More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3245 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  100 
 
 
246 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  94.37 
 
 
244 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  93.94 
 
 
244 aa  441  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0056  ABC transporter related  86.18 
 
 
246 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  73.48 
 
 
251 aa  357  9.999999999999999e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  67.74 
 
 
248 aa  354  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  67.34 
 
 
248 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  68.75 
 
 
248 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  69.42 
 
 
248 aa  348  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  70.87 
 
 
254 aa  346  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  67.8 
 
 
237 aa  330  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3305  ABC transporter component  65.13 
 
 
242 aa  310  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  62.66 
 
 
234 aa  308  5.9999999999999995e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0007  ABC transporter related  62.88 
 
 
234 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315079  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2929  ABC transporter related  64.35 
 
 
230 aa  306  3e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  64.38 
 
 
234 aa  306  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3121  ABC transporter related  61.44 
 
 
237 aa  305  6e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5163  ABC transporter related  63.4 
 
 
236 aa  304  7e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.726387  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  61.8 
 
 
234 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1076  ABC transporter related  61.3 
 
 
234 aa  298  5e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000101179  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  62.77 
 
 
233 aa  298  5e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2467  ABC transporter related  61.86 
 
 
237 aa  297  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.766044  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4074  ABC transporter related  60.42 
 
 
241 aa  295  4e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3486  ABC transporter related  62.39 
 
 
238 aa  295  5e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265059  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1281  ABC transporter-related protein  60.59 
 
 
237 aa  294  7e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal  0.295015 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3266  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  61.37 
 
 
251 aa  294  8e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3343  ABC transporter ATP-binding protein  59.59 
 
 
246 aa  293  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  62.39 
 
 
239 aa  293  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1678  ABC transporter related  57.32 
 
 
239 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3914  ABC transporter related  58.61 
 
 
252 aa  292  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3212  ABC transporter related  59.18 
 
 
246 aa  292  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  60.87 
 
 
240 aa  292  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3048  ABC transporter related  61.8 
 
 
251 aa  292  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3538  ABC transporter related  59.18 
 
 
246 aa  292  4e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0777529 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0084  ABC transporter related  59.09 
 
 
251 aa  292  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911043  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0007  ABC transporter related  60.7 
 
 
234 aa  291  5e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0678223 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3330  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.37 
 
 
251 aa  291  7e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0018  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  58.61 
 
 
252 aa  291  7e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4066  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.37 
 
 
251 aa  291  9e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3376  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.37 
 
 
251 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0199  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding subunit  61.37 
 
 
251 aa  291  9e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24485  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.37 
 
 
251 aa  291  9e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2993  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.37 
 
 
251 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.399368  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1608  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.37 
 
 
251 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  58.16 
 
 
239 aa  291  9e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3370  ABC transporter related  60.08 
 
 
241 aa  290  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0102  ABC transporter related  60.94 
 
 
251 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2971  ABC transporter related  60.94 
 
 
251 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0084  ABC transporter related  60.94 
 
 
251 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  62.17 
 
 
232 aa  289  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3519  ABC transporter-related protein  59.17 
 
 
241 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  62.17 
 
 
232 aa  289  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0086  ABC transporter related  60.52 
 
 
251 aa  288  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610645  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0075  ABC transporter related  60.52 
 
 
251 aa  288  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0955  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF, putative  61.86 
 
 
241 aa  288  6e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6435  ABC transporter related  62.01 
 
 
234 aa  287  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942423  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2136  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  58.92 
 
 
243 aa  287  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1821  ABC transporter related  60.43 
 
 
243 aa  286  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  60.34 
 
 
233 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6267  ABC transporter related  59.75 
 
 
239 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  61.74 
 
 
232 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0896  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF  61.44 
 
 
241 aa  285  4e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.54469  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  59.91 
 
 
233 aa  285  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0937  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  60.43 
 
 
240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0476932  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3781  ABC transporter related  56.61 
 
 
245 aa  279  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5955  ABC transporter related  59.31 
 
 
247 aa  278  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0145925  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3755  ABC transporter ATP-binding protein  59.48 
 
 
237 aa  278  6e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  56.33 
 
 
246 aa  271  6e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  56.09 
 
 
230 aa  262  3e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3521  ABC transporter related  59.15 
 
 
236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.295541  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1802  ABC transporter related  50 
 
 
230 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.639319  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1792  ABC transporter related  49.13 
 
 
230 aa  237  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000519176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  55.29 
 
 
231 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  55.29 
 
 
231 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.81 
 
 
231 aa  224  9e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  48.28 
 
 
236 aa  223  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  48.71 
 
 
236 aa  223  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  50 
 
 
239 aa  222  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  50 
 
 
259 aa  221  8e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  51.74 
 
 
234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  49.59 
 
 
259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  50.87 
 
 
233 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  50.87 
 
 
233 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  49.13 
 
 
233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  50.87 
 
 
233 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.7 
 
 
233 aa  216  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  47.41 
 
 
234 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  46.58 
 
 
236 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  47.06 
 
 
252 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  48.26 
 
 
232 aa  209  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  48.7 
 
 
234 aa  209  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  47.41 
 
 
237 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.35 
 
 
234 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  46.55 
 
 
234 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  47.6 
 
 
231 aa  206  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  47.39 
 
 
235 aa  206  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  45.79 
 
 
237 aa  205  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  49.14 
 
 
232 aa  205  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  46.12 
 
 
234 aa  205  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  46.38 
 
 
237 aa  205  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>