More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1858 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 237 aa  484  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1403  ABC transporter related  91.14 
 
 		 237 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668018  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  81.36 
 
 		 239 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  81.36 
 
 		 239 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  80.08 
 
 		 239 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  70.39 
 
 		 231 aa  337  9e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  69.1 
 
 		 231 aa  336  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2926  ABC transporter related  69.96 
 
 		 231 aa  335  5e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  68.09 
 
 		 236 aa  334  5.999999999999999e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1683  ABC transporter related  69.1 
 
 		 231 aa  334  7.999999999999999e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  67.81 
 
 		 231 aa  333  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2574  ABC transporter related  69.1 
 
 		 231 aa  332  3e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261355  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1793  ABC transporter related  67.66 
 
 		 235 aa  329  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1841  ABC transporter related  68.24 
 
 		 231 aa  329  3e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4568  ABC transporter related  67.81 
 
 		 232 aa  324  9e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  66.52 
 
 		 232 aa  322  4e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  66.09 
 
 		 231 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4171  ABC transporter related  65.24 
 
 		 231 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1853  ABC transporter-related protein  63.83 
 
 		 235 aa  311  4.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2930  ABC transporter-related protein  65.24 
 
 		 231 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.208893  normal  0.372931 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  63.2 
 
 		 243 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  60.52 
 
 		 241 aa  295  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  58.9 
 
 		 238 aa  284  7e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.26 
 
 		 238 aa  270  1e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2814  ABC transporter related  53.62 
 
 		 237 aa  267  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0747835 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1604  ABC transporter related  55.7 
 
 		 237 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.26 
 
 		 238 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1321  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  53.65 
 
 		 237 aa  265  7e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.06 
 
 		 237 aa  224  9e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  47.06 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  46.35 
 
 		 231 aa  219  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  46.55 
 
 		 232 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  47.64 
 
 		 234 aa  218  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  48.07 
 
 		 234 aa  217  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  45.38 
 
 		 237 aa  216  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1297  ABC transporter related  50 
 
 		 234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  43.59 
 
 		 236 aa  215  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1395  ABC transporter related  46.98 
 
 		 234 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.858988 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0935  ABC transporter related  46.98 
 
 		 234 aa  214  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302332  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1417  ABC transporter related  46.98 
 
 		 234 aa  214  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  45.49 
 
 		 236 aa  214  8e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.1 
 
 		 231 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  43.1 
 
 		 231 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  43.1 
 
 		 231 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  47.44 
 
 		 236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  47.01 
 
 		 232 aa  210  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  45.34 
 
 		 237 aa  209  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  45.34 
 
 		 237 aa  209  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  45.73 
 
 		 232 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0545  ABC transporter related  44.02 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756199 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  43.53 
 
 		 235 aa  208  5e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  49.3 
 
 		 233 aa  208  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  45.73 
 
 		 232 aa  208  7e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  43.42 
 
 		 236 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  46.15 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  43.59 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1284  ABC transporter related  43.59 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  45.3 
 
 		 236 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  42.98 
 
 		 236 aa  206  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  46.43 
 
 		 232 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  43.59 
 
 		 234 aa  205  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  44.49 
 
 		 244 aa  205  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  47.41 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4561  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.37 
 
 		 234 aa  203  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.474601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  45.64 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3554  ABC transporter related  42.74 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.256863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  45.73 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  45.38 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  48.37 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3519  ABC transporter-related protein  46.41 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1336  ABC transporter related  48.62 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1898  ABC transporter related  46.79 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  45.38 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2027  ABC transporter related  44.02 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  45.73 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  44.81 
 
 		 259 aa  202  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5955  ABC transporter related  46.81 
 
 		 247 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0145925  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3370  ABC transporter related  46.35 
 
 		 241 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2929  ABC transporter related  47.79 
 
 		 230 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  44.77 
 
 		 252 aa  200  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.44 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  44.44 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  44.64 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  45.19 
 
 		 237 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  44.44 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6267  ABC transporter related  47.03 
 
 		 239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  44.73 
 
 		 237 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  44.07 
 
 		 234 aa  198  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  44.3 
 
 		 234 aa  198  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3085  ABC transporter related  42.02 
 
 		 237 aa  198  7e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1076  ABC transporter related  44.12 
 
 		 234 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000101179  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  44.02 
 
 		 233 aa  197  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  44.02 
 
 		 233 aa  197  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3486  ABC transporter related  44.3 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265059  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  42.31 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  43.7 
 
 		 536 aa  196  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  44.44 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  42.02 
 
 		 237 aa  196  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5991  branched chain amino acid ABC tranpsorter ATP-binding protein  42.67 
 
 		 233 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  45.96 
 
 		 239 aa  195  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>