More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2456 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  100 
 
 		 237 aa  473  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  70.04 
 
 		 237 aa  345  4e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  69.2 
 
 		 239 aa  317  7.999999999999999e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.12 
 
 		 234 aa  288  7e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  60.26 
 
 		 230 aa  286  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  59.4 
 
 		 232 aa  284  9e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  59.83 
 
 		 233 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  55.56 
 
 		 233 aa  275  5e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  57.69 
 
 		 232 aa  274  7e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  58.55 
 
 		 233 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  57.81 
 
 		 236 aa  268  5e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  54.43 
 
 		 236 aa  266  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3170  ABC transporter-related protein  56.12 
 
 		 236 aa  265  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0632  ABC transporter related  55.46 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4047  ABC transporter related  56.54 
 
 		 236 aa  262  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4606  ABC transporter related  55.65 
 
 		 235 aa  261  8e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1988  ABC transporter related  52.32 
 
 		 236 aa  260  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.69422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  54.01 
 
 		 237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3826  ABC transporter related  54.24 
 
 		 237 aa  250  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0362  ABC transporter related  52.52 
 
 		 243 aa  246  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2233  ABC transporter related  54.04 
 
 		 228 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0858  ABC transporter related  53.36 
 
 		 230 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.152569 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0179  ABC transporter related  52.32 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  49.57 
 
 		 237 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4748  ABC transporter related  50 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.597836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3085  ABC transporter related  48.29 
 
 		 237 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5099  ABC transporter related  49.37 
 
 		 229 aa  232  4.0000000000000004e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.999414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0210  ABC transporter related  48.29 
 
 		 237 aa  230  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  48.94 
 
 		 243 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  45.73 
 
 		 236 aa  228  8e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2954  ABC transporter related  48.13 
 
 		 239 aa  226  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  47.88 
 
 		 240 aa  224  7e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  49.37 
 
 		 236 aa  224  9e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1903  ABC transporter related  48.72 
 
 		 244 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.638808  normal  0.412761 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0083  ABC transporter related  47.01 
 
 		 233 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4367  ABC transporter related  49.37 
 
 		 236 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.583666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2989  ABC transporter related  48.29 
 
 		 246 aa  221  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  48.09 
 
 		 240 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3649  ABC transporter-related protein  48.29 
 
 		 237 aa  220  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1333  ABC transporter related  47.44 
 
 		 237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529108  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0081  ABC transporter related  46.61 
 
 		 237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  48.29 
 
 		 233 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1618  ABC transporter related  47.44 
 
 		 237 aa  218  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  46.15 
 
 		 237 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  47.68 
 
 		 235 aa  218  7e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  50 
 
 		 237 aa  217  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  50 
 
 		 237 aa  217  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  47.86 
 
 		 233 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  47.86 
 
 		 233 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  47.44 
 
 		 234 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.01 
 
 		 231 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.44 
 
 		 233 aa  215  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  46.15 
 
 		 233 aa  215  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  47.44 
 
 		 237 aa  214  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  48.29 
 
 		 234 aa  214  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  46.22 
 
 		 234 aa  214  9e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  46.58 
 
 		 231 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  46.58 
 
 		 231 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  44.87 
 
 		 234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  47.68 
 
 		 236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  46.35 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  42.62 
 
 		 236 aa  209  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  43.04 
 
 		 236 aa  209  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  44.44 
 
 		 232 aa  210  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1230  ABC transporter-related protein  47.86 
 
 		 238 aa  209  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  46.19 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.19 
 
 		 237 aa  208  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  48.09 
 
 		 244 aa  207  9e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  48.09 
 
 		 244 aa  207  9e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  48.29 
 
 		 230 aa  207  9e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  45.92 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  46.81 
 
 		 246 aa  204  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  48.94 
 
 		 484 aa  204  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5703  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.64 
 
 		 238 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  46.64 
 
 		 238 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  44.73 
 
 		 236 aa  201  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  42.74 
 
 		 232 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  42.8 
 
 		 240 aa  201  8e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  42.92 
 
 		 231 aa  201  8e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6027  ABC transporter related  47.23 
 
 		 236 aa  200  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  44.02 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  43.4 
 
 		 239 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4333  ABC transporter related  45.53 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.175987  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1619  ABC transporter related  44.26 
 
 		 244 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  43.88 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  44.26 
 
 		 237 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  41.77 
 
 		 240 aa  199  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0056  ABC transporter related  46.15 
 
 		 246 aa  199  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  42.62 
 
 		 240 aa  198  6e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  44.87 
 
 		 234 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  44.3 
 
 		 233 aa  198  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  43.4 
 
 		 258 aa  197  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  43.78 
 
 		 234 aa  197  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  42.62 
 
 		 240 aa  197  9e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1444  ABC transporter related  40.76 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  40.25 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  44.26 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  45.3 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  44.87 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  41.56 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>