 
 		 236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  47.26 
 
 		 237 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  49.58 
 
 		 252 aa  231  9e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  48.12 
 
 		 244 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  52.52 
 
 		 536 aa  228  9e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1177  ABC transporter related  50.85 
 
 		 236 aa  224  8e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  48.93 
 
 		 234 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  47.41 
 
 		 234 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  50.63 
 
 		 259 aa  223  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  48.94 
 
 		 236 aa  221  4.9999999999999996e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  50 
 
 		 236 aa  221  4.9999999999999996e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  50.21 
 
 		 259 aa  221  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  49.36 
 
 		 234 aa  221  7e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  46.98 
 
 		 234 aa  221  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  45.57 
 
 		 237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1403  ABC transporter related  44.96 
 
 		 237 aa  217  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668018  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  45.38 
 
 		 237 aa  216  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  44.87 
 
 		 236 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  44.92 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.22 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  46.35 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  44.92 
 
 		 239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  45.99 
 
 		 239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  48.29 
 
 		 234 aa  211  5.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  45.92 
 
 		 236 aa  211  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  45.92 
 
 		 236 aa  210  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  46.35 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.22 
 
 		 238 aa  208  5e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4171  ABC transporter related  47.64 
 
 		 231 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.92 
 
 		 233 aa  208  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  42.19 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  44.64 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  45.69 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  45.06 
 
 		 232 aa  205  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  46.88 
 
 		 237 aa  205  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4748  ABC transporter related  43.04 
 
 		 237 aa  204  7e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.597836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  44.64 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  45.49 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1903  ABC transporter related  43.78 
 
 		 244 aa  203  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.638808  normal  0.412761 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  45.49 
 
 		 233 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  44.64 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0545  ABC transporter related  45.73 
 
 		 234 aa  202  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756199 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4568  ABC transporter related  45.49 
 
 		 232 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  45.92 
 
 		 237 aa  201  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  45.92 
 
 		 237 aa  201  6e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  45.06 
 
 		 233 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  45.06 
 
 		 233 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  44.21 
 
 		 233 aa  201  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  46.78 
 
 		 258 aa  200  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  42.13 
 
 		 237 aa  200  9.999999999999999e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  46.98 
 
 		 237 aa  199  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1853  ABC transporter-related protein  44.92 
 
 		 235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  44.83 
 
 		 235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2574  ABC transporter related  44.21 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261355  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  44.26 
 
 		 237 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1321  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.07 
 
 		 237 aa  198  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6027  ABC transporter related  46.64 
 
 		 236 aa  197  9e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  43.78 
 
 		 235 aa  197  9e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  45.98 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  42.19 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2989  ABC transporter related  42.49 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  43.46 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  43.64 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2814  ABC transporter related  43.64 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0747835 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6326  ABC transporter related  45.11 
 
 		 231 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  41.63 
 
 		 231 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  41.2 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  44.21 
 
 		 231 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  48.58 
 
 		 230 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1683  ABC transporter related  41.63 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1618  ABC transporter related  41.35 
 
 		 237 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  44.07 
 
 		 236 aa  196  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  42.92 
 
 		 231 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  42.92 
 
 		 231 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  46.38 
 
 		 237 aa  195  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  45.34 
 
 		 240 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4047  ABC transporter related  45.11 
 
 		 236 aa  195  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  44.49 
 
 		 240 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1841  ABC transporter related  42.92 
 
 		 231 aa  195  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  44.07 
 
 		 240 aa  194  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  42.74 
 
 		 243 aa  194  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  44.49 
 
 		 240 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  44.54 
 
 		 238 aa  194  8.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  44.87 
 
 		 234 aa  194  9e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1284  ABC transporter related  44.87 
 
 		 234 aa  194  9e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.92 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  43.35 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0858  ABC transporter related  44.07 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.152569 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4819  ABC transporter related  45.34 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0621647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  45.92 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3266  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.73 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2971  ABC transporter related  45.73 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0084  ABC transporter related  45.73 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0102  ABC transporter related  45.73 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0086  ABC transporter related  45.73 
 
 		 251 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  41.42 
 
 		 236 aa  192  3e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>