More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1853 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1853  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 235 aa  466  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  70.64 
 
 		 236 aa  327  7e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2926  ABC transporter related  66.81 
 
 		 231 aa  325  5e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  65.53 
 
 		 231 aa  322  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  65.53 
 
 		 231 aa  320  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2574  ABC transporter related  65.53 
 
 		 231 aa  319  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261355  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1841  ABC transporter related  65.96 
 
 		 231 aa  316  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1403  ABC transporter related  64.68 
 
 		 237 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668018  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  64.26 
 
 		 231 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  63.83 
 
 		 237 aa  311  4.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1793  ABC transporter related  62.55 
 
 		 235 aa  311  5.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1683  ABC transporter related  64.26 
 
 		 231 aa  311  6.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  65.25 
 
 		 239 aa  309  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2930  ABC transporter-related protein  64.68 
 
 		 231 aa  299  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.208893  normal  0.372931 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  62.13 
 
 		 239 aa  296  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  61.7 
 
 		 239 aa  295  4e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4568  ABC transporter related  59.15 
 
 		 232 aa  294  7e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  58.72 
 
 		 232 aa  290  9e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  58.3 
 
 		 231 aa  288  6e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4171  ABC transporter related  59.57 
 
 		 231 aa  287  8e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  61.28 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  60.52 
 
 		 243 aa  272  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  54.66 
 
 		 238 aa  258  7e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.12 
 
 		 238 aa  248  6e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.12 
 
 		 238 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1321  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  54.04 
 
 		 237 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2814  ABC transporter related  53.62 
 
 		 237 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0747835 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1604  ABC transporter related  51.91 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.52 
 
 		 237 aa  221  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  48.52 
 
 		 237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  50.42 
 
 		 236 aa  219  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  45.11 
 
 		 234 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  49.58 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  46.81 
 
 		 237 aa  211  7e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  46.81 
 
 		 237 aa  211  7e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  47.48 
 
 		 259 aa  209  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  43.59 
 
 		 231 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  43.59 
 
 		 231 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  47.48 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.59 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  46.61 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  46.19 
 
 		 234 aa  208  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  44.68 
 
 		 234 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  44.3 
 
 		 234 aa  207  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  42.13 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2929  ABC transporter related  49.34 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  50.23 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  49.07 
 
 		 233 aa  202  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0935  ABC transporter related  50.46 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302332  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1417  ABC transporter related  50.46 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1297  ABC transporter related  50.92 
 
 		 234 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1395  ABC transporter related  50 
 
 		 234 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.858988 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  45.34 
 
 		 234 aa  201  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  45.99 
 
 		 237 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3486  ABC transporter related  47.68 
 
 		 238 aa  200  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265059  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1076  ABC transporter related  44.92 
 
 		 234 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000101179  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  40.25 
 
 		 236 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  44.92 
 
 		 237 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  44.69 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  44.92 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  44.4 
 
 		 252 aa  199  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  44.25 
 
 		 236 aa  199  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  43.59 
 
 		 232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  46.69 
 
 		 536 aa  199  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0084  ABC transporter related  45.53 
 
 		 251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  47.03 
 
 		 237 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.92 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  46.98 
 
 		 232 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3305  ABC transporter component  50.23 
 
 		 242 aa  196  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  42.13 
 
 		 236 aa  196  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  46.98 
 
 		 237 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  46.51 
 
 		 232 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  47.03 
 
 		 234 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1284  ABC transporter related  47.03 
 
 		 234 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  43.64 
 
 		 248 aa  195  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  45.58 
 
 		 232 aa  195  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1678  ABC transporter related  48.88 
 
 		 239 aa  194  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  43.59 
 
 		 240 aa  194  8.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3912  ABC transporter related  48.11 
 
 		 240 aa  194  9e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.478382  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1898  ABC transporter related  49.54 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  40.76 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  42.98 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3266  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.78 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3121  ABC transporter related  45.99 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0007  ABC transporter related  44.26 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678223 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  45.34 
 
 		 244 aa  192  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  45.34 
 
 		 233 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  44.92 
 
 		 235 aa  192  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  45.34 
 
 		 244 aa  192  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3554  ABC transporter related  46.61 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.256863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5955  ABC transporter related  43.83 
 
 		 247 aa  191  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0145925  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0545  ABC transporter related  46.61 
 
 		 234 aa  191  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756199 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  44.92 
 
 		 233 aa  191  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  44.92 
 
 		 233 aa  191  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  44.92 
 
 		 246 aa  191  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3519  ABC transporter-related protein  45.34 
 
 		 241 aa  191  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  43.46 
 
 		 234 aa  191  7e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  43.4 
 
 		 234 aa  191  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1281  ABC transporter-related protein  45.99 
 
 		 237 aa  191  7e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal  0.295015 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4561  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.84 
 
 		 234 aa  191  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.474601  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>