More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0186 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  100 
 
 		 244 aa  501  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  87.45 
 
 		 252 aa  434  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  81.25 
 
 		 536 aa  397  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  75 
 
 		 237 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  73.75 
 
 		 237 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  71.01 
 
 		 259 aa  345  4e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  71.43 
 
 		 237 aa  344  6e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  70.59 
 
 		 259 aa  343  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  61.18 
 
 		 234 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  61.18 
 
 		 234 aa  302  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  61.76 
 
 		 236 aa  291  8e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  58.23 
 
 		 234 aa  289  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  60.83 
 
 		 236 aa  288  8e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  47.26 
 
 		 236 aa  237  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  48.12 
 
 		 237 aa  230  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1177  ABC transporter related  49.37 
 
 		 236 aa  221  7e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  44.54 
 
 		 232 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  48.31 
 
 		 234 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  46.96 
 
 		 236 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  48.03 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  46.09 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  46.09 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  45.68 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  46.61 
 
 		 233 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  47.9 
 
 		 234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  47.06 
 
 		 234 aa  211  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  46.64 
 
 		 241 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  44.86 
 
 		 254 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  44.96 
 
 		 251 aa  211  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  46.22 
 
 		 244 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  45.61 
 
 		 235 aa  209  5e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  45.76 
 
 		 243 aa  208  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1076  ABC transporter related  46.64 
 
 		 234 aa  208  7e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000101179  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  45.8 
 
 		 248 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0056  ABC transporter related  45.38 
 
 		 246 aa  208  8e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  45.8 
 
 		 244 aa  207  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  44.12 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  44.12 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  44.44 
 
 		 236 aa  205  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  44.49 
 
 		 237 aa  205  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  44.96 
 
 		 246 aa  204  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  45.76 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2495  ABC transporter related  46.22 
 
 		 238 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4568  ABC transporter related  43.7 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  45.8 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  42.02 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  43.28 
 
 		 237 aa  202  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.92 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  44.07 
 
 		 233 aa  202  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  43.93 
 
 		 232 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  44.35 
 
 		 248 aa  201  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  43.67 
 
 		 239 aa  201  7e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  42.21 
 
 		 233 aa  201  7e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  45.76 
 
 		 234 aa  201  7e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4171  ABC transporter related  43.7 
 
 		 231 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  46.19 
 
 		 246 aa  201  8e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  46.19 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  41.77 
 
 		 231 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  46.61 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  43.28 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3554  ABC transporter related  43.28 
 
 		 234 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.256863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  45.34 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0614  ABC transporter related  46.41 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  43.72 
 
 		 240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6326  ABC transporter related  44.35 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  44.21 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  44.81 
 
 		 238 aa  199  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1403  ABC transporter related  44.35 
 
 		 237 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668018  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  40.5 
 
 		 240 aa  199  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  43.1 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  45.38 
 
 		 484 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5861  ABC transporter related  44.58 
 
 		 250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  43.1 
 
 		 232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3755  ABC transporter ATP-binding protein  45.57 
 
 		 237 aa  199  5e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1284  ABC transporter related  43.28 
 
 		 234 aa  198  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  43.28 
 
 		 234 aa  198  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0007  ABC transporter related  43.46 
 
 		 234 aa  199  5e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315079  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  45.34 
 
 		 235 aa  198  5e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  43.1 
 
 		 232 aa  198  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  43.46 
 
 		 237 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  43.64 
 
 		 233 aa  198  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  43.28 
 
 		 231 aa  198  7e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  44.35 
 
 		 259 aa  198  7e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.92 
 
 		 234 aa  197  9e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  42.86 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  44.12 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  45.34 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2929  ABC transporter related  45.22 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0955  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF, putative  42.92 
 
 		 241 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3330  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.15 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  42.44 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  44.92 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0545  ABC transporter related  42.26 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756199 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  40.17 
 
 		 237 aa  196  3e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  43.28 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0018  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.98 
 
 		 252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3376  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.69 
 
 		 251 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0199  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding subunit  45.69 
 
 		 251 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24485  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0102  ABC transporter related  45.54 
 
 		 251 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>