More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1793 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1793  ABC transporter related  100 
 
 		 235 aa  481  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  85.96 
 
 		 231 aa  414  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  82.98 
 
 		 231 aa  402  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1683  ABC transporter related  82.98 
 
 		 231 aa  402  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2574  ABC transporter related  82.98 
 
 		 231 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261355  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1841  ABC transporter related  82.98 
 
 		 231 aa  398  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2926  ABC transporter related  82.55 
 
 		 231 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2930  ABC transporter-related protein  84.68 
 
 		 231 aa  390  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.208893  normal  0.372931 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  79.15 
 
 		 231 aa  378  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  68.09 
 
 		 236 aa  344  6e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  67.66 
 
 		 239 aa  332  4e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1403  ABC transporter related  66.81 
 
 		 237 aa  330  8e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668018  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  67.66 
 
 		 237 aa  329  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  66.38 
 
 		 239 aa  328  4e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  66.38 
 
 		 239 aa  327  7e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1853  ABC transporter-related protein  62.55 
 
 		 235 aa  311  5.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  61.28 
 
 		 241 aa  301  5.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  62.55 
 
 		 231 aa  298  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4568  ABC transporter related  62.55 
 
 		 232 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  61.21 
 
 		 243 aa  293  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  61.28 
 
 		 232 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4171  ABC transporter related  60.85 
 
 		 231 aa  291  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  58.05 
 
 		 238 aa  283  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.36 
 
 		 238 aa  277  9e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.93 
 
 		 238 aa  274  9e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1604  ABC transporter related  53.62 
 
 		 237 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2814  ABC transporter related  55.32 
 
 		 237 aa  265  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0747835 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1321  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  54.47 
 
 		 237 aa  265  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  45.3 
 
 		 231 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  45.3 
 
 		 231 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1395  ABC transporter related  48.29 
 
 		 234 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.858988 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0935  ABC transporter related  48.29 
 
 		 234 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302332  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1417  ABC transporter related  48.29 
 
 		 234 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.3 
 
 		 231 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  45.11 
 
 		 231 aa  219  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1297  ABC transporter related  48.72 
 
 		 234 aa  218  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  45.96 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  45.96 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  46.19 
 
 		 233 aa  215  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  42.8 
 
 		 234 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  45.76 
 
 		 233 aa  214  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  45.76 
 
 		 233 aa  214  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  45.8 
 
 		 236 aa  214  9e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.34 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  46.64 
 
 		 236 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  47.03 
 
 		 237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  43.59 
 
 		 232 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  45.76 
 
 		 234 aa  211  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  44.92 
 
 		 237 aa  210  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  45.11 
 
 		 234 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  46.38 
 
 		 234 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  41.95 
 
 		 236 aa  210  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1898  ABC transporter related  46.78 
 
 		 234 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  45.76 
 
 		 235 aa  207  8e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  44.92 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4561  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  49.3 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.474601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  44.49 
 
 		 233 aa  205  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3554  ABC transporter related  44.07 
 
 		 234 aa  204  7e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.256863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  45.34 
 
 		 234 aa  204  9e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1284  ABC transporter related  43.64 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  44.26 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  43.64 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1336  ABC transporter related  48.29 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  42.98 
 
 		 234 aa  201  6e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.64 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  43.4 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  44.21 
 
 		 234 aa  198  6e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2027  ABC transporter related  43.7 
 
 		 234 aa  198  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  43.98 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  44.96 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0545  ABC transporter related  42.8 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756199 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0479  ABC transporter related protein  42.06 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000373417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3519  ABC transporter-related protein  44.26 
 
 		 241 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2157  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.41 
 
 		 232 aa  196  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.360084  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  41.45 
 
 		 236 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  41.45 
 
 		 236 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5343  ABC transporter related  41.03 
 
 		 235 aa  195  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6027  ABC transporter related  44.07 
 
 		 236 aa  195  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4111  ABC transporter related  43.84 
 
 		 248 aa  194  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2716  ABC transporter related  41.07 
 
 		 234 aa  194  8.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0337117  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3486  ABC transporter related  44.07 
 
 		 238 aa  194  9e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265059  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  42.74 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  39.83 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2496  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.97 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0491391  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  40.68 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  41.6 
 
 		 244 aa  192  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0419  ABC transporter-like protein  42.13 
 
 		 240 aa  191  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2651  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.81 
 
 		 234 aa  191  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  40.68 
 
 		 251 aa  191  7e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2742  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.18 
 
 		 232 aa  191  7e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64310  putative ABC transport ATP-binding subunit  42.01 
 
 		 232 aa  191  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.349847  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4889  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 		 232 aa  191  8e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  40.68 
 
 		 237 aa  191  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2189  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.17 
 
 		 230 aa  190  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.113026 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  40.76 
 
 		 252 aa  190  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  41.95 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  41.7 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5583  urea ABC transporter ATP-binding protein UrtE  42.01 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0412532  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  39.83 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  41.05 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>