More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2580 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  100 
 
 
230 aa  452  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1792  ABC transporter related  63.91 
 
 
230 aa  309  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000519176 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1802  ABC transporter related  63.91 
 
 
230 aa  308  6.999999999999999e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.639319  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2929  ABC transporter related  58.26 
 
 
230 aa  271  7e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  61.24 
 
 
232 aa  264  7e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  61.24 
 
 
232 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  60.77 
 
 
232 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  56.09 
 
 
246 aa  262  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  54.78 
 
 
233 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  56.65 
 
 
239 aa  261  8e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  54.35 
 
 
233 aa  261  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  54.35 
 
 
248 aa  259  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  53.48 
 
 
248 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  53.48 
 
 
248 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0955  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF, putative  56.17 
 
 
241 aa  259  3e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  54.35 
 
 
254 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  55.65 
 
 
233 aa  258  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  51.74 
 
 
234 aa  258  5.0000000000000005e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  55.22 
 
 
234 aa  258  6e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  54.78 
 
 
244 aa  257  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  54.78 
 
 
244 aa  256  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0896  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF  55.74 
 
 
241 aa  256  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.54469  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  51.3 
 
 
234 aa  255  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  53.48 
 
 
240 aa  255  4e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  52.17 
 
 
248 aa  255  5e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  53.04 
 
 
251 aa  254  8e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0056  ABC transporter related  53.48 
 
 
246 aa  254  9e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0007  ABC transporter related  51.97 
 
 
234 aa  253  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315079  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  56.96 
 
 
246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  55.22 
 
 
237 aa  252  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  52.17 
 
 
239 aa  251  6e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1076  ABC transporter related  50.43 
 
 
234 aa  249  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000101179  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3305  ABC transporter component  53.91 
 
 
242 aa  248  7e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0018  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  54.3 
 
 
252 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0007  ABC transporter related  49.34 
 
 
234 aa  245  4.9999999999999997e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0678223 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6435  ABC transporter related  52.4 
 
 
234 aa  244  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942423  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3914  ABC transporter related  52.38 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0102  ABC transporter related  51.08 
 
 
251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2971  ABC transporter related  51.08 
 
 
251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0084  ABC transporter related  51.08 
 
 
251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3330  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.95 
 
 
251 aa  241  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3121  ABC transporter related  49.35 
 
 
237 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2136  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  53.48 
 
 
243 aa  239  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.52 
 
 
251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3376  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.52 
 
 
251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2993  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.52 
 
 
251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.399368  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0199  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding subunit  51.52 
 
 
251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24485  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1821  ABC transporter related  53.04 
 
 
243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4066  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.52 
 
 
251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1608  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.52 
 
 
251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1678  ABC transporter related  50.87 
 
 
239 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3048  ABC transporter related  50.22 
 
 
251 aa  237  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3755  ABC transporter ATP-binding protein  49.14 
 
 
237 aa  236  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0086  ABC transporter related  51.83 
 
 
251 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610645  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0075  ABC transporter related  51.83 
 
 
251 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3370  ABC transporter related  50.21 
 
 
241 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0084  ABC transporter related  49.78 
 
 
251 aa  235  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911043  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3266  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  49.35 
 
 
251 aa  234  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5955  ABC transporter related  47.62 
 
 
247 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0145925  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3486  ABC transporter related  49.57 
 
 
238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265059  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2467  ABC transporter related  49.35 
 
 
237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.766044  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3519  ABC transporter-related protein  48.93 
 
 
241 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5163  ABC transporter related  50.65 
 
 
236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.726387  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1281  ABC transporter-related protein  52.15 
 
 
237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal  0.295015 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4074  ABC transporter related  49.35 
 
 
241 aa  232  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3781  ABC transporter related  47.68 
 
 
245 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3343  ABC transporter ATP-binding protein  48.96 
 
 
246 aa  227  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6267  ABC transporter related  49.78 
 
 
239 aa  227  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3212  ABC transporter related  48.56 
 
 
246 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3538  ABC transporter related  48.13 
 
 
246 aa  226  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0777529 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  50.87 
 
 
234 aa  222  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.25 
 
 
231 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  56.25 
 
 
231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  56.25 
 
 
231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  52.61 
 
 
233 aa  219  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  52.4 
 
 
231 aa  219  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0937  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.09 
 
 
240 aa  219  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0476932  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3521  ABC transporter related  50.48 
 
 
236 aa  218  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.295541  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  49.29 
 
 
237 aa  217  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  48.03 
 
 
244 aa  216  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  49.29 
 
 
237 aa  216  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  48.26 
 
 
233 aa  216  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  48.87 
 
 
233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  48.91 
 
 
234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  47.6 
 
 
236 aa  214  5.9999999999999996e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  47.83 
 
 
232 aa  214  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  47.16 
 
 
236 aa  214  7e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  50.88 
 
 
235 aa  214  9e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  49.13 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  49.1 
 
 
230 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.83 
 
 
233 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  46.35 
 
 
237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  49.57 
 
 
233 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  49.57 
 
 
233 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  49.57 
 
 
237 aa  211  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  49.57 
 
 
233 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  46.64 
 
 
536 aa  209  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  49.07 
 
 
252 aa  209  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  48.07 
 
 
238 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  50.24 
 
 
236 aa  208  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>