More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1281 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1281  ABC transporter-related protein  100 
 
 
237 aa  479  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal  0.295015 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3121  ABC transporter related  89.45 
 
 
237 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2467  ABC transporter related  88.61 
 
 
237 aa  434  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.766044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5163  ABC transporter related  85.53 
 
 
236 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.726387  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4074  ABC transporter related  83.47 
 
 
241 aa  409  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3486  ABC transporter related  82.7 
 
 
238 aa  397  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265059  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3330  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  79.66 
 
 
251 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3519  ABC transporter-related protein  78.9 
 
 
241 aa  388  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0086  ABC transporter related  79.24 
 
 
251 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610645  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2993  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  78.81 
 
 
251 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.399368  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3376  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  78.81 
 
 
251 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1608  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  78.81 
 
 
251 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3370  ABC transporter related  78.57 
 
 
241 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0199  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding subunit  78.81 
 
 
251 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24485  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0084  ABC transporter related  78.39 
 
 
251 aa  384  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911043  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0102  ABC transporter related  78.39 
 
 
251 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3048  ABC transporter related  78.9 
 
 
251 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3914  ABC transporter related  79.83 
 
 
252 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2971  ABC transporter related  78.39 
 
 
251 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  78.81 
 
 
251 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4066  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  78.81 
 
 
251 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0075  ABC transporter related  79.24 
 
 
251 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0084  ABC transporter related  78.39 
 
 
251 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3266  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  77.97 
 
 
251 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0018  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  77.87 
 
 
252 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3538  ABC transporter related  76.73 
 
 
246 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0777529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3212  ABC transporter related  76.73 
 
 
246 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3343  ABC transporter ATP-binding protein  75.51 
 
 
246 aa  374  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6267  ABC transporter related  77.97 
 
 
239 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3781  ABC transporter related  75.21 
 
 
245 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3755  ABC transporter ATP-binding protein  76.82 
 
 
237 aa  363  2e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1076  ABC transporter related  73.62 
 
 
234 aa  352  4e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000101179  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  73.16 
 
 
234 aa  350  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5955  ABC transporter related  72.41 
 
 
247 aa  348  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0145925  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  72.73 
 
 
234 aa  345  4e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6435  ABC transporter related  71.06 
 
 
234 aa  340  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942423  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0007  ABC transporter related  67.23 
 
 
234 aa  324  6e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0678223 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0007  ABC transporter related  65.96 
 
 
234 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315079  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1821  ABC transporter related  67.97 
 
 
243 aa  318  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2136  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  66.53 
 
 
243 aa  317  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  61.97 
 
 
239 aa  309  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1678  ABC transporter related  64.07 
 
 
239 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  65.37 
 
 
239 aa  306  3e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  58.9 
 
 
248 aa  301  7.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  60.26 
 
 
233 aa  300  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  60.61 
 
 
233 aa  300  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  61.04 
 
 
233 aa  298  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0955  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF, putative  58.9 
 
 
241 aa  297  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  61.9 
 
 
240 aa  296  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  60.59 
 
 
246 aa  294  6e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0896  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF  58.47 
 
 
241 aa  293  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.54469  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  61.8 
 
 
244 aa  291  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  61.8 
 
 
244 aa  292  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  58.01 
 
 
251 aa  291  5e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  57.63 
 
 
248 aa  291  7e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0056  ABC transporter related  59.75 
 
 
246 aa  289  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  58.87 
 
 
232 aa  289  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  58.87 
 
 
232 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  56.36 
 
 
254 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  56.36 
 
 
248 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  55.98 
 
 
248 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  58.01 
 
 
232 aa  285  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  57.87 
 
 
234 aa  284  7e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  58.55 
 
 
237 aa  279  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3305  ABC transporter component  58.8 
 
 
242 aa  276  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2929  ABC transporter related  58.01 
 
 
230 aa  270  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3521  ABC transporter related  57.98 
 
 
236 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.295541  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0937  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  54.55 
 
 
240 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0476932  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  53.42 
 
 
246 aa  245  3e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  52.15 
 
 
230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  48.72 
 
 
236 aa  222  4e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  48.29 
 
 
236 aa  221  8e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.75 
 
 
231 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  46.32 
 
 
231 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  46.32 
 
 
231 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1792  ABC transporter related  45.45 
 
 
230 aa  206  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000519176 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1802  ABC transporter related  45.89 
 
 
230 aa  205  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.639319  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  44.59 
 
 
231 aa  203  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  46.75 
 
 
232 aa  200  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  43.72 
 
 
232 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  44.59 
 
 
231 aa  198  7e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  44.21 
 
 
233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.19 
 
 
234 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  44.49 
 
 
234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  44.77 
 
 
237 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  44.16 
 
 
231 aa  195  6e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  45.69 
 
 
236 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  42.86 
 
 
232 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  48.8 
 
 
234 aa  193  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  41.6 
 
 
239 aa  193  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  45.04 
 
 
259 aa  193  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  45.08 
 
 
259 aa  193  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  45.19 
 
 
237 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2574  ABC transporter related  45.75 
 
 
231 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261355  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.98 
 
 
237 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1683  ABC transporter related  44.16 
 
 
231 aa  193  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.78 
 
 
233 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  41.99 
 
 
232 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  42.98 
 
 
237 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  45.74 
 
 
234 aa  192  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>