More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0761 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  100 
 
 		 237 aa  472  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  74.89 
 
 		 234 aa  345  3e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  67.98 
 
 		 234 aa  332  4e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  67.54 
 
 		 233 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  67.54 
 
 		 233 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  65.81 
 
 		 237 aa  315  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  65.81 
 
 		 237 aa  315  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  66.23 
 
 		 234 aa  311  5.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  64.47 
 
 		 235 aa  309  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  64.53 
 
 		 237 aa  309  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  64.47 
 
 		 233 aa  304  7e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  64.04 
 
 		 233 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  64.04 
 
 		 233 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  62.17 
 
 		 231 aa  298  5e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  62.17 
 
 		 231 aa  298  5e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.74 
 
 		 231 aa  296  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6027  ABC transporter related  64.53 
 
 		 236 aa  290  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  57.39 
 
 		 231 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  53.25 
 
 		 232 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  51.08 
 
 		 236 aa  242  3e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  50.65 
 
 		 236 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  49.53 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  49.36 
 
 		 237 aa  226  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  51.07 
 
 		 234 aa  226  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  49.36 
 
 		 233 aa  224  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  49.58 
 
 		 239 aa  224  9e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  47.84 
 
 		 232 aa  222  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  50 
 
 		 233 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  49.14 
 
 		 235 aa  220  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  49.34 
 
 		 232 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  50 
 
 		 238 aa  219  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  49.56 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1177  ABC transporter related  48.95 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  47.19 
 
 		 236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  47.03 
 
 		 237 aa  215  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  48.05 
 
 		 234 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  45.96 
 
 		 236 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  48.72 
 
 		 241 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  49.14 
 
 		 235 aa  214  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  46.75 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  46.55 
 
 		 233 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1678  ABC transporter related  48.7 
 
 		 239 aa  211  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  47.41 
 
 		 234 aa  211  5.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  47.41 
 
 		 235 aa  211  7e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  45.11 
 
 		 236 aa  211  7e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  45 
 
 		 240 aa  211  7.999999999999999e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  48.52 
 
 		 259 aa  210  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  45.96 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  48.51 
 
 		 236 aa  211  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  46.96 
 
 		 234 aa  209  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  48.31 
 
 		 238 aa  209  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  48.03 
 
 		 244 aa  209  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  47.21 
 
 		 234 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  48.03 
 
 		 244 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  46.29 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.26 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  46.78 
 
 		 248 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  47.68 
 
 		 259 aa  208  5e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  45.96 
 
 		 248 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2929  ABC transporter related  48.47 
 
 		 230 aa  208  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  48.26 
 
 		 251 aa  208  6e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  44.64 
 
 		 249 aa  208  7e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  48.68 
 
 		 243 aa  207  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5861  ABC transporter related  46.84 
 
 		 250 aa  207  8e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  48.73 
 
 		 237 aa  207  8e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  45.96 
 
 		 248 aa  207  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0056  ABC transporter related  47.62 
 
 		 246 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  45.53 
 
 		 236 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1385  ABC transporter related  47.03 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.692316  normal  0.0515657 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  47.6 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  47.41 
 
 		 246 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  49.32 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  45.11 
 
 		 248 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2467  ABC transporter related  46.84 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.766044  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  44.4 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  46.52 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1400  ABC transporter related  47.88 
 
 		 251 aa  205  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  48.87 
 
 		 232 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  46.88 
 
 		 237 aa  205  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  43.57 
 
 		 247 aa  205  6e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1515  ABC transporter related  48.52 
 
 		 251 aa  204  7e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.274382  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5955  ABC transporter related  46.35 
 
 		 247 aa  204  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0145925  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  45.96 
 
 		 236 aa  204  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3121  ABC transporter related  45.57 
 
 		 237 aa  204  9e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  46.78 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  45.57 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  47.96 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  46.93 
 
 		 237 aa  202  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  44.02 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  47.41 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1076  ABC transporter related  46.29 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000101179  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.12 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1841  ABC transporter related  44.59 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3305  ABC transporter component  49.76 
 
 		 242 aa  202  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.83 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.88 
 
 		 247 aa  202  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  45.69 
 
 		 234 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3486  ABC transporter related  49.77 
 
 		 238 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265059  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  44.73 
 
 		 238 aa  201  6e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  44.73 
 
 		 238 aa  201  6e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>