More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4185 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  100 
 
 
238 aa  473  1e-133  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  54.7 
 
 
240 aa  245  4e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.34 
 
 
234 aa  233  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.88 
 
 
247 aa  231  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  52.77 
 
 
235 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  51.5 
 
 
237 aa  230  1e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  52.16 
 
 
235 aa  230  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  53.16 
 
 
259 aa  229  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  50.64 
 
 
232 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  52.36 
 
 
234 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  49.79 
 
 
233 aa  228  5e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  52.3 
 
 
247 aa  227  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  52.97 
 
 
256 aa  227  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  51.28 
 
 
235 aa  225  4e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  50 
 
 
239 aa  226  4e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  49.58 
 
 
235 aa  225  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  49.36 
 
 
233 aa  224  6e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  50.21 
 
 
236 aa  224  9e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  52.34 
 
 
238 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  50.64 
 
 
236 aa  224  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  51.72 
 
 
245 aa  223  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  50.64 
 
 
233 aa  222  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  48.93 
 
 
249 aa  222  4.9999999999999996e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  51.05 
 
 
247 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  50.43 
 
 
234 aa  221  8e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  52.99 
 
 
237 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  47.44 
 
 
234 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  51.72 
 
 
256 aa  220  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.51 
 
 
234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.57 
 
 
234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  50 
 
 
237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  49.57 
 
 
235 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  51.29 
 
 
238 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  50 
 
 
238 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  48.72 
 
 
235 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  48.95 
 
 
247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.38 
 
 
238 aa  218  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1498  ABC transporter related  47.66 
 
 
235 aa  218  7e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164397  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  44.96 
 
 
238 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  49.79 
 
 
234 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5099  ABC transporter related  47.7 
 
 
254 aa  217  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.23505  normal  0.121092 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  50.64 
 
 
237 aa  217  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2175  ABC transporter related protein  50.22 
 
 
232 aa  217  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.549091  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  51.07 
 
 
233 aa  216  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  50.43 
 
 
235 aa  216  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.54 
 
 
235 aa  216  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  50.21 
 
 
247 aa  216  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0098  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.9 
 
 
262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.359537 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2528  ABC transporter related  55.61 
 
 
232 aa  215  4e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.53065 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.54 
 
 
238 aa  215  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  50.86 
 
 
258 aa  215  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.54 
 
 
238 aa  215  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.54 
 
 
238 aa  215  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.54 
 
 
238 aa  215  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0223  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50.43 
 
 
241 aa  215  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0851652  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  50.64 
 
 
237 aa  215  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.54 
 
 
238 aa  215  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3586  ABC transporter related  47.28 
 
 
254 aa  215  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0486614  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.54 
 
 
238 aa  215  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  48.07 
 
 
232 aa  215  5e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  52.14 
 
 
234 aa  215  5e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  48.28 
 
 
234 aa  215  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3737  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 
234 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  52.56 
 
 
236 aa  214  7e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0566  ABC transporter related  48.75 
 
 
241 aa  214  7e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.328556  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.87 
 
 
234 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  48.28 
 
 
231 aa  213  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5320  ABC transporter related  46.86 
 
 
254 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  44.92 
 
 
236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  50.85 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  46.15 
 
 
236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  45.96 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0889  ABC transporter related  49.15 
 
 
233 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  50.85 
 
 
234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  45.96 
 
 
236 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  48.54 
 
 
247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  49.79 
 
 
240 aa  212  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  50.64 
 
 
264 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3934  ABC transporter related  46.44 
 
 
254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2532  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.86 
 
 
254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  48.54 
 
 
247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  46.38 
 
 
236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  47.21 
 
 
233 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  50.43 
 
 
238 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  47.44 
 
 
238 aa  211  5.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  48.95 
 
 
234 aa  211  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  47.86 
 
 
231 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  48.54 
 
 
239 aa  211  5.999999999999999e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  47.86 
 
 
231 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  44.12 
 
 
238 aa  211  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  44.12 
 
 
238 aa  211  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  47.23 
 
 
234 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0329  ABC transporter related  46.58 
 
 
230 aa  210  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.287188  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  48.51 
 
 
234 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  47.26 
 
 
237 aa  211  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  50.64 
 
 
237 aa  209  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.86 
 
 
231 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  49.15 
 
 
234 aa  209  2e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.64 
 
 
233 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  49.36 
 
 
236 aa  209  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>