More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6267 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6267  ABC transporter related  100 
 
 		 239 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3370  ABC transporter related  94.19 
 
 		 241 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3519  ABC transporter-related protein  91.29 
 
 		 241 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3343  ABC transporter ATP-binding protein  84.9 
 
 		 246 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3212  ABC transporter related  84.9 
 
 		 246 aa  408  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3538  ABC transporter related  84.9 
 
 		 246 aa  407  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0777529 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3266  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  82.2 
 
 		 251 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3914  ABC transporter related  81.09 
 
 		 252 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0084  ABC transporter related  82.2 
 
 		 251 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0086  ABC transporter related  81.78 
 
 		 251 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4066  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  80.93 
 
 		 251 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0199  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding subunit  80.93 
 
 		 251 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24485  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3330  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  81.36 
 
 		 251 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0102  ABC transporter related  82.2 
 
 		 251 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3376  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  80.93 
 
 		 251 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  80.93 
 
 		 251 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1608  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  80.93 
 
 		 251 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0018  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  80.25 
 
 		 252 aa  387  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3048  ABC transporter related  81.36 
 
 		 251 aa  387  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2971  ABC transporter related  82.2 
 
 		 251 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0075  ABC transporter related  81.78 
 
 		 251 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0084  ABC transporter related  82.2 
 
 		 251 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2993  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  80.93 
 
 		 251 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.399368  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5163  ABC transporter related  80.85 
 
 		 236 aa  384  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.726387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3781  ABC transporter related  75.92 
 
 		 245 aa  380  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3121  ABC transporter related  77.54 
 
 		 237 aa  377  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2467  ABC transporter related  77.97 
 
 		 237 aa  377  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.766044  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4074  ABC transporter related  77.97 
 
 		 241 aa  376  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3486  ABC transporter related  80 
 
 		 238 aa  374  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265059  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1281  ABC transporter-related protein  77.97 
 
 		 237 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal  0.295015 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3755  ABC transporter ATP-binding protein  77.25 
 
 		 237 aa  355  1.9999999999999998e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5955  ABC transporter related  73.71 
 
 		 247 aa  351  5e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0145925  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  76.19 
 
 		 234 aa  349  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  74.89 
 
 		 234 aa  348  3e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1076  ABC transporter related  74.03 
 
 		 234 aa  341  5e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000101179  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6435  ABC transporter related  72.29 
 
 		 234 aa  333  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942423  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  64.88 
 
 		 240 aa  317  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  66.67 
 
 		 239 aa  311  7.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0007  ABC transporter related  66.53 
 
 		 234 aa  305  3e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315079  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1678  ABC transporter related  62.77 
 
 		 239 aa  302  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0007  ABC transporter related  63.36 
 
 		 234 aa  301  5.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678223 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  58.82 
 
 		 248 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  60.61 
 
 		 248 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1821  ABC transporter related  65.09 
 
 		 243 aa  295  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2136  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  64.66 
 
 		 243 aa  295  6e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  60.09 
 
 		 248 aa  294  9e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  61.54 
 
 		 239 aa  293  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  61.28 
 
 		 234 aa  293  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  60.61 
 
 		 251 aa  291  7e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  58.44 
 
 		 248 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  59.74 
 
 		 254 aa  289  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  60.78 
 
 		 232 aa  287  8e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  59.75 
 
 		 246 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  59.83 
 
 		 233 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  60.34 
 
 		 232 aa  285  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0955  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF, putative  59.75 
 
 		 241 aa  284  9e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0056  ABC transporter related  61.47 
 
 		 246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  60.94 
 
 		 244 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  60.94 
 
 		 244 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  59.74 
 
 		 232 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  59.31 
 
 		 233 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3305  ABC transporter component  57.98 
 
 		 242 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0896  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF  59.32 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.54469  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  59.48 
 
 		 233 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  58.75 
 
 		 237 aa  276  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2929  ABC transporter related  59.74 
 
 		 230 aa  274  9e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3521  ABC transporter related  58.87 
 
 		 236 aa  261  6e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.295541  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0937  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  55.41 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0476932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  53.65 
 
 		 246 aa  241  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  49.78 
 
 		 230 aa  227  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  48.92 
 
 		 236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  49.35 
 
 		 236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  48.31 
 
 		 232 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  47.21 
 
 		 236 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  44.87 
 
 		 234 aa  208  8e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.41 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  45.99 
 
 		 233 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  46.32 
 
 		 231 aa  205  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  49.56 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  45.89 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  45.64 
 
 		 239 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  46.22 
 
 		 239 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  46.32 
 
 		 231 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  46.69 
 
 		 259 aa  201  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  44.59 
 
 		 231 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  46.69 
 
 		 259 aa  201  8e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  44.59 
 
 		 231 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  45.71 
 
 		 237 aa  201  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.59 
 
 		 231 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4171  ABC transporter related  45.89 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  46.61 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  45.99 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  45.99 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  49.36 
 
 		 238 aa  199  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  45.3 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  47.19 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4568  ABC transporter related  45.45 
 
 		 232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  47.03 
 
 		 237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  45.57 
 
 		 233 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  44.59 
 
 		 231 aa  197  9e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>